- 导入、分析和编辑蛋白质序列,包括使用“多序列查看器”进行快速序列比对和注释
- 利用全自动工作流程,根据序列构建高质量的同源模型
- 使用 Prime 进行结构精修,或通过分子动力学 (MD) 进行平衡,方法如下:Desmond
- 利用先进且完全灵活的模型,预测高保真度的实验结合构象分子对接
酶工程
计算机辅助酶设计的能力
可直接根据序列轻松构建3D酶结构,并了解底物与活性位点的结合情况
理解底物与活性位点的结合
- 快速执行分子对接
- 利用先进且完全灵活的模型,预测高保真度的实验结合构象分子对接
提高动力学性能和反应性
- 通过量子力学(QM) (QM)计算,深入了解反应机理
- 理解过渡态和反应能垒
- 将量子力学(QM) 的精度与分子力学(MM) (QM/MM)的速度相结合
改进特异性 、选择性 以及基板系列
- 利用恒pH模拟,针对复合物界面或活性位点中可滴定蛋白质残基,获得准确且高效的pKa 预测结果
- 使用残基扫描功能快速高效地扫描残基突变
- 针对热稳定性、底物选择性 和特异性 对酶进行工程改造,采用FEP+
设计具有更佳化学和物理稳定性的酶
- 鉴定蛋白质表面上的化学不稳定残基
- 准确预测突变体在高温下的相对热稳定性
- 预测最适合减轻化学风险的残基突变
- 预测该酶表面残基的聚集倾向
利用Schrödinger的尖端软件设计高质量的生物制剂

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用于……的建模环境生物制剂发现

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