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JAN 25, 2024

大規模なデ・ノボ設計による創薬プログラムへの影響

高品質な化学物質のデ・ノボ設計をより包括的かつ効果的に実現するための技術を開発することは、創薬分野における長年の目標である。

この目的のために、Schrödinger 社は最近、低分子化合物の活性 および選択性の最適化に向け、合成可能性を考慮した大規模なde novo設計手法(AutoDesigner)と、厳密な自由エネルギーに基づくスコアリング手法(Active LearningFEP+ )を組み合わせたワークフローの開発を主導しました。この技術の最近の進展により、R-グループ 設計の枠を超え、コア探索へと発展しており、初期段階のヒット化合物同定やバックアップシリーズの創出など、その応用範囲が拡大しています。

本ウェビナーでは、Schrödingerの創薬部門(グループ )における最近の事例をいくつかご紹介します。これらのデ・ノボ設計技術により、各チームは重要な設計上の課題を克服し、プログラムの推進を加速させることができました。

見どころ

  • AutoDesignerと他の一般的な設計手法との実地比較。これには、 化合物空間 の評価、所要時間、および設計目標の達成能力の検証が含まれる。
  • AutoDesignerを用いたヒット同定時の新規コアの設計
  • AutoDesigner を用いたヒット化・リード化およびリード最適化におけるR 基の設計
  • 分子接着剤の活性 および選択性を向上させる例、およびデ・ノボ設計を用いてIPを強化する例
  • 創薬プログラムにこの技術を適用するための要件とベストプラクティス

登壇者

ピーター・ボス(博士)

主任研究員 II、Schrödinger

ピーター・ボス氏は、AutoDesignerおよびDe Novo Designワークフローの主任研究員兼プロダクトマネージャーです。Schrödinger では、自動化された化合物 設計アルゴリズムの研究、開発、最適化を主な業務としています。 また、社内および共同の創薬プロジェクトに向けた、網羅的な医薬品分子ライブラリの設計および実行を担当する主任科学者でもあります。フローニンゲン大学のベン・フェリンガ教授の研究室にて、合成有機化学の博士号を取得しました。Schrödinger に入社する前は、ボストン大学(ジョン・ポルコ教授およびコーリー・スティーブンソン教授)で合成法開発のポスドク研究員として、またコロンビア大学(ブレント・ストックウェル教授)で低分子創薬の研究に従事していました。

サテシュ・バット 博士

事務局長、Schrödinger

グループ の創薬部門エグゼクティブ・ディレクターであるサテシュ・バット博士は、2011年にSchrödinger に入社しました。同氏は、Schrödinger において、社内および提携先との創薬プログラムにおける計算化学の取り組みを統括しています。以前は、メルク社およびイーライ・リリー社に勤務し、複数の創薬プログラムにおいて計算化学の取り組みを主導していました。同氏はマギル大学で博士号を取得しており、その研究では、結合自由エネルギーを予測するための構造 に基づく手法の開発を行いました。 サテシュは、多数の特許や論文の共著者であり、現在も計算化学の幅広い分野について論文を発表し続けている。

ゼフ・コンスト 博士

主任研究員 II、Schrödinger

ゼフ・コンスト氏は、Schrödinger の治療薬開発部門「グループ 」の主任研究員であり、医薬品化学者として創薬プロジェクトの遂行を担当しています。ゼフ氏は、ノバルティスおよびヌリックス・セラピューティクスでの勤務を経て、2020年にSchrödinger に入社し、これまでに4つの化合物の臨床開発に貢献してきました。同氏は、カリフォルニア大学アーバイン校のヴァンダーウォール教授の下で博士号を取得しました。