结构预测 &靶点 功能启用
解锁您的蛋白质靶点 ,实现高精度、基于结构的设计
结构生物学正经历一场革命,得益于冷冻电镜(cryo-EM)以及AlphaFold等技术的进步,如今各蛋白类别的可用结构数量正迅速增加。然而,若要在基于物理理论 模拟中使用这些模型(包括分子对接 和自由能微扰 ),仍需进行大量的精修和精确的配体定位。
Schrödinger该软件套件提供了用于蛋白质模型精修、配体定位以及结合位点 分析的全面解决方案,可帮助您发掘更多适用于基于结构的设计的目标。
能力
基于多种起始条件生成可直接用于设计的结构的解决方案
同时启用靶点内和靶点外设计,以实现严谨的基于结构的设计
高分辨率结构
制备高分辨率X射线晶体或冷冻电镜结构,用于基于结构的设计
快速、可靠地构建适用于基于物理理论 模拟的高质量全原子蛋白质模型
以接近实验精度的水平预测新型配体在现有结构中的结合模式
无需为每个系列分别获取实验结构,即可了解竞争物的结合模式
低分辨率结构
优化和验证低分辨率X射线晶体或冷冻电镜结构
纠正常见的结构问题,构建可靠的全原子蛋白质模型
利用业界领先的力场,将配体对接到密度不明确的区域(例如冷冻电镜结构中),以消除不确定性
放置辅因子和溶剂,将低分辨率模型转换为完整的全原子模型
无结构
根据同源蛋白质序列构建并验证结构,或利用现有的AlphaFold结构
利用基因组数据的力量,轻松构建与药物研发相关的靶点同源模型
将配体可靠且准确地对接到基于模板的同源模型或AlphaFold结构中
利用已知的SAR数据和高度精确的计算机模拟结合亲和力 检测方法,对结构模型进行定量验证
案例研究与网络研讨会
了解Schrödinger 技术如何被用于解决现实世界中的研究难题。
特色服务
靶点 赋能服务
让我们帮助您准备您感兴趣的蛋白质靶点 ,以便进行前瞻性的FEP+ 自由能计算。您可以基于已知的结构-活性关系(SAR),从实验X射线晶体结构、不完整的冷冻电镜(cryoEM)结构或AlphaFold结构入手。Schrödinger 的科学家们凭借我们独特的技术和专业知识,对蛋白质-配体复合物进行建模和验证,以支持高度预测性的基于结构的设计方法。
文档与教程
了解常见问题的解答,并掌握使用Schrödinger软件的最佳实践。
主要产品
进一步了解可用于推进您研究项目的关键计算技术。
出版物
浏览采用Schrödinger 技术、发表在相关应用领域的经同行评审的出版物列表。