版本 2026-1
小分子药物研发
平台环境
Maestro 图形用户界面
- 重新设计的“曲面管理器”——借助现代化的持久化界面，可轻松控制复杂的可视化效果，该界面支持对曲面样式、颜色和透明度进行实时、非模态编辑
- 持久化测量值——几何测量值现可随条目一同保存，从而能够对多个构象和状态进行不间断的结构比较
- 独立密度图导入——通过直接、独立的密度图导入功能，加速冷冻电镜和晶体学工作流程
- Maestro 助手模式（公开测试版）——一款具备情境感知能力的AI伙伴，可智能地在“询问”、“执行”和“自动”模式之间切换，从而无缝衔接文档查阅与直接操作
结合位点 & 结构分析
混合溶剂分子动力学（MxMD）
- 为命令行 MxMD 驱动程序添加了支持，可无缝执行所有模拟，并编译来自 MxMD/SiteMap 联合隐蔽口袋识别工作流的结果
WaterMap
- WaterMap 现已支持使用 OPLS_2005 力场和 TIP4P 水模型
苗头化合物 身份识别与虚拟筛选
分子对接
- 利用全新的分子对接 报告来理解、优化和排查原生重新停靠实验，从而最大限度地提升分子对接 的性能
先导化合物 优化
FEP+
- GraphDB/Web 服务可选择仅下载主 FMP 文件，而不下载 FMPdb，从而缩短分析结果所需的时间
- FEP+ 工作流现已支持在经济实惠的可抢占节点上执行
- 使用 2D Sketcher 定义 CoreSMARTS ，用于FEP+
- FEP+ 统计分析中对分类检测数据的处理得到改进
FEP+ 协议生成器
- 在实验方案中采集三个不同浓度的盐溶液样本优化
- 协议中自动放置膜的示例优化
FEP+ 姿势生成器
- 使用FEP+ Pose Builder自动生成准确且考虑碰撞检测的、符合FEP规范的构象：通过专为无偏选择和稳健原子映射设计的自动化工作流，更快地生成高质量的配体对齐结果，从而大规模运行FEP+ 。
- LiveDesign FEP+ Pose Builder 协议现已支持为闭环 FEP 计算生成 FMP 文件
量子力学(QM)
- 在 AutoTS 中通过命令行调用 xTB 以及包括 QRNN、MPNICE 和 UMA 在内的 MLFF，以缩短计算时间
- 通过优化所有多线程Jaguar 批处理计算的CPU核心分配，加快批处理计算速度
光谱学
- 针对13C核磁共振光谱中C-Br和C-I键的新修正
从头设计
AutoDesigner – R-group Design
- 通过全新的 AutoDesigner R-基团设计面板探索庞大的化学空间，以确定最佳的 R-基团——现在只需设置功能标志即可使用该面板
- 为 AutoDesigner R-组设计方案新增了可选的 QED 评分（药物样性定量评估）
AutoDesigner – 核心设计
- 通过设置功能标志，即可使用全新的 AutoDesigner 核心设计面板，探索庞大的化学空间，以确定最佳的核心替代方案
- 为 AutoDesigner Core 设计方案新增了可选的 QED 评分（药物样性定量评估）
教育内容
- 推出一种全新的、更具互动性的教程体验，让用户能够直接在教程中直观地点击浏览工作流的各个步骤。目前，这种方法正在两个教程中进行试点。
- 更新后的教程：基于结构的虚拟筛选 ，使用Glide
- 更新版教程：结构制备与可视化入门
- 关于抗体 建模的学习内容已全面更新：
“BioLuminate 中的抗体 可视化与建模”教程已被一套新的教程系列所取代，该系列与其他实用资源一起按学习路径进行了组织。 - 新教程：生成三元复合结构，以实现靶向蛋白降解剂的有针对性的设计
- 更新版教程：使用……设计BACE1抑制剂自由能微扰
- 新版快速参考指南：力场构建器
- 新版快速参考表：配体相互作用图
生物制剂药物研发
- “大分子构象过滤器”发布——从生成的众多可能性中，为大分子复合物筛选出最合理或最相关的结构模型
- 新增蛋白质描述符——ASPmax——已将ASPmax（最大平均表面性质）添加到我们的描述符集。该描述符用于预测蛋白质在疏水相互作用色谱（HIC）柱中的保留时间以及聚集风险
- 搜索和筛选非标准残基——支持基于“名称”、“代码”和“描述”列中的标签，对非标准残基进行基于文本的搜索和筛选
- MMGBSA 残基扫描面板中的残基查找功能——快速搜索并定位待突变的残基
- 残留物扫描结果的分类——根据能量评分阈值，通过颜色编码对残留物扫描结果进行分类，以标识阳性、中性或阴性的突变变体
材料科学
Quantum ESPRESSO 的图形用户界面
产品：Quantum ESPRESSO (QE) 接口
- 缺陷形成能：用于分析晶体中点缺陷的工作流程解决方案
- Phonon DOS Viewer 中设置频率截止值/谐波阈值的选项
- 支持 TB09 密度泛函（命令行）
- 对 rVV10-SCAN 密度泛函的支持（命令行）
- 在 QE BOMD 模拟中支持 NpT 集合（命令行）
- (+MATSCI_NEB_MLFF) NEB 中的 MLFF 积分
MS Surface
产品：MS SurfChem
- 脱附计数：WAM将公布吸附能计算结果
Microkinetics
产品：MS Microkinetics
- 查看选择性 选择性和控制程度的选项
- 加载/保存存档的MKM输出结果的选项
- 将反应视图导出为图像（PNG）文件的选项
- 各阶段的结果可在分析面板中查看
光电子学 遗传学优化
产品：Genetic优化 (GA)
- 支持根据 ML Property Prediction 中的模型设置 `靶点 ` 属性
主动学习光电子学
产品：主动学习光电子学
- 设置靶点 值不参与优化的选项
反应性
产品：MS Reactivity
- 纳米反应器：可为驱动程序和子作业指定不同的主机
- 纳米反应器：(+NANOREACTOR_AUTOTS) 通过 AutoTS 对基本反应网络计算进行自动过渡态搜索
- 纳米反应器：可选择跳过生成轨迹文件
- 纳米反应器：用户可控制轨迹帧之间的间隔时间
- 反应网络分析器：使用 UMA（MLFF）优化构象几何结构的选项
- 反应网络分析器：为反应物分配化学计量系数的选项
通过分子动力学模拟进行传输计算
产品：MS Transport
- 离子电导率：对MLFF的支持
介电性能
产品：MS 介电材料
- 复介电常数：对多组分体系的支持
粗粒化（CG）分子动力学 (MD)
产品：MS CG
- CG FF Builder：改进了非同构残基的检测和映射功能
- CG FF Builder：基于化学背景的自动粒子命名方案
- CG FF 作业：对于包含大量粒子类型的模型，性能提升最高可达 15 倍
- 粗粒度映射：映射过程中保留残基编号和名称
- 粗粒度映射：可选择导入先前使用过的SMARTS 模式
- 通过优化截止裕度，将DPD仿真速度提升高达30%
复合双层构建器
产品：MS Complex 双层构建剂
- 复合双层：(+COMPLEX_BILAYER_BUILDER_EXTENDED_LIPID_LIB) 默认脂质扩展列表
- 复杂双层膜：将水填充深度的上限提高至 5000 Å
- 复杂双层结构：支持自定义训练的OPLS
- 膜分析：(+MEMBRANE_ANALYSIS_PREP_FOR_FEP) 支持生成与 FEP 计算兼容的 PoseViewer 格式文件
- 膜分析：支持应用多种叶片定位算法
材料信息学
产品：MS Informatics
- 机器学习（ML） 属性：改进的面板界面，用于模型选择
- MD描述符：用户可控制模拟 系统规模（最大原子数）
- MD 描述符：支持将路径分配给结构文件的配方输入
- MLFF 计算：设置原子位置约束的选项
- MLFF 计算：支持在 GPU 节点上运行
配方 ML
产品：MS Formulation ML
- 机器学习建模：“学习到的指纹”作为特征空间的一种新选择
- 公式 ML：用于处理（“插补”）训练集数据（其中部分描述符缺失）的高级选项
- Formulation ML：改进的对称图用户界面
- Formulation ML：支持利用包含缺失化学信息（SMILES ）的训练数据集构建机器学习（ML） 模型
- Formulation ML：靶点 属性显示在“性能”选项卡中
- 公式化机器学习：用户对特征间相关性阈值的控制
- 配方 ML优化 ：支持自定义成分描述符
- Formulation ML优化 ：支持多CPU并行化
- 配方 ML优化 ：可选使用遗传算法进行配方设计优化
分层设备机器学习
产品：MS 分层设备 ML
- OLED器件机器学习：用户对特征间相关阈值的控制
- OLED 设备 ML：在“性能”选项卡中显示的靶点 属性
MSMaestro 构建程序和工具
- 吸附枚举：WAM 将发布“吸附位点查找器”/“吸附能”的相关结果
- 吸附位点查找器：WAM 将结果转换为吸附能
- 吸附枚举：改进“项目表”中输出结构的组织方式
- 吸附位点查找器：使用 MLFF 时，任务速度最高可提升 200 倍
- 清理结构：对 MLFF 的支持
- 无序系统：为组件定义残基名称的选项
- 支持将 *.vis 文件转换为 *.cub 格式文件（命令行）
- Polymer：从 CSV 格式文件导入耦合概率
- 多糖：(+POLYSACCHARIDE_BUILDER) 用于线性链多糖的简化建模解决方案
- 单复合物：桥联配体的更新列表
- Query Bonds：分子晶体的多面体显示
- 查询键：搜索和修改非成键原子对
经典力学
- Droplet：支持使用预组装的 Droplet 模型
- Droplet：支持计算水合表面接触角
- 弹性常数: 对MLFF的支持
- (+ALLOW_OLD_FORCEFIELD_PARAMETERS) 支持使用 OPLS4/OPLS5 参数运行分子动力学模拟，并保持向后兼容性（2025-4 及更早版本）
- MD 多级：面板中显示的输入结构采用 FF 类型
- 应力应变：对MLFF的支持
- 应力应变：可选使用前一应变步骤中的速度值
- 表面张力：采用块平均方案改进的分析方法
- Tg：(+THERMOPHYSICAL_PROPERTIES_MLFF) 对 MLFF 的支持
- 伞式采样：用于在脂质和表面活性剂双层附近对小分子运行伞式采样算法的工作流程解决方案
- 伞式采样：显示窗口之间的重叠量
- 粘度：调整了MLFF模拟的默认时间步长（0.5 fs）
量子力学(QM)
- 吸附能：使用 MLFF 对结构进行预优化的选项
- 吸附能：利用MLFF支持原子位置约束
- Crest：(+MATSCI_CREST_QCG) CREST 量子簇生长工具
- QM 多阶：可从理论列表中选择 GFN2-xTB
- 光电子薄膜的性质：按分子种类显示的折射率比
- 反应网络查看器：用于查看由“反应网络分析器”和“纳米反应器”生成的网络的综合分析查看器图形用户界面
教育内容
- 新教程：通过微动力学建模研究催化选择性 反应
- 更新后的教程：缺陷形成能计算
- 更新后的教程：纳米反应器
- 快速参考表：清理建筑物
教育内容
生命科学
- 推出一种全新的、更具互动性的教程体验，让用户能够直接在教程中直观地点击浏览工作流的各个步骤。目前，这种方法正在两个教程中进行试点。
- 更新后的教程：基于结构的虚拟筛选 ，使用Glide
- 更新版教程：结构制备与可视化入门
- 关于抗体 建模的学习内容已全面更新：
“BioLuminate 中的抗体 可视化与建模”教程已被一套新的教程系列所取代，该系列与其他实用资源一起按学习路径进行了组织。 - 新教程：生成三元复合结构，以实现靶向蛋白降解剂的有针对性的设计
- 更新版教程：使用……设计BACE1抑制剂自由能微扰
- 新版快速参考指南：力场构建器
- 新版快速参考表：配体相互作用图
材料科学
- 新教程：通过微动力学建模研究催化选择性 反应
- 更新后的教程：缺陷形成能计算
- 更新后的教程：纳米反应器
- 快速参考表：清理建筑物
LiveDesign
2026-1 版的新功能
- 生物制品
- 利用天然单体设计具有点突变的新型生物制剂
- 通过API 访问上传自定义单体，并在序列查看器中查看这些单体
- 通过从预填好的下拉菜单中选择注释和编号方案，在生物制品实体的注释区域内搜索子序列
- 现在，用户可以在序列查看器中根据残基属性为其着色，前提是所使用的模型能够以指定格式输出每个残基的属性（可选）及其与配色方案的映射关系，或者使用包含该输出内容的任何 Freeform 列。
- “高级搜索”面板中“类型”下拉菜单里的“生物制剂”和“仿制药”选项已合并为“生物制剂/其他”
- 在序列查看器中查看分支序列和环肽
- LiveDesign AI 助手：通过 AI 助手与LiveDesign 进行交互，以创建“自由格式”和“公式”列，创建和更新着色规则，在助手内执行数据分析并绘制数据图表，以及即时查找帮助文档。请注意，此功能需要安装LiveDesign ML 插件
- 项目仪表盘
- 使用新的“活动”部分，查看新添加的检测数据和评论的项目活动流
- 项目仪表盘中显示的实体计数统计数据和最近添加的实体，现在将包含该项目中所有可搜索的实体（例如，导入到无限制项目中的化合物），而不是仅包含专门导入到该项目中的实体。
- 模型：将 3D 柱体作为输入的“柱体作为参数”模型，现在可以访问“收藏的姿势”以及 LiveReport 中显示的姿势顺序。
- 用户体验改进
- 从您的 LiveReport 中过滤掉未运行、失败和待处理的模型单元格
- 无需先打开面板，即可将复合结构从主电子表格直接拖放到“设计”、“搜索”或“高级搜索”面板中
- 通过鼠标中键单击 LiveReport 标签页来关闭它们
- 3D 可视化工具：为选定的原子/残基/链应用立体标签、元素标签和原子序数标签
已修复的内容
- 以前，那些将“批次注册日期”列作为输入的公式无法正常计算，并会在 LiveReport 上显示一条红色的错误条。现在，这些公式可以正确计算，且不会引发错误。
- 主电子表格单元格中的图标（用于在3D可视化器或Maestro 中查看姿势）此前在调整单元格大小时会消失，现在则会保持可见
- 向矩阵控件添加“点击运行”模型列会导致该控件崩溃且无法显示数据，而现在“点击运行”模型已在矩阵控件中正确显示
- 当 if() 语句中使用的实验检测单元格包含多个值，且其中一个值为空时，使用 if() 语句的公式将无法正确计算。现在，这些公式可以正确计算了。
- “创建新布局”对话框此前未显示“复制现有布局”选项，现已正确显示该选项。
- 如果使用“编辑 LiveReport 对话框”编辑 LiveReport 的标题，会导致该 LiveReport 被移动到项目主文件夹；现在，使用该对话框编辑 LiveReport 时，该 LiveReport 不会被移动到其他文件夹
- “配置矩阵控件”对话框中的格式设置选项按钮此前存在重叠现象，导致无法访问某些格式设置选项；现已解决该问题，按钮不再重叠
- 实验检测数据原本会在电子表格单元格中的实验值下方显示虚线，但现在不再显示虚线了
- aggregateMax() 和 aggregateMin() 公式函数现已支持日期列
- 现在，在序列查看器中，多链或支链肽的标识符中会包含递增的肽编号，从而能够准确识别这些肽。
- 当使用采用不受支持编号方案的TCR时，序列查看器现在会显示一条提示信息，并建议在序列查看器中将TCR的编号方案更改为受支持的方案。
- 当3D可视化器从序列查看器中进行深入查看时，在序列查看器中选择另一个实体并不会重置序列查看器和3D可视化器中现有的残基选择。
- 那些将另一个模型的图像列作为输入的参数化模型此前无法计算结果，现在已能正确计算
- 重新计算已删除的模型申报表会导致单元格持续闪烁，而现在该单元格将正确显示“失败”提示
- 当模型返回类型为“其他”的 3D 输出时，其他参数化模型无法访问该 3D 输出，而现在可以访问了
- LDClient：get_models_by_name 方法现新增了一个选项，用于忽略已归档的模型
版本 2025-4