APR 30, 2026
对虚拟蛋白质-配体分子对接 工作流与实验台实验的并行探索
计算分子建模 工具为现代有机化学课程中的学生提供了极具相关性和意义的学习机会。我们在有机化学II课程中实施了一个为期一学期的实验项目，让学生在进行小分子药物化合物的传统台式合成的同时，探索计算机辅助药物发现（CADD）方法。 学生以小组形式合作，既要完成虚拟的蛋白质-配体分子对接 工作流程，又要进行已知喹诺酮类抗生素类似物的实验台合成。学生通过“Schrödinger 教学平台”使用Maestro ，下载DNA旋转酶和拓扑异构酶IV与氟喹诺酮结合的PDB结构；在分子对接 上准备并验证结构；评估药物与结合位点 之间的关键非共价相互作用；然后对实验室合成的喹诺酮类类似物进行对接以进行评估。 虽然该项目是为在有机化学I课程中已具备一定Maestro 平台使用经验的第二学期有机化学学生设计的，但本课程也可根据需要调整，适用于刚刚开始引入虚拟分子建模 工具的课程。学生的学习成果将基于学期末针对该项目的实验汇报进行评估。我们将提供一份项目学生指南的PDF文件，其中包含PDB编号、蛋白质制备方法、讨论问题以及有用的参考文献。
我们的演讲嘉宾
易金·戈尔斯克
缅因州斯坦迪什市圣约瑟夫学院化学系副教授
金伊珍·戈斯克（Yi Jin Kim Gorske）博士是缅因州斯坦迪什市圣约瑟夫学院的化学副教授。她先是在加州大学伯克利分校获得分子与细胞生物学学士学位，随后在威斯康星大学麦迪逊分校完成有机化学博士学位，期间主要致力于合成方法学开发和天然产物全合成研究。 在进入学术界之前，戈尔斯克博士曾在新泽西州的一家生物制药公司担任药物化学家，从事抗菌药物的研发工作。她目前在圣约瑟夫学院讲授有机化学和药物化学课程，主要致力于设计和合成可作为抗病毒和抗菌剂的小分子化合物。