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Desmond 用于材料科学

高性能的分子动力学 (MD) (MD)引擎,具备高可扩展性、高吞吐量和科学精度

通过快速、准确的方法,理解并预测材料的关键性能分子动力学 (MD)

Desmond 这是一款基于GPU的高性能分子动力学(分子动力学 (MD) , MD)引擎,用于预测材料的体相性质,例如热物理性质、弹性常数 、应力/应变关系、扩散系数、粘度、持久长度、溶剂化自由能等。Desmond 还能表征涉及非平衡系统、界面或自组装结构的复杂系统中的结构与性质。

全面的分子动力学 (MD) 功能

卓越的表现

在配备常规和高端网络的通用 Linux 集群上实现卓越的吞吐量。与单核 CPU 相比,通用 GPU(GPGPU)的计算速度可提升 100 倍。

卓越的精度

该系统在设计时着重考虑了数值精度、稳定性和严谨性。能够对纳米至微米尺度的宏观特征进行模拟 ,时间尺度覆盖皮秒至微秒。

值得信赖的能源技术

为原子级和粗粒化力场模型的能量与力计算提供了一个强大的框架。兼容生物分子和凝聚态物理研究中常用的化学体系。

逼真的模拟

使用立方、正交、截头八面体、菱形十二面体以及任意三斜晶系模拟 盒子,在周期性边界条件下进行显式溶剂模拟,同时特别注重长程静电作用的高效、精确计算,可用于在各种条件下对显式膜系统、复杂混合物、聚合物及界面进行建模。

易于使用的界面

支持模拟 的自动化设置,包括采用内置模拟 协议的多阶段分子动力学(MD)模拟、多温度下的状态方程(EOS)预测,以及非平衡动力学和增强采样等高级技术。直观的用户界面提供了智能默认设置,可快速设置计算实验。

强大的分析工具

在同一套MSMaestro建模环境中可视化并分析计算结果,该环境可连接到从量子力学(QM) 到机器学习(ML) 的全套建模工具。

案例研究与网络研讨会

了解Schrödinger 技术如何被用于解决现实世界中的研究难题。

材料科学 网络研讨会

超越实验台:分子动力学 (MD) 模拟入门

请跟随Schrödinger的凯蒂·达尔奎斯特(Katie Dahlquist),她将向您展示如何利用Desmond 来提升您的开发效率。

材料科学 网络研讨会

超越实验台:分子动力学 (MD) 模拟录制入门

请跟随Schrödinger的凯蒂·达尔奎斯特(Katie Dahlquist),她将向您展示如何利用Desmond 来提升您的开发效率。

材料科学 案例研究

通过集成式 实验和分子模拟 方法推动可持续食品加工的发展

来自Schrödinger 和马萨诸塞大学(UMass)的科学家们通过实验和计算方法开展了全面研究,以探究以玉米蛋白(zein)为原料配制的肉类替代品的关键特性及其挤出性能。

材料科学 网络研讨会

借助多尺度 和多物理场 的仿真技术,加速OLED创新

欢迎加入我们,共同探索集成式 数字工作流程如何推动新一代高性能OLED的设计。

材料科学 案例研究

食品的未来:分子模拟与人工智能/机器学习重塑产品开发

材料科学 案例研究

结合计算与实验方法,推进药物制剂的设计与优化

材料科学 案例研究

利用粗粒化模拟表征脂质纳米粒子的自组装与结构

材料科学 案例研究

利用分子模拟设计出污染风险更低、保质期更长的优质包装材料 

材料科学 网络研讨会

Schrödinger 2024年日本材料科学研讨会 

《免费网络研讨会》介绍面向材料开发的仿真软件及材料信息学的应用案例。

材料科学 网络研讨会

将实验数字化:利用原子级模拟 和机器学习(ML) 技术进行大规模材料创新

在本场网络研讨会中,我们将介绍一种利用数字化学平台进行计算机模拟分析、优化 以及新材料发现的现代化材料研发方法。

在材料科学研究领域的广泛应用

利用大规模化学探索和精准的计算机模拟分子 预测技术,充分挖掘您的创意潜力。

聚合物材料
药物配方与递送
能源捕获与储存
有机电子
消费包装品

NVIDIA 官方合作伙伴

Schrödinger 与英伟达建立了战略合作伙伴关系,旨在针对英伟达GPU技术优化我们的计算药物发现平台。

文档与教程

了解常见问题的解答,并掌握使用Schrödinger软件的最佳实践。

材料科学 习题指南

蛋白质表征:第2部分

通过进行并分析分子动力学 (MD) 模拟,探讨牛β-乳球蛋白在不同pH值条件下的特性。

材料科学 习题指南

蛋白质表征:第一部分

学习蛋白质表征工作流程:确定结构、分析表面性质以及进行混合溶剂实验分子动力学 (MD) 。

材料科学 习题指南

离子电导率

学习如何计算离子电导率。

材料科学 习题指南

确定表面上的吸附位点

了解如何确定表面上的吸附位点。

材料科学 习题指南

复杂蛋白质溶液的模拟

学习如何为分子动力学(分子动力学 (MD) ,MD)模拟准备复杂的蛋白质系统模拟 。

材料科学 习题指南

构建和分析复杂的脂质双层,并嵌入膜蛋白

学习如何构建和分析复杂的脂质双层,以及如何将蛋白质嵌入其中。

材料科学 文献资料

机器学习(ML) 力场

机器学习(ML) 力场(MLFFs)为预测任意系统的能量提供了一种新颖的方法。

材料科学 习题指南

机器学习(ML) 力场

了解如何使用机器学习(ML) 力场优化 方法来构建和模拟各种系统。

材料科学 文献资料

Desmond

利用基于GPU的高性能分子动力学(分子动力学 (MD) , MD)引擎对生物系统进行模拟。

材料科学 习题指南

采用自动化DPD参数化方法的纳米乳液

了解如何从含水的纳米乳液体系中自动构建用于耗散粒子动力学(DPD)的粗粒化力场,并进行分子动力学 (MD) 模拟 分析。

相关产品

进一步了解可用于推进您研究项目的相关计算技术。

虚拟集群

用于在云端运行仿真的安全、可扩展的环境

MSMaestro

适用于材料发现的完整建模环境

OPLS4 和 OPLS5 力场

一个用于精确分子模拟的现代化、综合性力场

MS CG简体中文(大陆)

针对大型系统在长时间尺度上的高效粗粒化(CG)分子动力学(分子动力学 (MD) , MD)模拟

MS Morph

一种用于预测有机晶体晶型的高效建模工具

MS 渗透剂装载

分子动力学 (MD) (MD)建模用于预测凝聚体系的水负载能力和小分子气体吸附容量

MS Transport

一款高效的分子动力学 (MD) (MD)模拟 工具,用于预测液体的粘度、电导率以及原子和分子的扩散行为

出版物

浏览采用Schrödinger 技术、发表在相关应用领域的经同行评审的出版物列表。

材料科学 出版物

用于先进封装的模拟 材料特性

生命科学 出版物

STX-721 是一种共价 EGFR/HER2 外显子 20 抑制剂,它利用外显子 20 突变体的动态蛋白质状态,并在多种人类癌症模型中实现了独特的突变体选择性 。

生命科学 出版物

一种经过大规模验证和盲测验证的、用于支持小分子药物开发的可靠晶体结构预测 法

材料科学 出版物

利用……揭示来自平螺旋藻(Arthrospira platensis)的蓝色天然色素异藻蓝蛋白的光吸收机制分子动力学 (MD)

材料科学 出版物

利用分子动力学 (MD) 模拟和自由能分析评估类药物化合物与猴痘病毒VP39蛋白的结合潜能及稳定性

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利用分子动力学模拟预测非晶固体分散体中药物与聚合物的相容性模拟 :关于溶剂化自由能的陷阱

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波利溶解机制的潜在应用:以布比卡因的分子动力学 (MD) 模拟 为例

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利用机器学习(ML) 和基于物理理论 模型设计新一代聚合物

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利用分子动力学 (MD) 模拟对泼尼松龙在聚乳酸-共聚乙二酸聚合物载体中的包封进行建模

材料科学 出版物

用于高效去除染料的Cu-TiO₂/沸石/PMMA片剂:光催化水净化研究

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培训与资源

在线认证课程

通过分子建模 的实践性在线课程,提升您的技能水平。这些可自主安排学习进度的课程涵盖了广泛的科学主题,并提供Schrödinger 软件的使用权限及技术支持。

教程

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