- Multiple Sequence Viewer を使用して、タンパク質配列のインポート、解析、編集を行うほか、迅速な配列アラインメントやアノテーションも可能です。
- 完全に自動化されたワークフローを用いて、配列から高品質なホモロジーモデルを生成する
- Prime を使用して構造の精緻化を行うか、または分子動力学による平衡化を行うには、Desmond
- 高度で完全に柔軟なドッキング手法を用いて、高精度な実験的結合姿勢を予測する
酵素工学
インシリコ酵素設計のための機能
配列から直接、3D酵素構造を簡単に構築し、活性部位への基質結合のメカニズムを理解できます
活性部位への基質結合の理解
- クイックドッキングを実行する
- 高度で完全に柔軟なドッキング手法を用いて、高精度な実験的結合姿勢を予測する
運動能力と反応性を向上させる
- 量子力学（QM）計算を通じて、反応メカニズムに関する貴重な知見を得る
- 遷移状態と反応障壁を理解する
- 量子力学の精度と分子力学の計算速度を組み合わせる（QM/MM）
特異性、選択性、および基質範囲の向上
- 定pHシミュレーションを用いて、複合体の界面や活性部位にある滴定可能なタンパク質残基 について、pKa による正確かつ効率的な予測結果を得る
- 残基 スキャン機能を使用して、残基 の変異スキャンを迅速かつ素早く実行する
- 以下の方法を用いて、熱安定性、基質選択性、および特異性を備えた酵素を設計するFEP+
化学的および物理的安定性が向上した酵素の設計
- 同定 タンパク質表面にある化学的に不安定な残基
- 高温下における変異体の相対的な熱安定性を正確に予測する
- 化学的リスクを軽減するのに最も適した残基 変異を予測する
- 酵素の表面残基 の凝集傾向を予測する
Schrödingerの最先端ソフトウェアを活用して、高品質なバイオ医薬品を設計しましょう
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