Schrödinger 数字药物研发研讨会 17：
Schrödinger 针对基于物理理论 抗体 的分析与设计方法

施莱丁格的药物研发平台通过运用基于物理学第一性原理的计算化学技术，实现了基于蛋白质三维结构信息的高级药物设计，其软件已被全球各大制药企业广泛采用。

在本研讨会上，除了介绍使用施莱丁格（Schrödinger）的Biologics Modeling Suite：BioLumimate进行普通抗体三维建模的技术外，还将讲解利用蛋白质-蛋白质对接预测抗原抗体复合物结构，以及通过自由能扰动法（FEP）预测亲和力和稳定性等内容。此外，针对具有无序表位（Disordered epitope）且单独存在时不具备特定稳定构象的抗原，我们将探讨如何利用分子动力学（MD）模拟与正交实验数据来推断抗原-抗体复合物的结构。此外，还将介绍一些最新的前沿尝试，例如：从计算化学预测的抗体三维结构中生成描述符，并自动构建与可开发性相关的参数预测模型（该参数难以通过物理原理进行预测）；以及利用基于λ动力学的CpH-MD法对氨基酸残基进行局部pKa预测，并将其应用于pH依赖性抗原的结合以及旨在开发ADC的位点选择性功能化等领域。