演讲者：

Koushik Kasavajhala，二级高级科学家，Schrödinger

摘要：

靶点 蛋白水解靶向嵌合体（PROTACs）是药物发现领域的一个新兴方向。与通过阻断蛋白质活性起作用的传统小分子抑制剂不同，PROTACs通过诱导蛋白质降解来调节蛋白质功能。它们将靶蛋白（靶点 ）与E3泛素连接酶置于近距离，从而导致靶蛋白发生泛素化，并随后被蛋白酶体降解。 设计PROTAC(蛋白降解靶向嵌合体) 涉及对以下部分的优化 ：分别与靶点 蛋白和泛素连接酶结合的独立结合域（也称为“弹头”）、连接两个弹头的连接子，以及三元复合物（靶点 蛋白 + 泛素连接酶 +PROTAC(蛋白降解靶向嵌合体) ）的形成。 在本场网络研讨会中，我们将介绍施罗丁格（Schrodinger）的高级计算工具包，该工具包可用于生成和评估潜在的三元复合物，并优化“弹头”和连接子。该工具包结合了蛋白质-蛋白质相互作用分析（分子对接 ）、连接子采样、增强采样方法以及自由能微扰 （FEP+ ）计算，以设计出具有更高降解剂 活性的PROTAC。