作为公司范围内的休整与充电计划的一部分,Schrödinger 全球所有办事处将于8月17日至21日当周暂停办公。在此期间,我们的响应将有所限制,敬请谅解。Scientific和技术支持 团队成员仅会处理紧急支持问题。

FEP+ 用于生物制品

针对……的高性能自由能计算生物制剂发现

FEP+ 用于生物制品

借助……,更快地设计出更优质的蛋白质FEP+

FEP+ 这是Schrödinger的专有技术,基于物理理论 自由能微扰 。在您的生物制剂发现 项目中使用FEP+ ,可通过计算预测蛋白质突变的影响,其准确度与实验方法相当,误差在~1 kcal/mol以内。

通过 尽早剔除无关的突变,并快速产生新思路和后续设计方案,将获得结果所需的时间从数月缩短至数周

与传统的定向进化湿实验室方案相比, 优化 通过减少循环次数和检测的变异体数量,降低了成本

通过对多个参数进行同步优化 ,筛选出更优质的候选方案,从而加快创意的测试和筛选进程

主要应用领域

亲和力 工程学

增强或减弱蛋白质与其靶标之间的结合亲和力 靶点

选择性 工程学

调整一种蛋白质对靶点 中某一亚型的优先结合,而非另一亚型

交叉反应工程

扩展针对多个靶点的结合范围

pH依赖性结合

设计两种蛋白质之间pH依赖性的结合或解离

稳定性工程

提高基于蛋白质的生物制剂的物理稳定性

可开发性评估

优化溶解度、化学稳定性和物理稳定性等性质

充分利用Schrödinger久经考验的蛋白质工程 技术

蛋白质FEP+

在抗体、抗原、肽、酶及其他生物制品的优化 过程中,准确量化突变对蛋白质稳定性及蛋白质-蛋白质结合亲和力的影响。

FEP+ 残留物扫描

快速对多个位点上的单点突变进行同时建模,从而对突变效应进行一致且可靠的预测,并显著提高FEP+ 计算的效率。

Schrödinger的可自定义蛋白质工程 工作流

我们的工作流程利用FEP+ 的残基扫描和蛋白质FEP+ 技术,能够对蛋白质突变进行精准、高效的探索,从而同时优化稳定性、结合能力亲和力 、特异性 、pH依赖性结合以及交叉反应性。

FEP+ Residue Scan 的准确度比 MM/GBSA 提高了 7 倍,速度比 Protein 快了多达 20 倍。FEP+

MM/GBSA、FEP+ 残基扫描以及蛋白质FEP+ 计算结果(y轴)与相对实验亲和力 测量值(x轴)之间的相关性图,单位为kcal/mol。所有计算均在同一系统上进行,目前FEP+ 残基扫描结果中排除了与脯氨酸相关的突变。每个图的左上角显示了皮尔逊相关系数(R²)。

在基于蛋白质的药物研发领域具有广泛的应用

访问涵盖多种生物学模态的优化工作流程

抗体 设计

合理设计高效、安全且易于开发的单克隆抗体

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肽类发现

利用基于计算的结构设计方法设计肽类药物

了解更多
酶工程

利用基于结构的设计方法高效优化酶

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出版物

什么是自由能微扰 (FEP)?

如果您是初次使用FEP+ ,请重新温习一下相对结合力(自由能微扰 ,FEP)计算的基本概念。

文档与教程

了解常见问题的解答,并掌握使用Schrödinger软件的最佳实践。

生命科学 教程

学习路径:环肽建模

关于药物发现中环肽 所用工具和工作流的系统性概述。

生命科学 文档

FEP+

利用基于物理理论 自由能微扰 技术对蛋白质-配体结合进行计算预测,其准确度可与实验方法媲美。

生命科学 文档

学习路径:虚拟筛选

关于如何构建虚拟筛选 管道的结构化概述。

生命科学 教程

在恒定pH条件下预测蛋白质pKa 分子动力学 (MD)

确定蛋白质残基的pKa 值及其质子化状态。

生命科学 教程

利用蛋白质FEP+ 引导设计提高T4溶菌酶的热稳定性

通过突变填补蛋白质中的埋藏空腔,从而提高蛋白质的热稳定性FEP+ 。

生物制剂 教程

利用FEP+ 残基扫描识别具有影响的突变

执行FEP+ 残基扫描,以识别突变对蛋白质-蛋白质系统稳定性和亲和力 的影响。

生命科学 教程

验证用于预测单点突变热稳定性的蛋白质自由能微扰 模型

准备、运行并分析蛋白质FEP(模拟 ),以获得T4溶菌酶中单点突变的热稳定性预测结果。

相关产品

进一步了解可用于推进您研究项目的相关计算技术。

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软件平台

利用一个功能全面且易于使用的平台,部署用于分子建模 、设计和协作的数字化药物发现工作流。

研究服务

利用Schrödinger的大规模计算专业知识和技术,推动您的项目顺利通过药物发现过程中的关键阶段。

支持与培训

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