APR 28, 2026

BMS-8衍生品的设计

在诺丁汉特伦特大学，本科二年级学生组建了一个模拟制药合同研究组织。在这一年中，学生们对BMS-8的衍生物进行了计算和合成探索。[1]

计算环节安排在学生进入合成实验室之前进行。根据文献[1]，学生从蛋白质数据银行（PDB）下载了已进行配体对接的蛋白质结构，并识别出关键的配体-蛋白质相互作用。 随后，学生将该结构导入GaussView，并移除除配体及相互作用残基以外的所有部分。利用该结合口袋结构，学生进行一系列计算，以测算总体结合能以及特定氢键和π堆积相互作用的能量。 在理解了配体与蛋白质残基之间各种相互作用的基础上，学生们进而研究BMS-8的衍生物，分析先前确定的配体-蛋白质相互作用中哪些可能会因配体的每种修饰而发生改变，并将这些分析结果与合成方案相结合，随后学生们将该方案带入实验室。我将分享我们的学生练习题。

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