要旨：
分子モデリングを学ぶ学生は、静的な教科書の図解だけでは理解が難しい分子間相互作用を、計算機を用いた分子モデリングを通じて効果的に可視化し、理解することができます。本ライトニングトークでは、Schrödinger の教育用モデリングツールを用いて、タンパク質–リガンド 間の相互作用を紹介する、授業ですぐに活用できる簡単なドッキング演習を紹介します。学生は、タンパク質ターゲット を可視化し、その活性部位を特定し、低分子化合物リガンド を設計し、基本的なドッキング計算を行うことで、この課題を完了します。 その後、結合姿勢を検証し、同定 形状の相補性、疎水性接触、水素結合といった重要な相互作用を考察します。必要なコンピュータリソースはごくわずかであるため、この演習は1授業時間内で完了できるよう設計されています。薬理学、医薬化学、生化学の学部課程において、簡単な実習演習やデモンストレーションとして活用できます。技術的な複雑さよりも、分子認識や構造 に基づく創薬の概念的な理解に重点を置いています。 この手法により、学生は抽象的な概念を実際の創薬応用とより深く結びつけることができ、計算モデリングを現行のカリキュラムに組み込むための有用な手段となります。

学生向けの要点：
タンパク質とリガンド の相互作用を調べるための簡単なワークシート、1ページ分のドッキングチュートリアル、およびサンプルとなるタンパク質ファイルとリガンド ファイル。

講演者：
パヴィトラ・ラマムルティ
B. S. アブドゥル・ラーマン クレセント科学技術研究所