APR 30, 2026
一项简短的分子对接 练习,用于在课堂上介绍蛋白质-配体相互作用
摘要:
修读计算生物学(分子建模 )课程的学生能够有效地可视化并理解分子相互作用,而这些相互作用往往难以通过教科书中的静态插图来理解。本闪电演讲利用Schrödinger 教育建模工具,提供了一个可直接用于课堂的简短练习(分子对接 ),用于介绍蛋白质-配体相互作用。 学生通过可视化蛋白质靶点 、确定其活性位点、准备小分子配体并进行基础的分子对接 计算来完成此任务。随后,通过分析结合构象来识别重要的相互作用,如形状互补性、疏水接触和氢键。 由于仅需少量计算机资源,该练习旨在在一节课内完成。它可作为药理学、药物化学或生物化学本科课程中的快速实验练习或演示。该练习的重点不在于技术复杂性,而在于对分子识别和基于结构的药物设计 的概念理解。通过这种方法,学生能够更好地将抽象概念与实际的药物发现应用联系起来,这为将计算建模融入现有课程体系提供了一种有效途径。
学生学习要点:
一份用于分析蛋白质-配体相互作用的简短练习题、一份一页长的分子对接 教程,以及蛋白质和配体的示例文件。
演讲者:
帕维特拉·拉马穆尔蒂
B. S. 阿卜杜勒·拉赫曼 新月科技学院