作为公司范围内的休整与充电计划的一部分,Schrödinger 全球所有办事处将于8月17日至21日当周暂停办公。在此期间,我们的响应将有所限制,敬请谅解。Scientific和技术支持 团队成员仅会处理紧急支持问题。

结构预测 &靶点 功能启用

把握结构生物学革命的机遇

结构预测 &靶点 功能启用

解锁您的蛋白质靶点 ,实现高精度、基于结构的设计

结构生物学正经历一场革命,得益于冷冻电镜(cryo-EM)以及AlphaFold等技术的进步,如今各蛋白类别的可用结构数量正迅速增加。然而,若要在基于物理理论 模拟中使用这些模型(包括分子对接 和自由能微扰 ),仍需进行大量的精修和精确的配体定位。

Schrödinger该软件套件提供了用于蛋白质模型精修、配体定位以及结合位点 分析的全面解决方案,可帮助您发掘更多适用于基于结构的设计的目标。

能力

基于多种起始条件生成可直接用于设计的结构的解决方案

同时启用靶点内和靶点外设计,以实现严谨的基于结构的设计

高分辨率结构

制备高分辨率X射线晶体或冷冻电镜结构,用于基于结构的设计

快速、可靠地构建适用于基于物理理论 模拟的高质量全原子蛋白质模型
以接近实验精度的水平预测新型配体在现有结构中的结合模式
无需为每个系列分别获取实验结构,即可了解竞争物的结合模式

低分辨率结构

优化和验证低分辨率X射线晶体或冷冻电镜结构

纠正常见的结构问题,构建可靠的全原子蛋白质模型
利用业界领先的力场,将配体对接到密度不明确的区域(例如冷冻电镜结构中),以消除不确定性
放置辅因子和溶剂,将低分辨率模型转换为完整的全原子模型

无结构

根据同源蛋白质序列构建并验证结构,或利用现有的AlphaFold结构

利用基因组数据的力量,轻松构建与药物研发相关的靶点同源模型
将配体可靠且准确地对接到基于模板的同源模型或AlphaFold结构中
利用已知的SAR数据和高度精确的计算机模拟结合亲和力 检测方法,对结构模型进行定量验证

鉴定并评估蛋白质结合位点的成药性

结合位点 识别

快速、准确地识别并排序蛋白质的可能结合位点

神秘口袋探索

利用基于元动力学的加速采样工作流程,对混合溶剂模拟进行分析,以阐明隐蔽的结合口袋并揭示结合热点

水合位点分析

通过预测水合位点的位置和热力学势,探索配体设计的新可能性,在结合位点

案例研究与网络研讨会

了解Schrödinger 技术如何被用于解决现实世界中的研究难题。

生命科学 网络研讨会

建模服务:通往Schrödinger 平台的高效切入点

欢迎加入我们,了解Schrödinger的建模服务如何为您的项目提供一条快速通道,助您充分释放我们平台的变革力量。

生命科学 网络研讨会

建模服务:进入Schrödinger 平台录制功能的高效切入点

欢迎加入我们,了解Schrödinger的建模服务如何为您的项目提供一条快速通道,助您充分释放我们平台的变革力量。

生命科学 网络研讨会

Schrödinger 数字药物研发研讨会:迈向临床——计算化学带来的药物研发流程变革——第22届

2026年2月18日 |Schrödinger 数字药物研发研讨会 22 |预测性毒理学 解决方案:基于结构的可操作性见解,助力尽早消除毒性风险

生命科学 网络研讨会

Schrödinger 数字药物研发研讨会:迈向临床——计算化学带来的药物研发流程变革——第21届

基于MD模拟的化合物膜透过性预测

生命科学 网络研讨会

预测性毒理学 解决方案:基于结构的可操作性洞察,助您尽早消除毒性风险

欢迎加入我们,了解我们的全新预测性毒理学 解决方案如何从根本上改变设计流程。

生命科学 网络研讨会

第六届 EFMC² “Tandem Talks”

Schrödinger 非常高兴能参加将于10月9日举行的第六届EFMC²“Tandem Talks”线上活动。

生命科学 网络研讨会

基于结构的发现:用于每月一次疟疾化学预防的高活性二氢奥罗酸脱氢酶抑制剂

在本期网络研讨会上,Schrödinger 的药物化学家兼项目负责人聂哲,以及达拉斯德克萨斯大学西南医学中心教授玛格丽特·菲利普斯,通过对话分享了各自团队如何通力合作,共同致力于发现新型DHODH抑制剂。

生命科学 网络研讨会

存档发布:利用增强采样技术高效预测药物-靶点 的停留时间

人们越来越认识到,配体结合的动力学在药物研发中日益重要。

生命科学 网络研讨会

Schrödinger 数字药物研发研讨会:超越小分子结合的自由能计算:预测抗体 亲和力 、pH 传感、受体功能响应等

在本演讲中,我们将介绍通过FEP+方法的最新扩展,成功实现小分子结合以外的高附加值应用的案例。

生命科学 网络研讨会

受体功能响应的精确建模:GPCRs及其延伸

在本场网络研讨会中,我们将介绍一种易于处理且计算效率高的协议,该协议能够准确、可靠地预测受体对配体结合的功能响应。

特色服务

靶点 赋能服务

让我们帮助您准备您感兴趣的蛋白质靶点 ,以便进行前瞻性的FEP+ 自由能计算。您可以基于已知的结构-活性关系(SAR),从实验X射线晶体结构、不完整的冷冻电镜(cryoEM)结构或AlphaFold结构入手。Schrödinger 的科学家们凭借我们独特的技术和专业知识,对蛋白质-配体复合物进行建模和验证,以支持高度预测性的基于结构的设计方法。

文档与教程

了解常见问题的解答,并掌握使用Schrödinger软件的最佳实践。

生命科学 教程

蛋白质表征:第2部分

通过进行并分析分子动力学 (MD) 模拟,探讨牛β-乳球蛋白在不同pH值条件下的特性。

生命科学 教程

使用……进行元动力学模拟的入门指南Desmond

对构象 采样或映射势能面进行元动力学模拟。

生命科学 教程

利用大分子姿态过滤和MM-GBSA残基扫描对蛋白质-蛋白质对接姿态进行过滤和验证

确定蛋白质-蛋白质分子对接 中的哪些构象符合关于蛋白质-蛋白质界面的实验观察结果。

生命科学 教程

使用 SiteMap 分析核酸的结合位点

利用SiteMap识别和评估核酸结构中的结合位点。

生命科学 教程

核酸结构的制备

核酸结构中相互作用的可视化与分析。

生命科学 文档

WaterMap

采用显式水分子模型进行了高效收敛的分子动力学模拟,并对所得轨迹进行分析以聚类水合位点。

生命科学 文档

网站地图

鉴定结合位点(包括别构结合位点和蛋白质-蛋白质界面),并评估其成药性。

生命科学 文档

PrimeX

一款用于辅助蛋白质晶体结构优化 的高级工具,生成的精确结构比其他蛋白质精修程序生成的结构更适合用于计算化学应用。

生命科学 文档

Prime

一款完全集成式 蛋白结构预测 解决方案,将同源建模 和折叠识别功能整合到单一解决方案中。

生命科学 文档

IFD-MD

基于GPU加速的受体-配体结合构象预测。

主要产品

进一步了解可用于推进您研究项目的关键计算技术。

Maestro

专为您的分子发现而设计的完整建模环境

IFD-MD

针对新型化学物质,对靶点和非靶点进行精确的配体结合模式预测

FEP+

用于药物发现的高性能自由能计算

Glide

业界领先的配体-受体分子对接 解决方案

OPLS4 和 OPLS5 力场

一个用于精确分子模拟的现代化、综合性力场

Prime

一种用于精确测定蛋白质的强大且创新的解决方案结构预测

网站地图

快速、准确且直观的结合位点 识别

WaterMap

一种基于结构的、最先进的方法,用于评估水对配体结合位点的溶剂化能优化

Desmond

高性能的分子动力学 (MD) (MD)引擎,具备高可扩展性、高吞吐量和科学精度

出版物

浏览采用Schrödinger 技术、发表在相关应用领域的经同行评审的出版物列表。

生命科学 出版物

利用人工智能重新定义可成药靶点

生命科学 出版物

ToxBench:一个基于AB-FEP计算标签的人类雌激素受体α结合亲和力 预测基准

生命科学 出版物

在GPCR的计算基于结构的药物设计 中,人工智能与物理学相融合

生命科学 出版物

在药物发现中利用蛋白质构象的热力学原理

生命科学 出版物

与抗惊厥药结合的突触小泡蛋白2A和2B的结构

生命科学 出版物

基于吡咯的PfPKG抑制剂系列作为抗疟药的结构-活性关系

生命科学 出版物

利用AlphaFold和实验结构,通过诱导契合法预测GPCR复合物的结构和结合亲和力分子对接 以及自由能微扰

生命科学 出版物

α-锥毒素LvIA第11位点的基本残基通过静电机制影响α3β2型和α3β4型烟碱受体之间的选择性 亚型

生命科学 出版物

基于结构的蛋白质-蛋白质相互作用位点的评估及其成药性分类

生命科学 出版物

生长抑素受体在配体识别方面的可塑性

满足您组织需求的软件和服务

软件平台

利用一个功能全面且易于使用的平台,部署用于分子建模 、设计和协作的数字化药物发现工作流。

模特服务

利用Schrödinger的大规模计算专业知识和技术,推动您的项目顺利通过药物发现过程中的关键阶段。

支持与培训

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