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WaterMap

一种基于结构的、最先进的方法,用于评估水溶剂化配体结合位点的能量学特性优化

背景图片 WaterMap

探索配体设计的新可能性

WaterMap 是一款用于可靠计算蛋白质结合口袋中溶剂化水分子位置和能量的先进解决方案。通过提供关键见解以指导配体设计和优化 ,WaterMap 已成为基于结构的药物设计 领域中影响深远的解决方案,这一点已在多个目前处于临床开发阶段的成功药物发现项目中得到验证。

核心能力

预测结合位点 中可位移高能水分子位置及其热力学势,以指导药物设计
深入了解驱动小分子结合的口袋性质和疏水作用力
通过可视化水合位点,可轻松解读SAR数据,并从中获得见解以提高活性,以及选择性
将 WaterMap 应用于包括酶、GPCR、溴结构域、核酸和蛋白质-蛋白质界面在内的多种系统
案例研究利用WaterMap发现一种新型、强效的ACC抑制剂

基于计算的水能学设计与评估在结合位点

利用WaterMap发现一种新型、强效的ACC抑制剂

了解Nimbus Therapeutics如何利用基于水合能的虚拟筛选 工作流程,筛选出高效、高选择性的抑制剂。

阅读案例研究

出版物

浏览采用Schrödinger 技术、发表在相关应用领域的经同行评审的出版物列表。

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SGR-1505的加速计算机辅助发现:一种用于治疗成熟B细胞恶性肿瘤的强效MALT1别构抑制剂

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基于知识和结构的15-PGDH抑制剂药物设计

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利用高能水合位点发现具有细胞抗病毒活性的、针对SARS-CoV-2主蛋白酶的强效肽醛类抑制剂

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通过连接ATP和别构位点,实现与二价EGFR激酶抑制剂的超加性结合

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基于结构的域选择性溴结构域及额外末端N端溴结构域化学探针的设计

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关于非核苷类抑制剂抑制呼吸道合胞病毒聚合酶作用的结构与机制研究

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首个ATP竞争性III型c-MET抑制剂的发现与优化

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发现了一种口服的、超越“五元规则”的Mcl-1蛋白-蛋白相互作用调节剂,该药物有望用于治疗血液系统恶性肿瘤

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通过利用非经典相互作用,发现了一类基于吡啶N-氧化物、活性强且具有口服生物利用度的第XIa因子抑制剂

文档与教程

了解常见问题的解答,并掌握使用Schrödinger软件的最佳实践。

生命科学 文档

WaterMap

采用显式水分子模型进行了高效收敛的分子动力学模拟,并对所得轨迹进行分析以聚类水合位点。

生命科学 文档

学习路径:计算靶点 分析

关于用于理解生物大分子结构与柔韧性的工具和工作流的系统性概述。

生命科学 教程

利用 WaterMap 识别结合位点 需求以及先导化合物 优化

分析 WaterMap 和 WM/MM 评分结果,以识别不稳定的水域并评估配体结合情况。

生命科学 教程

靶点 使用 SiteMap 和 WaterMap 进行分析

确定受体上的潜在活性位点。

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