Schrödinger デジタル創薬セミナー 16：
タンパク質分解剤の発見を加速：分解剤の設計と最適化のための計算戦略
2025年4月16日
プロテイン・デグラダー（標的タンパク質分解誘導剤）は、細胞の自然な分解経路を利用してタンパク質機能を制御する革新的な創薬モダリティとして注目されています。しかし、その二官能性構造ゆえに、複数の要素を最適化する必要があり、設計は非常に複雑です。
Schrödingerは、企業の研究者と連携し、2つのタンパク質と2官能性分子からなる三者複合体の構造を正確に予測できる計算ワークフローを開発しました。
このウェビナーでは、タンパク質間ドッキング、リンカーサンプリング、メタダイナミクス、自由エネルギー摂動計算（FEP+）を活用したツールキットを紹介し、複合体の構造予測から活性の最適化に至るまで、タンパク質分解酵素の設計を加速する方法を解説します。また、LiveDesignプラットフォームによるリアルタイムの共同研究の可能性についても紹介します。
ウェビナーの見どころ
- タンパク質デグラダーのモデリングにおける最新の動向と課題の概要
- シュレーディンガーの計算ソリューションのご紹介：出口ベクトルサンプリング、HDX-MSなどの実験データを活用した三者複合体のアンサンブル予測とフィルタリング、複合体のスコアリング、FEP+を用いたリンカーの最適化
- LiveDesignを活用した、プロテインデグレーダーの設計プロセスを効率化するワークフローのデモ
- タンパク質デグラダーモデリング向けのMaestroの新パネルをいち早くご紹介します
登壇者
アグス・ロドリゲス＝グラニージョ博士
アプリケーションサイエンス部長
テキサス州ヒューストンにあるライス大学で生化学の博士号を取得しました。現在は、マサチューセッツ州ケンブリッジにあるアプリケーション・サイエンス・チームのリーダーとして、米国北東部地域の顧客サポートを担当しています。さらに、新たな治療法としての二官能性デグラダーの分野に関する研究も行っています。
ソニア・ニコラウ博士
アプリケーションサイエンス部門 上級研究員 II
イギリスのマンチェスター大学で化学の博士号を取得しました。シュレーディンガー入社後は、顧客への科学的サポートを行うとともに、LiveDesignにおける新しいモデリング機能の開発にも携わってきました。最近では、LiveDesignへのPROTACsワークフローの実装に注力しています。