FEP+를 활용한 신약 설계용 자유 에너지 계산
소분자 선도 물질 최적화를 위한 상대 결합 FEP+ 계산 실행, 분석 및 문제 해결
상세 정보
모듈
5
소요 시간
완료까지 3주 / 약 15시간 소요
난이도
고급
비용
비학생 이용자의 경우 1,435달러
학생 및 박사후 연구원: 870달러
과정 일정
강의 등록 시 선호하는 시작일과 종료일을 선택할 수 있습니다. 해당 기간 내에 원하는 일정에 맞춰 비동기식으로 강의를 수강할 수 있습니다.
개요
계산적 방법은 소분자와 단백질 표적 간의 결합 친화도를 예측함으로써 신약 개발 프로젝트를 촉진하는 데 도움이 될 수 있습니다. 슈뢰딩거의 FEP+와 같은 자유 에너지 섭동 기법은 신약 설계 과정에서 결합 친화도에 대한 정확한 예측을 제공할 수 있습니다. 그러나 이러한 계산은 전문 지식이 필요한 고도의 계산입니다. 전산 화학자 및 신약 설계자들은 FEP+ 실행에 대한 실습 교육을 통해 모범 사례를 적용하고 결과에 대한 철저한 분석을 수행할 수 있습니다. 이 과정에서는 슈뢰딩거의 FEP+ 작동 원리에 대한 개요를 파악하고, 상대적 결합 친화도 FEP+ 기술을 여러 데이터 세트에 적용하며, 일반적인 분석 기법을 수행하는 방법을 배우게 됩니다.
이 과정은 수료증과 배지를 취득하여 전문성을 높이고 이력서를 강화하고자 하는 분들에게 이상적입니다.
- 업계 최고의 슈뢰딩거 FEP+를 직접 체험해 보세요
- 진행 중인 프로젝트에 직접 적용할 수 있는 방법을 배워 연구를 빠르게 시작해 보세요.
- FEP+ 맵 생성부터 pKa 보정에 이르기까지 다양한 주제를 배워보세요
- 새로운 화합물을 설계하고 전향적 FEP+를 수행하여 사례 연구를 완료함으로써, 본 강좌의 내용을 숙지했음을 입증하십시오.
- 과제 및 과정 관련 문의에 대해 슈뢰딩거 교육 팀 전문가의 검토 및 피드백 혜택 받기
- 과정 기간 내에 편한 시간에 맞춰 자유롭게 학습 자료를 진행하세요.
이 과정에는 강의에 필요한 라이선스와 컴퓨팅 리소스가 포함된 웹 기반 슈뢰딩거 소프트웨어 버전 이용 권한이 제공됩니다.
학습 내용
자유 에너지 섭동의 기초
자유 에너지 섭동 기법의 역사 및 이론을 이해하고, 이러한 기법이 신약 개발 프로그램에 이미 어떤 영향을 미치고 있는지 파악한다.
FEP+용 구조물 준비
상대적 결합 FEP+ 작업을 위한 단백질 및 리간드 준비 모범 사례
일반적인 문제 해결 방법
FEP+ 성능을 향상시키기 위해 시뮬레이션 시간 연장, pKa 보정, 사용자 정의 코어(Custom Cores) 활용, REST 영역에 단백질 잔기 추가 등을 탐구함
프로젝트에 FEP+ 적용하기
실무 중심의 사례 연구를 통해 여러분의 역량을 발휘하여, 새로운 비장 티로신 키나제(Syk) 억제제를 설계하고 FEP+를 활용하여 그 특성을 전향적으로 분석해 보십시오.
모듈
모듈 1
2시간
자유 에너지 섭동의 소개 및 배경 설명
비디오
강좌 개요: FEP+를 활용한 신약 설계용 자유 에너지 계산
체크포인트
명예 규약 동의서
비디오
자유 에너지 섭동 및 FEP+ 방법 소개
모듈 완료 평가
모듈 2
4시간 + 연산 시간
FEP+용 구조물 준비
비디오
FEP+ 모범 사례 및 구조물 전처리 작업의 중요성
동영상 자습서
- 단백질의 정제 및 검증
- 리간드 합성 및 정렬
모듈 완료 평가
모듈 3
3시간 + 연산 시간
상대 결합 FEP+: 계산 설정 및 실행
동영상 자습서
- FEP+ 패널 소개
- 맵 생성 및 회고적 상대 결합 친화도 FEP+ 계산 실행
모듈 완료 평가
모듈 4
4시간 + 연산 시간
FEP+ 작업 분석 및 문제 해결
동영상 튜토리얼
FEP+ 결과 분석
과제
상관도 그래프 생성
튜토리얼
FEP+ 결과 문제 해결
모듈 완료 평가
모듈 5
2시간 + 연산 시간
소분자 약물 설계: FEP+ 기반 사례 연구
튜토리얼
- 새로운 화합물 설계 및 전향적 상대 결합 친화도 FEP+ 계산 수행
- FEP+ 맵 병합: 신규 및 기존에 검증된 화합물 분석
과제
사례 연구 결과를 검토하고 논의한다
과정 수료 및 인증
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차세대 과학자들을 적극 지원하며, 제한된 자원을 가진 분들에게도 기회를 제공하기 위해 노력합니다. 학생, 박사후연구원, 또는 산업계 과학자로서 당사의 온라인 자격증 과정을 수강할 때 활용할 수 있는 지원 옵션을 확인하고 지금 등록해 보세요!
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자주 묻는 질문
온라인 코스 수강료는 얼마인가요?
가격은 과정 및 참가자 유형에 따라 다릅니다. 학생 수강생의 경우 입문 과정은 150달러, 재료과학 번들은 305달러, 고급 과정은 870달러의 학생 할인가가 적용됩니다. 일반(기업) 참가자의 경우 입문 과정은 575달러, 고급 과정 및 번들은 1435달러입니다.
코스는 언제 시작되나요?
코스는 세션제로 운영되며, 3~6주 동안 과정과 소프트웨어에 대한 접근 권한이 제공됩니다. 각 과정 페이지에서 세션 일정과 시작일을 확인할 수 있습니다.
강의 시간은 언제인가요?
코스 세션이 시작되면 모든 강의는 비동기식으로 진행되므로, 편한 시간에 맞춰 자기주도형 동영상, 튜토리얼, 과제를 시청하고 수행할 수 있습니다.
수강료는 어떻게 결제하나요?
등록을 완료한 후 신용카드 결제 포털을 이용해 즉시 수강 신청 및 결제를 진행할 수 있습니다. 체크카드는 사용할 수 없으며 신용카드만 지원되니 참고해 주시기 바랍니다. 또한 요청 시 구매 주문서(PO)를 발급해 드릴 수 있으니, 필요한 경우 online-learning@schrodinger.com으로 이메일을 보내주십시오. 결제 방법에 대해 궁금한 점이 있으시면 자금 지원 옵션 페이지를 방문하세요.
등록하기 전에 코스를 미리 볼 수 있는 방법이 있나요?
학생들을 위한 장학 혜택이 있나요?
Schrödinger는 자원이 부족한 학생들을 지원하기 위해 최선을 다하고 있습니다. 치료제와 신소재가 발견되는 방식을 혁신하여 인류의 건강과 삶의 질을 향상시키는 것이 Schrödinger의 사명입니다. Schrödinger는 차세대 과학자들을 자랑스럽게 지원합니다. 재정적 지원이 필요함을 증명할 수 있고 지도교수의 추천서가 있는 풀타임 학생 또는 박사후연구원을 대상으로 장학 프로그램을 마련했습니다. 장학 프로그램 자격 요건에 해당하신다면 지원서를 작성해 주세요!
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강의가 끝나면 소프트웨어 이용은 종료되지만, 강의 내 일부 자료(슬라이드, 논문, 튜토리얼)는 수료 후에도 참고할 수 있도록 다운로드할 수 있습니다. 비디오, 퀴즈, 소프트웨어 이용 권한과 같은 기타 자료는 강의 기간 동안에만 제공됩니다.
강의를 수강하려면 소프트웨어에 접근할 수 있어야 하나요? 소프트웨어를 별도로 구매해야 하나요?
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