リリースノート

低分子創薬

プラットフォーム環境

Maestro グラフィカルインターフェース

• 非標準ヌクレオチドのサポートを追加：DNAまたはRNAの任意の残基 を右クリックすると、2Dの構造 プレビューを備えた検索可能なパネルを通じて、その を非標準ヌクレオチドに変異させることができます。
• アノテーション付きGタンパク質共役受容体（GPCR）の可視化のための新しいGPCRWorkspace プリセット受容体
• サーフェス管理機能を一新し、サーフェストグルでの複数サーフェスの比較が可能になりました。複数のサーフェスを選択すると、「情報」タブで、面積、等値、シグマなどの項目を並べ替えて比較できます。また、このパネルはドックから外して自由に配置できるようになりました。
• バイオ医薬品向けのMaestro からLiveDesign へのエクスポートを簡素化：「Biologics/Others」のジェネリックエンティティエクスポートパネルを再設計し、「新規エンティティの登録」（HELMベースの重複排除機能付き）と「既存エンティティへの3Dデータの追加」という2つの明確なワークフローを用意しました。
• Workspace の相互作用における「選択範囲を読み込む」機能の操作が簡素化されました：Workspace で原子を選択し、相互作用のドロップダウンメニューから「選択範囲を読み込む」をクリックするだけで、「その他」の定義を手動で設定することなく、それらの相互作用を即座に表示できます。
• Get PDBにおけるスタンドアロンマップのインポート：回折データおよびEMマップは、プロジェクトテーブル内でそれぞれの構造体とグループ化されたスタンドアロンエントリとしてインポートされるようになりました
• 「その他のモダリティ」という新しいタスクツールカテゴリが追加され、「分解剤」および「マクロサイクル」というサブカテゴリが設けられ、専門的なパネルがグループ化され、見つけやすくなりました
• より直感的なクリッピングプレーンのズーム操作：クリッピングプレーンビューでは、デフォルトでWorkspace に合わせてズームされるようになりました。また、新しい右クリックメニューのオプションを使用すれば、「環境設定」を開かなくてもクリッピングプレーンの動作を切り替えることができます。
• 「設定ディレクトリ」ページを刷新：[参照]ボタンを追加してレイアウトをすっきりさせ、用語をより明確にし、SCHRODINGER_TEMP_PROJECTによる上書き設定を自動検出する機能を追加しました。また、Windows専用のセクションはMac/Linuxでは非表示になりました。
• 「ヘルプ」メニューに「更新を確認」オプションが追加されました
• MSVのペアワイズ配列アラインメントにおける劇的な改善

ターゲット 検証と構造 イネーブルメント

タンパク質の調製

• 構造 の構築中にGPCRを自動的にアノテーションする
• 現在、セレンメチオニンは、処理中にデフォルトでメチオニンに変換されるようになっています
• コマンドラインオプションを全面的に見直し、よりシンプルにし、Maestro インターフェースのデフォルト設定に合わせるよう改善しました
• Academic で使用できないオプションを無効化／非表示にするMaestro
• impref 最小化スキームの非推奨化に伴い、CLI から -noimpref フラグを削除しました
• 新しいサイドチェーン再構築手法でサイドチェーンの原子を再構築できなかった場合、ユーザーに警告を表示する

コフォールディング

• Maestro このパネルは、作成済みのモデル内のリガンド の債券注文を自動的に評価・修正します
• 後処理における残基 の信頼度に基づくトリミングを削除しました
• MSVで表示可能なホモロジーモデルの構築に使用された完全な多重配列アラインメント

予測毒性パネル

• パネルに13の新たなGPCRターゲット（5HT1B、5HT2B、5HT2C、ACM4、ADA2A、ADRB1、ADRB2、APJ、DRD3、OX2R、DRD2、ADORA1、CNR2）を追加しました。
• パネルに、BRD2 BD1、BRD2 BD2、BRD4 BD1、BRD4 BD2、およびCBPの5つの新しいブロモドメイン標的を追加しました。
• パネルに3つの新しい核受容体 ターゲット（RXRa、AR、ER Beta）を追加しました
• 「Predictive Tox」および「Predictive Tox SAR Panels」の両方で、すべてのパネルターゲットがサポートされています。

結合部位および構造 解析

結合部位の特性解析

• Rapid Binding Site Similarity（RBSS）の初版リリース
  • あるタンパク質の結合部位と、PDBに登録されているすべての結合部位との類似性を、わずか数秒で算出する
  • ユーザーが提供した結合部位ライブラリに対して、あるタンパク質の結合部位の類似性を算出する
  • グリッド上で計算された粗視化された分子相互作用場（MIF）を用いて、芳香族、疎水性、水素結合受容体、水素結合供与体、および正電荷・負電荷など、さまざまな官能基がグリッド上の特定の位置を占める傾向を表現する。

Desmond 分子動力学

• 水素質量再分配（HMR）の調整機能を搭載し、シミュレーション速度を最大約66％向上
• System Builderでは、新たに7種類の混合脂質二重層がサポートされるようになりました

混合溶媒MD（MxMD）

• シミュレーションの入力で、プローブターゲット の濃度を指定します（コマンドラインのみ）

ヒット同定およびバーチャルスクリーニング

アクティブ・ラーニングの活用例

• 選択したリガンドのすべてのプロトン化状態を含めた後、多状態プロトマー群に対するグループ のdG予測値を自動的に生成する
• ABFEPおよび最終的なABFEP再スコアリングの各ステップにおいて、荷電リガンドと非荷電リガンドについて、それぞれ個別にラムダウィンドウの数を指定してください。
• AL-ABFEPシミュレーションにおける位置拘束の適用
• レポートファイル内の「AL-FEP+ 」が豊富なサブ構造から、共通コアが除外されるようになりました
• AL-ABFEPは、GraphDB上でABFEPを実行する際の計算時間を短縮するため、リガンドを最初から計算し直すのではなく、前回の再評価結果を引き継いで処理を行います。

ドッキング

• Glide デフォルトでは ZMQ ジョブ分散（-mq オプション）を使用し、サブジョブのスケジューリングを最適化することで、複数のサブジョブを含むドッキングジョブのウォールクロック処理時間を短縮します

リードの最適化

RetroSynth

• Maestro のRetroSynthと分析パネルを統合した新機能：Maestro でRetroSynthによって生成された逆合成経路を実行・分析したり、LiveDesign

FEP+

• ABFEPの新しいスキャンモード：ハーフラムダウィンドウ、2 nsのシミュレーション時間、および切り捨てされた受容体
• 新しい相互作用エネルギーのプロットにおけるフラグメント分解機能：特定の化合物 フラグメントがどのように相互作用しているかをより深く理解できます。受容体
• 7種類の新しい混合脂質二重層のサポートが追加されました
• Maestro インターフェースからWebサービスへの「書き込み」送信コマンドを作成する
• リガンド FEP+ PoseBuilderでは、コマンドラインまたはLiveDesign

タンパク質 FEP

• Maestro インターフェースから、pH依存性の親和性を直接算出する
• FEP残基 スキャン（FRS）の大規模実行：変異を複数のバッチに分割し、自動的に並列処理を行った後、結果を単一のout.fmpファイルに統合する新しいワークフロー

E-sol

• 実験によるエフルックス比のデータが利用可能な場合、予測の設定、実行、および分析を行うための新しいパネル

FEP+ プロトコルビルダー

• FEP+ Protocol Builderのジョブを設定・分析できる統合パネル
• 新しいパラメータとして、さまざまな膜の種類を検討する
• プロトコルを送信せずに生成するコマンドラインの「-prepare」モード

量子力学

• 新しい「Maestro 」パネルを用いて、化合物 のアトロピソマーを予測し、主要な回転障壁を解析します。
• 自動生成されたHTMLレポート内で、AutoTS計算のシミュレーション設定と結果を一目で把握できるようにする

分光法

• C-F結合に対する13C NMRの重原子補正がサポートされるようになりました

半経験的量子力学

• g-xTBは、ユーザーがインストールした後、Jaguar から起動できます（XTB_GXTB機能フラグを有効にする必要があります）。

マクロサイクル

• MacroDockジョブを実行するための新しいマクロサイクル・ドッキング・パネル
• 「Prime」マクロサイクルサンプリングパネルに追加された新しいサンプリングオプション
• Glide におけるマクロサイクルコンフォーマーの生成法の改良、および特定の窒素化学構造を含む環系に対するIFD-MDドッキング
• 「Primeマクロサイクルサンプリング（Prime-MCS）」における、バンコマイシンなどの複雑な多環式化合物のより徹底的なサンプリング
• Primeマクロサイクルサンプリング（Prime-MCS）のコンフォーマーは、すべて単一の参照フレームに自動的に整列されるようになりました
• マクロサイクル・ドッキング・ワークフロー（MacroDock）は、原著論文で報告されたものよりも約2.5倍高速であり、成功率を約80％に維持しつつ、化合物 あたりのCPU実行時間の中央値を1時間未満に短縮している。
• マクロサイクル・ドッキング・ワークフロー（MacroDock）は、実験的な密度マップを用いたドッキングに対応するようになりました
• リガンド の同一サイトに対するバッチドッキング用の新しいスクリプト（macrocycle_batch_docking.py）

製剤

『クリスタル』構造 の予想

• 『 構造 結晶構造予測の 塩、溶媒和物、共結晶に対応し、固相開発における確実な結晶形態選定を支援： 同定 実験に着手する前に、大規模な計算スクリーニングを行い、最も安定で製造可能な結晶形を特定し、製剤戦略を確立します

ドキュメントの内容

• 「ラーニングパス」は、使いやすさを向上させるため、全面的に再設計されました

教育コンテンツ

• 新しい学習パス： 環状ペプチドのモデリング
• 新チュートリアル：非標準アミノ酸の取り扱い
• 新チュートリアル：E-sol を用いた血液脳関門透過のモデリング
• リニューアル版チュートリアル：化学者のためのガイドMaestro
• 更新版チュートリアル：アクティブラーニングを用いた大規模なリガンド ライブラリの評価Glide
• 更新されたチュートリアル：メタダイナミクスシミュレーションの実行入門Desmond
• 新しいインタラクティブなミニチュートリアル： 結合部位の類似性を迅速に検索 （パネルヘルプに組み込まれています）

生物学的製剤の創薬

• DNA／RNA／オリゴの設計におけるMaestro での利用を目的とした、非標準ヌクレオチドライブラリ の簡便かつ高スループットな合成
• PIPERの新しい出力ファイルにより、ドッキングされた姿勢の分析が効率化され、後処理の負担が軽減されます

Quantum ESPRESSO用GUI

製品：Quantum ESPRESSO (QE) インターフェース

• 入力*.cfgファイル（コマンドライン）による双極子補正設定のサポート
• NEBの画像間距離を横軸として反応プロファイルを可視化するオプション
• NEB計算のためのマルチスレッドMLFF計算（コマンドライン）
• MLFF を使用した NEB 計算における GPU サポート（コマンドライン）

マイクロキネティクス

製品名：MS Microkinetics

• (+MKM_ELECTROCATALYSIS) 電気触媒反応のための多段階ワークフローのサポート

アクティブ・ラーニング：光電子工学

製品名：アクティブ・ラーニング・オプトエレクトロニクス

• アクティブラーニングによる光電子工学：MLによる物性予測モデルへのアクセス
• アクティブラーニングによる光電子工学：AutoQSAR／DeepAutoQSARモデルへのアクセス

反応性

製品名：MS Reactivity

• ナノリアクター：バイアス電位を調整するオプション
• ナノリアクター：ユーザーエクスペリエンスを向上させるためのシンプルなUI
• ナノリアクター：反応発見を促進するための設定の改善
• ナノリアクター：出力にAutoTS遷移状態の周波数が表示される
• Reaction Network Profiler：入力準備中の原子衝突の防止

反応性インターフェースシミュレータ

製品名：MS RIS

• 固体電解質界面：ゼロ次結合を持つイオンに対するサポートの改善

フォースフィールドの高度な応用

製品：MS FF アプリケーション

• MLFFの微調整：MPNICEのMLFFモデルを微調整し、Schrödinger スイートでそれらを活用するためのソリューション
• MLFF計算：振動およびフォノン計算のサポート

分子動力学シミュレーションを用いた輸送計算

製品名：MS Transport

• イオン伝導度：予測に線形応答理論を適用するオプション
• 薄板せん断：せん断における平面の定義の改善

粗視化（CG）分子動力学

製品名：MS CG

• バックマッピング：粗視化された系を原子レベルの表現にマッピングするためのツール
• CG FF 課題：暗号化されたフォースフィールドファイルのサポート
• CG FF Builder：ビューアでのプロット用データの選択機能が改善されました
• CG FF Builder：原子価項の適合性の改善
• 粗粒度マッピング：選択した構造に対するMartini FFファイルの生成
• CGタンパク質のバックボーンをチューブとして可視化したものworkspace

材料情報学

製品名：MS Informatics

• MPNICE埋め込み：MPNICE埋め込みを記述子として用いた機械学習

階層型デバイスML

製品名：MS Layered Device ML

• OLEDデバイスML：事前学習済みのMLモデルの出力を、新しいモデルの記述子として使用するオプション
• OLEDデバイスのML：タンデム型OLEDデバイスのサポート
• OLEDデバイスの機械学習：表示パネルからの特徴量の重要度の可視化

Denovo ML

製品名：MS Denovo ML

• REINVENT：処理速度の向上に向けたジョブ送信プロトコルの更新

MSMaestro のビルダーとツール

• エージェント型ワークフロー: (+MATSCI_AGENTIC_WF) カスタム・メタ・ワークフローを作成するための言語モデルベースのソリューション
• Crystal構造 の予測：塩および溶媒のサポート
• 無料の体積解析：解析時のメモリ使用量を削減
• スラブのインポート：25種類の既成スラブモデルが追加されました
• Interface Builder：バルク界面および粒界のモデル構築ツール
• Structured Liquid：ユーザー体験の向上に向けたUIの再設計
• Sugar Builder: (+NEW_SUGAR_BUILDER_PANEL) グリコシル化パターンを用いた構築オプション

古典力学

• 液滴の接触角：MLFFのサポート
• 電解質解析：解析のために隣接するイオンクラスターを統合するオプション
• 蒸発：粗視化系における最大1桁の計算速度向上
• OPLS_2005 による TIP4P 水モデルへの対応
• MD マルチステージ: (+MULTISTAGE_MD_CONCATENATE) Brownieステージを他のステージと連結するオプション
• ポリマーの架橋：自由体積解析におけるメモリ使用量の削減
• 熱物理的特性：ディスク容量の使用量の削減

量子力学

• 光電子フィルムの特性：DFT またはTDDFTからT1の幾何構造を設定するオプション
• 光電子フィルムの特性：ISC/RISC再編成エネルギーの計算を高速化
• Reaction Network Viewer：複数の反応ネットワークに対する単一の出力（コマンドライン）
• Reaction Network Viewer：構造をworkspace
• 反応ネットワークビューア：反応ネットワークの画像を保存するオプション

教育コンテンツ

• 新チュートリアル：MLFFの微調整
• 新しいチュートリアル：エピタキシャル界面の形成
• 新チュートリアル：タンパク質の特性評価：第2部
• 新チュートリアル：MPNICE Embedding を使った機械学習
• 新チュートリアル：Crystal『構造 』の予測：第2部
• 更新版チュートリアル：オプトエレクトロニクスのアクティブ・ラーニング
• 更新されたチュートリアル：イオン伝導度
• 更新版チュートリアル：液体電解質の性質：第2部
• 更新されたチュートリアル：散逸的粒子動力学（DPD）の自動パラメータ化
• 更新されたチュートリアル：自動化されたDPDパラメータ化を用いたナノエマルジョン
• 新しいクイックリファレンスシート：粗粒度バックマッピング

教育コンテンツ

ライフサイエンス

• 新しい学習パス： 環状ペプチドのモデリング
• 新チュートリアル：非標準アミノ酸の取り扱い
• 新チュートリアル：E-sol を用いた血液脳関門透過のモデリング
• リニューアル版チュートリアル：化学者のためのガイドMaestro
• 更新版チュートリアル：アクティブラーニングを用いた大規模なリガンド ライブラリの評価Glide
• 更新されたチュートリアル：メタダイナミクスシミュレーションの実行入門Desmond
• 新しいインタラクティブなミニチュートリアル： 結合部位の類似性を迅速に検索 （パネルヘルプに組み込まれています）

材料科学

• 新チュートリアル：MLFFの微調整
• 新しいチュートリアル：エピタキシャル界面の形成
• 新チュートリアル：タンパク質の特性評価：第2部
• 新チュートリアル：MPNICE Embedding を使った機械学習
• 新チュートリアル：Crystal『構造 』の予測：第2部
• 更新版チュートリアル：オプトエレクトロニクスのアクティブ・ラーニング
• 更新されたチュートリアル：イオン伝導度
• 更新版チュートリアル：液体電解質の性質：第2部
• 更新されたチュートリアル：散逸的粒子動力学（DPD）の自動パラメータ化
• 更新されたチュートリアル：自動化されたDPDパラメータ化を用いたナノエマルジョン
• 新しいクイックリファレンスシート：粗粒度バックマッピング

LiveDesign

2026-3の新機能

• 生物学的製剤

  • 新しい抗体薬物複合体（ADC）を設計する：Entity Builder において、単特異性および二重特異性抗体に対応し、リンカーとペイロードの構成要素を個別に、あるいは組み合わせて設定できる 4 つの新しいテンプレートを使用して、ADC エンティティを作成します。

  • マルチポイントおよび組み合わせ型残基 置換：「シングルポイント」、「マルチポイント」、または「組み合わせ型」の突然変異タイプを選択すると、1回の実行で複数の位置にわたるすべての組み合わせを列挙できます。1回のリクエストにつき最大10,000通りの組み合わせが可能で、進行状況の通知からは新たに挿入された行に直接リンクされます。

  • モノマーデータベースビューア：30,000件以上のモノマーライブラリに対応した専用ビューアで、モノマーの閲覧、名称・記号・その他のフィールドを横断した検索、並べ替え、フィルタリング、管理が可能です。HELM文字列のエイリアス対応や、一括アップロード時の検証機能も備えています。

  • 隣接するアノテーション領域にわたる部分配列検索：領域の境界をまたぐ配列（例えば、 CDR3 とFR4の接合部など——を検索するには、「詳細検索」で複数の構造アノテーションを選択し、「境界を越えて検索」を有効にします。

  • Maestro から 3D構造 データをインポート：Maestro から 3Dデータを、汎用エンティティおよび生物学的製剤に直接エクスポートします。この際、新しい 3D 列を作成する、既存の列に追加する、または既存のデータを上書きするオプションが利用可能です。

  • 配列ビューア：定常領域およびヒンジ領域にフィルタリング：CH1、CH2、 CH3、 CL、またはヒンジ領域残基 のみを表示し、抗体の開発・製造可能性の確認を迅速化します。また、抗体エンティティについては、CDR領域がデフォルトで表示されるようになりました。

  • シーケンスビューア：標準およびカスタム置換マトリックスを用いたアラインメント：BLOSUM62、 PAM250、BLOSUM45、BLOSUM80、またはGONNETから選択し、カスタム CSV マトリックスをアップロードするか、Kabatやその他の抗体番号付け方式を用いて残基 番号に基づいてアラインメントを行うことができます。

• プロジェクト・スキャフォールド

  • R-グループ の分解パネルで、プロジェクトレベルのスキャフォールドをLiveReport固有のスキャフォールドと併せて適用し、プロジェクトのスキャフォールドを優先的に化合物 に照合します。更新されたスキャフォールドリストを公開すると、変更が自動的に同期され、開いているすべてのLiveReportにおいてR-グループ の分解が再計算されます。

  • プロジェクトダッシュボードの新しい「プロジェクト管理」タブから、プロジェクトのスキャフォールドを管理できます。スキャフォールドの名前を変更すると、開いているすべてのLiveReportsにおけるR-グループ の分解結果に即座に反映されます。

• フォーム：マルチエンティティ・マトリックス・ウィジェット： 化合物 の構造とデータを、構造を列、プロパティを行とする転置表形式で並べて表示し、各行にカスタムラベルを追加できます。

• プロジェクトダッシュボード：アクティビティストリームを、公開された特定のコメント列やプロジェクト内のユーザーで絞り込むことができます。LiveDesign のヘッダーにある「LiveDesign 」のロゴをクリックすると、ダッシュボードに直接アクセスできます。

• あらすじ

  • 2Dヒートマップ（ ベータ版）：2つのカテゴリ変数にわたるデータを、集計モード（平均、中央値、最小値、最大値、または個数）を用いて可視化し、 MPO やその他の高度な色付けルールをサポートしています。

  • 箱ひげ図、散布図、折れ線グラフにおける日付に基づくグループ化：グループ 日付型のX軸を「日」、「週」、「月」、「四半期」、または「年」単位で設定し、経時的な傾向を確認できます。また、各時間区間ごとにデータを集計するか、集計しないかを選択することも可能です。

• SAR分析：構造 の着色を除去するオプション：化合物 列のメニューで「構造 の着色を表示」の切り替えをオフにすると、スキャフォールドのアラインメントを維持したまま、R-グループ の分解による色のオーバーレイを除去できます。この切り替え設定はLiveReportごとに適用され、セッション限定です。また、すべてのユーザーのデフォルト状態はサーバープロパティによって制御されます。

• システムヘルスツール（ベータ版）：LiveDesign のシステム状態を、一元化されたダッシュボードから監視します。このダッシュボードには、モデルのタスクキューの深さ、LiveReportの実行キューのメトリクス、キュータイプ別（Sync、Async、Fast、Realtime）のタスクエンジンのステータス、JVMヒープの使用状況が表示され、各メトリクスタイルにはアイコンとツールチップが付いています。

• UXの改善

  • 「失敗したセルのみ再計算」：モデル列のメニューに「失敗したセルのみ再計算」オプションが追加されました。これにより、LiveReportを事前にフィルタリングすることなく、結果が失敗したセルのみを再実行できるようになりました。

  • デザインスケッチャーから「化合物 」を追加すると、IDによる検索や詳細検索と同様に、新しく追加された行が選択されるようになりました。

  • 管理者ユーザーは、一般ユーザーが、自分が所有していないLiveReportsや、すでにデータが含まれているLiveReportsにテンプレートを適用できるようにするサーバープロパティを設定できます。

  • 「Visualize」パネルタブには、開いているプロットやツールをすべて閉じる「すべて閉じる」オプションが追加されました。プロットタブを右クリックすると、コンテキストメニューが表示され、タブに切り替えることなく、プロットを開いたり、ポップアウトさせたり、閉じたりすることができます。

  • プロットの名前を変更すると、ブラウザのポップアップではなくアプリ内のダイアログが表示されるようになり、プロットのタブにカーソルを合わせると、ツールチップにプロットの完全な名前が表示されるようになりました。

  • デフォルトの位置から移動させたプロットの凡例は、エクスポートされたPNGおよび SVG ファイルに正しく表示されるようになりました。

  • 残基- シーケンスビューアと3Dビジュアライザ間のレベル同期の選択が、デフォルトで有効になりました。

  • 「汎用エンティティのインポート」ダイアログの「プロパティ」列のドロップダウンに、列名を指定して素早く検索できる検索フィールドが追加されました。

修正された点

詳細検索

• 詳細検索：複雑なビューで「AND」や「OR」といった論理演算子を変更しても、その後の検索ではその変更が無視されていましたが、現在は更新された論理が正しく反映されるようになりました。

• 詳細検索：部分シーケンス検索で無効なシーケンスを入力した場合、以前は以前に入力された有効なシーケンスを使用して黙って検索が行われていましたが、現在はシーケンスの形式が無効な場合、検索ボタンが正しく無効化されるようになりました。

• 子エンティティのクエリを含む詳細検索では、一致する子エンティティがアーカイブされている親エンティティが検索結果に含まれていましたが、現在はアーカイブされた子エンティティが検索結果から正しく除外されるようになりました。

• 構造 をフィルターパネルにドラッグ＆ドロップすると、スケッチャーに構造 が読み込まれるものの、「追加」ボタンは無効なままとなり、フィルターを適用するには手動で編集する必要がありました。現在では、構造 が読み込まれるとすぐに「追加」ボタンが有効になります。

• 「詳細検索」でのサブストラクチャ検索では、どのデータセットを選択しても同じエンティティが検索結果として表示されていましたが、現在は選択したデータセットに合わせて正しく結果が絞り込まれるようになりました。

• 「詳細検索」の「構造注釈」および「番号付け方式」のドロップダウンメニューは、複合ビューでは位置がずれていたりサイズが不適切だったりしていましたが、現在は簡易ビューと複合ビューの両方で、一貫した位置で表示されるようになりました。

• 「詳細検索」でサブクエリを含むクエリ「グループ 」を削除すると、エラーが発生し、その後のクエリが失敗していましたが、サブクエリを含むクエリグループも、エラーなしで削除できるようになりました。

• IDによる詳細検索では、以前は「すべてのID」列に一致するエンティティが返されていましたが、現在はID列に一致するエンティティのみが正しく返されるようになりました。

• 高度な検索クエリでは、変更が並行して行われると永続的なエラー状態に陥り、ユーザーは新しいLiveReportで最初からやり直すことを余儀なくされていましたが、現在は並行更新があってもエラー状態に陥ることなく処理できるようになりました。

• 「LiveReport への存在」という詳細検索条件は、以前は「自分と共有されている」オプションを通じて、厳重に制限されたプロジェクトのユーザーにもグローバルプロジェクトの LiveReport を表示していましたが、現在は制限されたプロジェクト内の LiveReport のみが表示されるようになっています。

フィルター

• フィルタ式に検証エラーが含まれている場合、複合フィルタパネルで削除された条件がブラウザの再読み込み後に再び表示されることがありましたが、これに伴い、削除された条件は正しく保持されるようになりました。また、無効なフィルタ式の場合も、読み込み状態が繰り返し表示されるのではなく、わかりやすいエラーメッセージが表示されるようになりました。

認証

• 期間中 SSO ログインの際、ユーザーはログインページにリダイレクトされ、「SSOでログイン」ボタンをもう一度クリックして初めて正常にログインできていましたが、現在は最初の試行でログインできるようになりました。

• リフレッシュトークンフィルターが有効になっているサーバーのユーザーは、ログイン時に401エラーが発生したり、頻繁にログアウトされたりしていましたが、現在は確実にログインし、セッションを維持できるようになりました。

• 複数のユーザーが同時にセッションを開始すると502エラーが発生していましたが、現在は高い同時接続負荷下でも確実にセッションを開始できるようになりました。

• LiveDesign がユーザーアクセストークンの更新を試みた際、認証サービスが一時的に利用できない状態だった場合、タイムアウトが認証失敗とみなされ、ユーザーがログアウトされていました。LiveDesign では、障害を失敗とみなす前に、短い時間枠内でトークン更新リクエストを再試行するようになりました。これにより、認証サービスが一時的に利用できない場合でも、予期しないセッションの終了が発生しなくなりました。

生物学的製剤

• Entity Builderにおいて、LiveReport内のモノスペシフィック抗体に「選択項目から取得」を使用すると、エンティティタイプの不一致エラーが表示されていましたが、現在は正しく選択項目が設定されるようになりました。

• モノマーデータベースビューアでは、フィルタを適用した後にモノマーの行をクリックすると、別のモノマーの詳細が表示されていましたが、フィルタが適用された行をクリックした際に、正しいモノマーの詳細が表示されるようになりました。

• 「モノマーデータベース」のツールチップからモノマーSMILES をコピーすると、余分な空白が含まれてしまい、SMILES のフィルター検索で結果が返されませんでした。現在、ツールチップからSMILES をコピーし、フィルターとして使用すると、一致するモノマーが正しく返されるようになりました。

• 「反応列挙」スケッチャーで反応物を編集すると、拡張ステレオラベルが絶対（RまたはS）ラベルに変更されていましたが、構造を編集してスケッチャーで再度開いた際、拡張ステレオラベルが保持されるようになりました。

• モノマー保存ツールは、インターフェース全体を通じて「モノマーデータベース」という名称で統一されました。

フリーフォームの列

• フリーフォーム列に値を一括コピーすると、以前はブラウザを更新するまでLiveReportの画面が真っ白になっていましたが、現在はページを再読み込みしなくても、コピーした値が正しく反映されるようになりました。

• フリーフォーム列の監査証跡のツールチップは、ネットワークエラーが発生した際、以前にカーソルを合わせたセルの値を表示していましたが、監査証跡は現在、カーソルを合わせたセルの正しい内容を常に表示するようになりました。

• 「フリーフォームコメント」列にコメントを保存する際、「OK」をダブルクリックすると、以前はコメントが2つ重複して作成されていましたが、現在は正しく1つだけ作成されるようになりました。

• 削除されたフリーフォームコメント列でも、列メニューには引き続き「列の編集」オプションが表示され、列の詳細を編集できるようになっていましたが、削除された列は現在、正しく読み取り専用となっています。

• エンティティが選択されているにもかかわらず、LiveReport に「フリーフォームコメント」列がない場合、コメントパネルには「選択されたエンティティはありません」と表示されていましたが、現在はコメントセルが選択されていないことが正しく表示されるようになりました。

フォーム表示

• フォームビューでは、親ウィジェット内のエンティティをクリックしても、子ウィジェットがドリルダウンされたエンティティで更新されるまでに2回目のクリックが必要でしたが、現在は1回目のクリックで子ウィジェットが更新されるようになりました。

• フォームのマトリックスウィジェットのラベルでは、フォントサイズ、フォントの色、斜体、下線、取り消し線、水平方向の配置など、すべてのリッチテキストの書式設定が正しく保存されるようになりました。

• 大規模なLiveReportsにおいて、スプレッドシート表示とフォーム表示の切り替えが、以前より高速になりました。

• カンバンタイルには、そのタイルに垂直カラムが表示されていない場合、新しい垂直カラムやスイムレーンへドラッグするためのドロップゾーンが表示されませんでした。現在では、タイルにどのカラムが表示されているかに関係なく、ドラッグ＆ドロップが機能するようになりました。

• フォーム表示のカンバンタイルでは、セルが空白になることなく、生物学的エンティティの画像が正しく表示されるようになりました。

• グローバルフォームのレイアウトテンプレートは、グローバルプロジェクト以外のプロジェクトから上書き、名前変更、または削除される可能性がありましたが、現在は、グローバルプロジェクトの外からグローバルテンプレートが変更されるのを防ぐよう保護されています。

ライブレポート

• 日付列に空のセルが多数含まれるLiveReportsは、日付の解析に時間がかかるため、読み込みに異常に長い時間がかかっていましたが、これらのLiveReportsの読み込みパフォーマンスが大幅に改善されました。

• 仮想エンティティを共有する複数の実際の汎用エンティティを含むLiveReportsは、以前は読み込みに失敗していましたが、現在は正しく計算されるようになりました。

• 数百の列と未公開のフリーフォーム列を含むLiveReportの複製には、以前は1分以上かかっていましたが、今では数秒で完了します。

• 限定アッセイカラムは、親アッセイカラムへの参照を失い、公開できなくなっていたが、現在は正しくその参照を保持している。

• バッチ内のアッセイカラムが限定されている場合（グループ ）、以前は「カラムのグループ解除」オプションや「データとカラム」ツリーの「グループ解除」オプションを使用してもグループ解除ができなかったが、現在はどちらの方法でも正しくグループ解除できるようになった。

• 子エンティティを持つ親エンティティに対してモデルを実行すると、以前は子エンティティがLiveReportに個別の行として表示されていましたが、現在は親エンティティのみに影響が及ぶようになっています。

• 行を固定したLiveReportからセルの値をコピーすると、固定行の数だけ余分な空白行がクリップボードに追加されていましたが、現在は余分な空白行なしでセルの値がコピーされるようになりました。

• LiveReportのスプレッドシートにおいて、素早くドラッグすると垂直スクロールバーのハンドルがカーソルに追従しきれず、大規模なLiveReportの下部までスクロールできなくなっていた問題が解決され、現在はスムーズかつレスポンシブにスクロールできるようになりました。

• 「非表示の行を表示」ダイアログでは、ID 列のエイリアスが複数存在する場合、誤ったエンティティエイリアスが表示されていましたが、現在は正しい ID 列のエイリアスが表示されるようになりました。

• プロジェクト名で検索した後、プロジェクトピッカーで「OK」をクリックしても、そのプロジェクトに切り替わらなかった問題が修正され、現在は選択したプロジェクトに正しく移動するようになりました。

• アッセイデータのツールチップにある「アッセイビューア」リンクをクリックしてもツールが開かず、ページを更新するまでアクセスできない状態になることがありましたが、現在はツールチップからアッセイビューアが正しく開くようになりました。

• ファイル名にアンダースコアが含まれているファイルは、「ファイルの管理」ダイアログでは検索できませんでしたが、現在は検索結果に正しく表示されるようになりました。

• スケッチャーからLiveReportにデザインを追加するには、20秒以上かかることもあれば、まったく失敗することもありましたが、現在は即座に追加されるようになりました。

モデル

• プロトコルコマンド内で {ORIG-SDF-FILE} マクロを使用しているモデルは、Generic Entity の行に対して実行した場合、必要な入力ファイルが生成されませんでしたが、現在はすべてのエンティティタイプに対して正しく入力ファイルを生成するようになりました。

• モデルがデータの処理を完了していたにもかかわらず、モデル結果のセルが時折「失敗」と表示され、結果を表示するには手動でモデルを再実行する必要がありました。現在では、再実行を必要とせずに、セルにモデル結果が正しく表示されるようになりました。

• 依存関係のあるモデルが同時にトリガーされた場合、クリック・トゥ・ラン・モデルはタスクを送信できなかったが、現在は正しくタスクを送信できるようになった。

• パラメータ化されたモデルに渡された空の入力セルは、モデルのCSV入力において、空の文字列ではなく「[]」として表示されることがあり、表示が不統一でしたが、現在は一貫して空の文字列が表示されるようになりました。

管理パネル

• パラメータ化されたモデルが多数存在する管理パネルの展開環境では、モデル一覧ページが水平方向に広がり、すべてのページ番号が1行に表示されるため、レイアウトが使いづらくなっていました。今回の修正により、ページネーションコントロールにはリンクが簡略化されて表示されるようになり、モデルの数にかかわらずテーブルがコンパクトに保たれるようになりました。

• 「LiveDesign 」ユーザーロールを持つユーザーは、制限のないプロジェクトが多数（約250件以上）存在するデプロイメントにおいて、「タスク」ダイアログを開くことができませんでした。この問題を解決するため、リクエスト行のサイズ制限を引き上げ、制限のないプロジェクトが400件以上存在するデプロイメントでもタスクページが読み込まれるようにしました。

• UserAdmin ロールを持つユーザーは、プロジェクトの説明、治療領域、および「グループ 」の権限など、プロジェクトのプロパティに対する編集内容を保存できませんでした。現在、UserAdmin ロールを持つユーザーは、想定どおりプロジェクト設定を編集・保存できるようになりました。

• 同じユーザーが複数のブラウザやタブから同時に編集を行った場合、「プロジェクト」および「グループ」ページにおける管理パネルの操作で403 CSRFトークンエラーが発生していましたが、この問題は解決されました。

• 管理パネルのヘッダーにある「LiveDesign 」のロゴは、ブラウザウィンドウの幅を狭くすると歪んで表示されていましたが、現在はどのビューポートサイズでも正しく表示されるようになりました。

プロジェクトダッシュボード

• Project Dashboardにプロットを追加した際、プロットの軸上に表示されるEntityおよびR-グループ 構造 の画像が表示されませんでしたが、現在ではProject Dashboard上のプロットにおいて、軸上に構造 の画像が正しく表示されるようになりました。

• 軸上にエンティティまたはR-グループ の画像を含むプロットは、プロジェクトダッシュボードに追加されると、すべての化合物 の画像が1つにまとめられて表示されていました。これに対し、ダッシュボードのプロット軸上の化合物 の画像は、現在、グループ化され、個別に表示されるようになりました。

• プロジェクトダッシュボードのプロットウィジェットに固定されていたツールチップは、別のデータポイントをクリックすると消えていましたが、現在は表示されたままになります。

• レーダーチャートは、ユーザーの選択に依存するためデータを表示できなかったことから、プロジェクトダッシュボードから除外されました。ダッシュボードではレーダーチャートがサポートされていないことを示すメッセージが表示されます。

あらすじ

• ライブラリ へのアップグレード後、3D散布図が正しく表示されない問題が発生していましたが、現在はすべての列タイプ、集計モード、ビューにおいて、3D散布図が正しく表示されるようになりました。

• 集計モードが適用された散布図や折れ線グラフ上でデータポイントにカーソルを合わせてもツールチップが表示されませんでしたが、現在はカーソルを合わせると集計値情報が正しく表示されるようになりました。

• エンティティまたはR-グループ 列の軸を含むプロットをSVGまたはPNG形式でエクスポートすると、構造 の画像が含まれていないファイルが生成されていましたが、エクスポートされたプロットファイルには、エンティティおよびR-グループ の画像が正しく表示されるようになりました。

• プロットをSVGやPNG形式でエクスポートする際、プロットの凡例が切り取られていましたが、現在はエクスポートされたファイルで完全に表示されるようになりました。

• 1Dヒートマップでマウスを押したままドラッグして化合物を選択しても、ドラッグ範囲内のエンティティは選択されませんでしたが、現在は選択範囲内のすべてのエンティティが正しく選択されるようになりました。

• 化合物 プロットの軸に沿って表示されていた画像は、下方向に広がってドッキングされたツールチップに遮られていましたが、現在はツールチップの上部に正しく表示されるようになりました。

• プロットのオプションにある「もっと見る」ボタンは、特定のブラウザやOSの拡大縮小設定、あるいは長い列名を選択した場合に一部が切り取られて表示されていましたが、現在はすべての設定において完全に表示されるようになりました。

• プロットの「名前の変更」ダイアログでは、新しい名前を入力するフィールドの横に現在のプロット名が表示されるようになり、ダイアログのタイトルも標準的な大文字小文字の規則に合わせて更新されました。

• 1Dヒートマップでは、設定された企業IDの代わりにエンティティ識別子が不規則に表示されることがありましたが、現在は常に正しいID列識別子が表示されるようになりました。

• これまでは、ビューアーアクセス権限を持つユーザーが、プロットや3Dビジュアライザー上のドロップダウンをクリックすると、ビジュアライゼーションパネルが真っ白になり、反応しなくなっていました。現在は、ドロップダウンの選択肢が正しく表示されるようになりました。

• 「プロットオプション」モーダルは、画面の上方までドラッグしすぎると、タイトルバーや閉じるボタンがブラウザのアドレスバーの後ろに隠れてしまうことがありましたが、現在はモーダルが表示領域内に収まるようになりました。

シーケンスビューア

• フォーム表示モードでは、LiveReportグリッドからエンティティを選択してもシーケンスビューアに読み込まれませんでしたが、現在は選択したエンティティが正しく読み込まれるようになりました。

• 残基 シーケンスビューアでは、残基 のツールチップに表示される保存度値は、 の表示形式を FASTA とMonomer-DBの間で切り替えると、ツールチップに表示されるxml-ph-0000@deepl.internalの保存値が変化していましたが、現在は選択した表示形式にかかわらず、保存値が一貫して表示されるようになりました。

• シーケンスビューアのアラインメントに関するドロップダウンオプションのラベルが、「番号順（残基）」と誤って表示されていたため、「残基 番号順」に修正されました。

• シーケンスビューアのデータ列の値は、シーケンスキャンバスを横方向にスクロールしてその範囲外に出ると非表示になっていましたが、現在は横方向のスクロール中も表示されたままになります。

• シーケンスビューア：Logoプロット内の非天然モノマー（X）は、以前はアクティブな配色に基づいて色付けされていましたが、現在は割り当てられた天然アナログの色、または中立的なグレーが正しく使用されるようになりました。

• Firefox で「Differing残基」のカラーリングを適用すると、Sequence Viewer内の配列モノマーフォントが変化していましたが、現在はカラーリングモードや選択状態にかかわらず、一貫した表示が維持されるようになりました。

• シーケンスビューアーの「X個のシーケンスを処理中」という通知は、表示されているシーケンスだけでなく、読み込まれたすべてのシーケンスをカウントしていましたが、現在は表示されているシーケンスの数のみを正しく反映するようになりました。

• シーケンスビューアで「CDR1」、「CDR2」、「CDR3」などのアノテーションのドロップダウンラベルをクリックしても、以前はドロップダウンが開かなかったが、現在は正しく開くようになった。

• シーケンスビューアでのCDRフィルタリングは、以前はマルチチェーン抗体の場合、最初の2つのチェーンにしか適用されませんでしたが、現在は、重鎖および軽鎖の数がいくつであっても、正しく機能するようになりました。

• 残基 参照配列と一致する部分は、CDRフィルタリングが適用されるとドット表示されなくなっていたが、現在はフィルタリングの有無にかかわらず、一貫してドットとして表示されるようになった。

3Dビジュアライザー

• 3Dビジュアライザーでは、保存済みのシーンを読み込んでも、構造 がキャプチャされたビューに合わせて再配置されず、その後新しいシーンを保存しようとすると失敗していました。現在では、保存済みのシーンを読み込んだ際に、保存時の向きが正しく復元されるようになりました。

• 3Dビジュアライザーの「残基 」カラースキームでは、未知のアミノ酸および非天然アミノ酸（残基 ）が、独自のデフォルト色で正しく表示されるようになりました。

• 3Dビジュアライザー：キャンバス上で複数の「残基 」を1つずつ選択しても、階層パネルには最初に選択したオブジェクトのみが表示されていましたが、これでは、選択したすべての「残基 」が正しくハイライト表示されるようになりました。

• 3D ビジュアライザー：複数のセルに同じアタッチメントが読み込まれている場合、コンテンツパネルのエンティティのチェックボックスが個別に機能するようになりました。

• 3D Visualizer：リガンド に非極性水素を追加すると、原子ラベルの色が変わってしまいましたが、現在はラベルが正しい色を保つようになりました。

• 3Dビジュアライザーでは、構造 アライメントが有効な状態で測定モードに入ると、すべての選択タイプが無効になっていましたが、構造 アライメントの実行中は、測定ツールが自動的に無効になるようになりました。

• 残基 3Dビジュアライザーでは、背景色を切り替えるとラベルが消えていましたが、現在は背景色が変更されてもラベルが表示されたままになります。

• 3D Visualizer：構造 を.maeまたは.maegz形式でエクスポートすると、以前は削除されていた原子ラベルも含まれていましたが、現在はエクスポートされたファイルには現在表示されているラベルのみが表示されるようになりました。

• 3Dビジュアライザーの「階層」タブにある「番号付け方式」のドロップダウンメニューでは、以前は「Enhanced Chothia」が切り捨てられ、完全な名称が表示されていませんでしたが、現在はすべての番号付け方式の名称が正しく完全に表示されるようになりました。

• 3Dビジュアライザーでは、結合部位残基 に適用されたラベルが、リガンド のオン/オフを切り替えた際に削除されていましたが、切り替え後もすべての残基 でラベルが正しく復元されるようになりました。

• 残基 3Dビジュアライザーでは、黒い背景上でスタイルのプリセットを変更するとラベルが白くなっていましたが、現在は正しい色を保つようになりました。

• 3D Visualizerでは、サーバーから圧縮された添付データを取得し、ブラウザのセッション全体で構造体をキャッシュすることで、構造体の読み込み速度が向上しました。

• 3D Visualizer（構造 ）のアライメントパネルにおいて、カスタム原子選択モードで「戻る」ボタンを押すと、キャンバス上の参照選択が解除されていましたが、現在は以前の選択状態が正しく復元されるようになりました。

• 3Dビジュアライザーのキャンバスオーバーライドカラーパネルにある「Carbons Only」チェックボックスは、以前は余白が欠けて拡大表示されていましたが、現在は正しいサイズで表示されるようになりました。

リガンド デザイナー

• リガンド デザイナー：オーバーレイ構造は編集可能で、原子の選択や変更が可能でしたが、現在は意図通り編集不可の状態となっています。

• リガンド 以前は、結合順序が不正な構造体でも最小化が黙って成功していましたが、現在は処理できない構造体については正しく失敗と報告されるようになりました。

MMP

• MMP分析パネル内の提案された化合物 の「表示」ボタンをクリックしても、LiveReport上でその化合物 にスクロールしてハイライト表示されなかった問題が修正され、このボタンをクリックすると、化合物 が正しくフォーカスされるようになりました。

• MMPデルタプロットのX軸は、最初の変換IDではなくゼロから始まっていましたが、現在は正しく1から始まるようになりました。

SAR分析

• R-グループ による分解後にR基を新しいLiveReportに保存すると、芳香族化された構造が生成された際に空のLiveReportが生成されていましたが、現在はすべてのR基が正しく保存されるようになりました。

列挙

• 反応の列挙処理が失敗することがあり、その際はターゲット のLiveReportに生成物が表示されず、何が問題だったのかが不明でしたが、今回の修正により、具体的なエラーメッセージが表示されるようになりました。

エクスポート

• アッセイ列が限定されたLiveReportをエクスポートすると、SDF内の列名から「(Limited)」という接尾辞が省略されます。 PPTX、およびXLS形式のエクスポートにおいて、アッセイ列が限定されたLiveReportをエクスポートすると、列名から「(Limited)」という接尾辞が省略されていましたが、これに伴い、LiveReportのグリッド上の表示と一致するように、接尾辞が正しく含まれるようになりました。

• 汎用エンティティを含むLiveReportを、行単位モードでXLSまたはXLS Aligned形式にエクスポートすると、以前はエラーが発生して失敗していましたが、現在は正常にエクスポートできるようになりました。