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Schrödinger 数字药物研发研讨会 16:
加速蛋白质降解剂 的发现:降解剂 设计的计算策略以及优化

2025年4月16日

蛋白质降解剂(靶向蛋白质降解诱导剂)作为一种利用细胞天然降解途径来调控蛋白质功能的创新药物开发模式,正备受关注。然而,由于其双功能性结构,需要对多个要素进行优化,因此设计过程极为复杂。
Schrödinger与企业研究人员合作,开发了一种能够准确预测由两种蛋白质和双功能分子组成的三元复合体结构的计算工作流程。

在本场网络研讨会中,我们将介绍一套利用蛋白质间对接、连接子采样、元动力学以及自由能扰动计算(FEP+)的工具包,并讲解如何利用这些工具从复合物结构预测到活性优化,从而加速蛋白质降解酶的设计。此外,还将介绍基于LiveDesign平台的实时协作研究的可能性。

网络研讨会亮点

  • 蛋白质降解酶建模领域的最新动向与挑战概述
  • Schrödinger计算解决方案介绍:利用出口向量采样、HDX-MS等实验数据对三方复合物进行集合预测与过滤、复合物评分,以及利用FEP+进行连接子优化
  • LiveDesign中用于优化蛋白质降解酶设计流程的工作流演示
  • 抢先为您介绍Maestro中用于蛋白质降解建模的新面板

我们的演讲嘉宾

阿古斯·罗德里格斯-格拉尼略 博士

应用科学总监

在德克萨斯州休斯顿的莱斯大学获得生物化学博士学位。现任马萨诸塞州剑桥市应用科学团队负责人,负责美国东北部地区的客户支持工作。此外,他还从事双功能降解剂作为新型治疗方式的研究。

索尼娅·尼古拉乌,博士

应用科学二级高级科学家

我于英国曼彻斯特大学获得了化学博士学位。加入Schrödinger公司后,我不仅为客户提供科学支持,还参与了LiveDesign新建模功能的开发工作。最近,我正致力于将PROTACs工作流集成到LiveDesign中。