Schrödinger の全世界のオフィスは、社員全員が休息を取り、リフレッシュするための全社的な取り組みの一環として、8月17日から21日までの1週間、休業いたします。この期間中は、お問い合わせへの対応が制限される場合がございますので、あらかじめご了承ください。科学・技術サポートチームのメンバーは、緊急のサポート案件への対応のみ行います。

ヒット・トゥ・リードおよびリードの最適化

より質の高い創薬候補化合物を、より迅速に設計する

ヒット・トゥ・リードおよびリードの最適化

高度な精度を持つインシリコツールを用いて、膨大な化合物空間 を探索・選別する

最適な創薬候補物質、すなわち、オン・ターゲット 活性 および特異性を維持しつつ、主要な物理化学的特性を最適化した新規分子を特定することは、リード最適化プログラムにおける究極の課題である。

Schrödinger同社の分子設計プラットフォームにより、プロジェクトチームはリード化合物の最適化という課題に対して「予測優先」のアプローチを採用できるようになり、高度にインタラクティブで完全にインシリコで行われる設計サイクルを通じて、探索可能な分子の候補群を劇的に拡大することができます。これにより、チームは自信を持って時間と労力を費やして、新規で未知の、そして多くの場合より複雑な設計の探索に注力しつつ、合成に回すのは最も性能の高い分子のみに限定することができます。

化学物質の同定、物性予測、チームコラボレーションのための多様なソリューション

プロジェクトに関連する化合物空間 を作成・検討し、リガンド の設計を迅速に進める

リアクション法またはR-グループ 法に基づく列挙および高度なフィルタリング機能を活用して、独自の化合物空間 を作成・カスタマイズできます。
正確な物理ベースのシミュレーションと機械学習の力を組み合わせることで、膨大なデータを効率的に探索する化合物空間
ターゲット に特化した数十億もの仮想分子について、反応に基づくインテリジェントな列挙・フィルタリングおよび正確なFEP+ スコアリングワークフローを用いてプロファイリングを行います。

活性部位における水との相互作用の熱力学を活用して、リガンド の設計を推進する 

結合部位における水和部位の位置と熱力学的ポテンシャルを予測することで、活性 の新たなドライバー分子を発見する
SARを簡単かつ直感的に解釈するための方法として、水和部位を可視化する

いつでも、どこでも、同僚とリアルタイムでデザインや共同作業を行えます

単一のクラウドネイティブプラットフォームを活用して、チームメンバーとデザインのアイデアを共有・修正・検証し、LiveDesign
意思決定や仮説を記録し、SARに関する組織全体の理解を深め、化合物 の進捗を加速させる
プロジェクト全体のデータや個々の分子を分析するための充実したダッシュボードを構築し、主要な物性空間において有望な設計の機会を迅速に同定 する

主要な特性を予測し、リガンド の最適化を加速させる

自由エネルギーに基づく計算アッセイ(FEP+ ):

•活性
• 選択性
• 溶解度

その他の物理法則に基づく予測:

• 膜透過性
• hERG阻害
• CYP阻害/TDI
• CYP誘導(DDI)
• 代謝部位
• 脳内曝露

事例研究

Schrödinger の技術が、現実の研究課題の解決にどのように活用されているかをご覧ください。

ライフサイエンス 事例研究

新規なFEP+ 戦略を用いた、高選択性かつアロステリックなピコモル級TYK2阻害剤の設計

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リガンド 効率が高く、特性が最適化された、新規かつ強力なCDC7阻害剤開発候補化合物の設計

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固形がんの治療を目的とした、高選択性Wee1阻害剤の高精度かつ計算機支援による探索

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計算機支援による設計と結合部位における水のエネルギー動態の評価に基づき、新規かつ強力なACC阻害剤が発見された

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開発候補化合物の創出まで10ヶ月:新規かつ強力なMALT1阻害剤の迅速な発見

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インディアナ・バイオサイエンス研究所は、CDD Vaultを活用して創薬を推進しており、Schrödinger LiveDesign

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Schrödinger 低分子のプロトン化状態の列挙およびpKa の予測に関するソリューション

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Morphic Therapeutic社は、デジタルケミストリー戦略を活用し、α4β7インテグリンに対する新規低分子阻害剤を設計した。

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包括的なデジタルケミストリー戦略を用いた新規D-アミノ酸オキシダーゼ阻害剤のリード化合物設計

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創薬の現場から:オンコロジープログラムにおける開発候補物質の探索に向けたモデリング戦略 1

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臨床開発段階にある、高選択性かつアロステリックなピコモル級TYK2阻害剤の設計

このウェビナーでは、TYK2に対する、クラス最高水準となる可能性を秘めた選択的かつアロステリックなピコモル級阻害剤の発見における重要な出来事を紹介します。

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大規模なデ・ノボ設計による創薬プログラムへの影響

このウェビナーでは、Schrödingerの治療薬開発部門グループ に所属する科学者たちが、デ・ノボ設計技術を活用することで、チームが重要な設計上の課題を克服し、開発プログラムを加速させることができた、いくつかの最近の事例について解説します。

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ドキュメントとチュートリアル

Schrödingerのソフトウェアに関するよくある質問への回答や、その活用におけるベストプラクティスをご確認ください。

ライフサイエンス チュートリアル

学習パス:環状ペプチドのモデリング

創薬における環状ペプチドのためのツールとワークフローに関する体系的な概要。

ライフサイエンス チュートリアル

E-solを用いた血液脳関門透過のモデリング

溶媒和エネルギー(E-sol)の値を算出し、その結果を分析して、血液脳関門(BBB)の透過性を評価する。

ライフサイエンス ドキュメント

学習パス:オリゴヌクレオチドのモデリング

創薬における核酸関連のツールとワークフローに関する体系的な概要。

ライフサイエンス チュートリアル

解離動力学シミュレーションに基づく薬物の滞留時間の予測

キナーゼ系に対して解離速度論ワークフローを実行し、その結果を分析する。

ライフサイエンス チュートリアル

RNA –リガンド とリガンド デザイナーとの相互作用の形成

「リガンド Designer」を使用して、RNA受容体 に結合するリガンド を改変し、結合親和性を向上させます。

ライフサイエンス ドキュメント

膜の透過性

同属のリガンド群の受動的膜透過性を算出する。

ライフサイエンス ドキュメント

FEP+

実験手法と同等の精度で、物理学に基づく自由エネルギー摂動技術を用いたタンパク質-リガンド 結合の計算機による予測。

ライフサイエンス ドキュメント

リガンド デザイナー

タンパク質またはDNA/RNAの受容体 を背景として、リガンド をインタラクティブに設計し、その結合能や特性を最適化します。

ライフサイエンス ドキュメント

IFD-MD

受容体 とリガンド の結合姿勢のGPU加速予測。

ライフサイエンス ドキュメント

Glide

使いやすく、信頼性の高いリガンド と受容体 のドッキング機能。

主力製品

研究プロジェクトを前進させるために活用できる主要な計算技術について、詳しくご覧ください。

Maestro

分子探索のための包括的なモデリング環境

FEP+

創薬のための高性能な自由エネルギー計算

アクティブ・ラーニングの活用例

機械学習を活用して発見を加速させる

デ・ノボ設計のワークフロー

超大規模な化合物空間 の探索と精緻化のための、完全に統合されたクラウドベースのデザインシステム

IFD-MD

新規化合物における、オンターゲットおよびオフターゲットに対するリガンド 結合様式の正確な予測

WaterMap

構造 リガンド の最適化に向けた、 を基盤とした最先端の手法による、 結合部位における水の溶媒和によるエネルギー評価リガンド

LiveDesign

デジタル分子設計のための総合ラボ

出版物

関連する応用分野において、Schrödinger 技術を採用した査読付き論文の一覧をご覧ください。

ライフサイエンス 出版物

SGR-1505のインシリコ創薬の加速:成熟B細胞性悪性腫瘍の治療を目的とした強力なMALT1アロステリック阻害剤

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コンピュータ支援による創薬を通じて、SARS-CoV-2メインプロテアーゼに対する高活性の非共有結合性阻害剤を発見

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創薬プロジェクトにおけるキノーム全体の選択性を実現するための自由エネルギー計算の活用:Wee1の事例研究

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GPCRを対象とした、計算構造 を基盤とする創薬において、AIと物理学が融合する

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計算機によるヒット発見:産業界の視点

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アクティブ・ラーニングFEP:ALプロトコルと化学的多様性が性能に与える影響

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構造-マラリアの化学予防を目的とした、高活性のジヒドロオロテートデヒドロゲナーゼ阻害剤の探索および開発

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創薬におけるタンパク質立体構造の熱力学の活用

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インシリコ手法による、神経変性疾患および神経細胞損傷の治療を目的とした前臨床段階のDLK阻害剤「KAI-11101」の発見

ライフサイエンス 出版物

インシリコを活用した創薬プラットフォームを用いた、新規の変異体選択的上皮成長因子受容体 阻害剤の発見

組織のニーズに応えるソフトウェアとサービス

ソフトウェアプラットフォーム

物理ベースの分子モデリング、機械学習、チームコラボレーションを基盤とした、包括的で使いやすいプラットフォームを活用し、デジタル材料探索ワークフローを導入しましょう。

モデリングサービス

Schrödingerの計算科学に関する専門知識と大規模な技術を活用し、創薬プロセスの重要な段階において、お客様のプロジェクトを前進させましょう。

サポートとトレーニング

初心者から経験豊富なユーザーまでを対象に設計された、専門家のサポート、学習教材、およびトレーニングリソースをご利用いただけます。