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结构生物学

科研信息技术与云计算

扩大结构生物学对药物设计的影响

随着冷冻电镜、机器学习(ML) 技术(如AlphaFold)以及新型计算能力的进步,结构生物学正在迅速发展。这使得人们能够提出新的问题,并对可实现的目标确立新的标准。

Schrödinger 正致力于推动基于结构优化 的现代计算工作流程、配体定位以及结合位点 分析,以发掘更多适用于基于结构设计的蛋白质靶点。

用于计算结构优化 、配体定位和结合位点 分析的工具

利用计算工具生成并验证配体结合构象

  • 利用业界领先的力场,将配体对接到密度不明确的区域(例如冷冻电镜结构中),以消除不确定性
  • 无需显式配体约束文件,即可生成质量更高、统计指标更优的精细蛋白质结构

利用实验测定的结构来构建和优化计算模型

  • 将配体可靠且准确地对接到您通过实验确定的结构上,用于药物设计或作用机制评估
  • 通过配体定位合理构建未解决的侧链原子
  • 放置辅因子和溶剂,将低分辨率模型转换为完整的全原子模型

利用集中式的结构数据和3D可视化平台,加强与化学家的协作

  • 存储、搜索和整理靶点 结构
  • 利用专业处理流程对蛋白质结构进行对齐和预处理
  • 通过3D视图查看、叠加和评估结构,从而指导靶点 的选择
>LiveDesign

针对您药物发现项目各个阶段的解决方案

利用大规模化学探索和精准的计算机模拟分子预测技术,充分挖掘您的创意潜力。

结构预测 &靶点 功能启用
苗头化合物 发现
苗头化合物-至-先导化合物 &先导化合物 优化
药物制剂

网络研讨会

基于结构的药物设计 无结构:实现对高难度靶点及ADMET反靶点的准确FEP+ 预测

借助先进的基于物理理论 计算方法,为基于结构的药物设计 开辟新天地

改进基于冷冻电镜数据的蛋白质-配体建模及其在药物研发中的应用

按照自己的节奏学习分子建模 的高级工具

《分子建模 在药物研发中的应用》简介 生命科学 生命科学
药物发现中分子建模 的简介

蛋白质制备、配体分子对接 、协作设计以及小分子药物发现的其他基础知识,由Maestro 和LiveDesign

利用……进行药物设计的自由能计算FEP+ 生命科学 生命科学
利用……进行药物设计的自由能计算FEP+

针对小分子,运行、分析和排查与结合相关FEP+ 计算中的问题先导化合物 优化

满足您组织需求的软件和服务

软件平台

利用一个功能全面且易于使用的平台,部署用于分子建模 、设计和协作的数字化药物发现工作流。

研究服务

利用Schrödinger的大规模计算专业知识和技术,推动您的项目顺利通过药物发现过程中的关键阶段。

支持与培训

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