발언자:

코우시크 카사바잘라, 선임 연구원 II, Schrödinger

초록:

단백질 분해 표적 키메라(PROTAC)는 신약 개발 분야에서 새롭게 부상하고 있는 분야입니다. 단백질 활성을 차단하는 기존의 소분자 억제제와 달리, PROTAC은 단백질 분해를 유도하여 단백질 기능을 조절합니다. PROTAC은 표적 단백질과 E3 유비퀴틴 리가아제를 근접하게 배치함으로써, 표적 단백질의 유비퀴틴화를 유도하고, 이에 따라 프로테아좀에 의한 분해를 촉진합니다. PROTAC을 설계하는 과정에는 표적 단백질과 리가제에 결합하는 개별 결합 도메인(워헤드라고도 함), 두 워헤드를 연결하는 링커, 그리고 삼원 복합체(표적 단백질 + 리가제 + PROTAC)의 형성을 최적화하는 작업이 포함됩니다. 이번 웨비나에서는 잠재적인 삼원 복합체를 생성 및 평가하고, 워헤드와 링커를 최적화하기 위한 슈뢰딩거(Schrodinger)의 첨단 계산 툴킷을 소개합니다. 이 툴킷은 단백질-단백질 도킹, 링커 샘플링, 강화된 샘플링 방법, 자유 에너지 섭동(FEP+) 계산을 결합하여 분해 활성이 향상된 PROTAC을 설계합니다.