Schrödinger の全世界のオフィスは、社員全員が休息を取り、リフレッシュするための全社的な取り組みの一環として、8月17日から21日までの1週間、休業いたします。この期間中は、お問い合わせへの対応が制限される場合がございますので、あらかじめご了承ください。科学・技術サポートチームのメンバーは、緊急のサポート案件への対応のみ行います。

FEP+ 生物製剤向け

創薬に向けた高性能な自由エネルギー計算

FEP+ 生物製剤向け

より優れたタンパク質を、より迅速に設計するにはFEP+

FEP+ Schrödingerが独自に開発した、物理学に基づく自由エネルギー摂動技術です。生物製剤の創薬プロジェクトにおいて を活用することで、実験手法と同等の精度(約1 kcal/mol以内)で、タンパク質変異の影響を計算機上で予測することができます。FEP+

無関係な変異を早期に排除し 、新たなアイデアやその後の設計案を迅速に生み出すことで 、結果が出るまでの期間を数ヶ月から数週間に短縮します

サイクル数を減らし、解析する変異体の数を減らすことで、従来の指向性進化によるウェットラボプロトコルと比較して、最適化コストを低減できる

同定 複数のパラメータを同時に最適化することで、 より質の高い候補を生み出し、アイデアの検証や選別をより迅速に行うことを可能にする

主な応用分野

アフィニティ・エンジニアリング

タンパク質とその…に対する結合親和性を高める、あるいは低下させるターゲット

選択性制御

あるタンパク質が、あるターゲット に対して別の よりも優先的に結合するように調整する

交差反応性制御技術

複数の標的にわたる結合範囲の拡大

pH依存性結合

2つのタンパク質間のpH依存的な結合または解離を設計する

安定性工学

タンパク質由来の生物学的製剤の物理的安定性を高める

開発可能性評価

溶解性、化学的安定性、物理的安定性などの特性を最適化する

Schrödingerの実績あるタンパク質工学技術を活用しましょう

タンパク質FEP+

抗体、抗原、ペプチド、酵素、およびその他の生物学的製剤の最適化において、変異がタンパク質の安定性やタンパク質間結合親和性に及ぼす影響を正確に定量化する。

FEP+ 残基 スキャン

複数の部位における単一変異を同時に迅速にモデル化することで、変異の影響を一貫性があり信頼性の高い形で予測し、FEP+ の計算効率を劇的に向上させます。

Schrödingerのカスタマイズ可能なタンパク質工学ワークフロー

当社のワークフローでは、FEP+ (残基 )およびScan and Protein(FEP+ )の各技術を活用し、タンパク質の変異を正確かつ効率的に探索することで、安定性、結合親和性、特異性、pH依存性結合、および交差反応性を同時に最適化することを可能にしています。

FEP+ 残基 Scanは、MM/GBSAに比べて精度が7倍向上し、Proteinに比べて処理速度が最大20倍高速化されています。FEP+

MM/GBSA、FEP+ 残基 Scan、およびProteinFEP+ による計算結果(y軸)と、kcal/mol単位で示された相対的な実験的親和性測定値(x軸)との相関プロット。すべての計算は同一のシステム上で実行された。プロリンへの変異およびプロリンからの変異については、現時点ではFEP+ 残基 Scanの結果から除外されている。各プロットの左上にピアソン相関係数(R²)が表示されている。

タンパク質を基盤とする創薬分野全般に幅広く応用可能

複数の生物学的モダリティにわたる洗練されたワークフローを利用できる

抗体の設計

強力で安全、かつ実用化可能なモノクローナル抗体を合理的に設計する

詳細はこちら
ペプチド創薬

構造 を用いたインシリコ手法によるペプチド系医薬品の設計

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酵素工学

構造 を基盤とした設計手法を用いて、酵素を効率的に最適化する

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出版物

自由エネルギー摂動(FEP)とは何ですか?

FEP+ の利用が初めての方は、相対結合自由エネルギー摂動(FEP)計算の基本概念について、改めて確認しておきましょう。

ドキュメントとチュートリアル

Schrödingerのソフトウェアに関するよくある質問への回答や、その活用におけるベストプラクティスをご確認ください。

ライフサイエンス チュートリアル

学習パス:環状ペプチドのモデリング

創薬における環状ペプチドのためのツールとワークフローに関する体系的な概要。

ライフサイエンス ドキュメント

FEP+

実験手法と同等の精度で、物理学に基づく自由エネルギー摂動技術を用いたタンパク質-リガンド 結合の計算機による予測。

ライフサイエンス ドキュメント

学習パス:バーチャルスクリーニング

バーチャルスクリーニング・パイプラインの構築方法に関する体系的な概要。

ライフサイエンス チュートリアル

定pH分子動力学法を用いたタンパク質pKa の予測

タンパク質残基 のpKa 値およびプロトン化状態を決定する。

ライフサイエンス チュートリアル

タンパク質FEP+ に基づく設計を用いたT4リゾチームの熱安定性の向上

変異によってタンパク質の埋没空洞を埋めることで、タンパク質の熱安定性を高めるFEP+ 。

生物学的製剤 チュートリアル

FEP+ による残基 スキャンを用いた、影響の大きい変異の特定

FEP+ 残基 を用いたスクリーニングを行い、変異がタンパク質間相互作用系の安定性および親和性に及ぼす影響を特定する。

ライフサイエンス チュートリアル

単一点変異の熱安定性予測のためのタンパク質自由エネルギー摂動モデルの検証

T4リゾチームの単一塩基置換変異について熱安定性の予測を得るため、タンパク質FEPシミュレーションの準備、実行、および解析を行う。

関連商品

研究プロジェクトを前進させるために活用できる関連の計算技術について、詳しくご覧ください。

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組織のニーズに応えるソフトウェアとサービス

ソフトウェアプラットフォーム

分子モデリング、設計、およびコラボレーションのための包括的で使いやすいプラットフォームを活用し、デジタル創薬ワークフローを導入しましょう。

研究支援サービス

Schrödingerの計算科学に関する専門知識と大規模な技術を活用し、創薬プロセスの重要な段階において、お客様のプロジェクトを前進させましょう。

サポートとトレーニング

初心者から経験豊富なユーザーまでを対象に設計された、専門家のサポート、学習教材、およびトレーニングリソースをご利用いただけます。