APR 28, 2026

BMS-8の派生品の設計

ノッティンガム・トレント大学では、学士課程2年生の学生たちが、製薬分野の契約研究機関（CRO）を模した組織を結成しています。学生たちは1年間にわたり、BMS-8の誘導体について、計算化学および合成化学的な探索を行います。[1]

計算演習は、学生が合成実験室に入る前に実施されます。論文[1]に基づき、学生はProtein Data Bankからリガンド でドッキングされたタンパク質をダウンロードし、同定 から主要なリガンド-タンパク質相互作用を取得します。その後、学生は構造 をGaussViewにインポートし、リガンド および相互作用する残基 以外のすべてを削除します。この結合ポケット構造 を用いて、学生は一連の計算を行い、全体的な結合エネルギーおよび特定の水素結合やπスタッキング相互作用のエネルギーを算出します。リガンド とタンパク質残基 との間のさまざまな相互作用について理解を深めた後、学生たちは BMS-8 の誘導体について検討し、以前に特定されたリガンド-タンパク質相互作用のうち、リガンド の各修飾によってどの相互作用が変化する可能性が高いかを考察します。そして、これを合成計画に結びつけ、学生たちはその計画を実験室に持ち込みます。ここでは、当校の学生用ワークシートを共有します。

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