2025年4月23日
用于发现和优化靶向RNA和DNA分子的计算策略
准确预测核酸与配体的结合，仍是当前计算方法面临的一大挑战。这一局限性制约了基于计算机模拟的方法在开发能够调节RNA和DNA活性的小分子药物（包括具有抗癌、抗病毒和抗菌潜力的药物）方面的应用。
在本场网络研讨会中，我们将展示Schrödinger的先进计算解决方案如何助力小分子对RNA和DNA系统进行精准、高效的靶向作用。 我们将演示针对基于计算的 苗头化合物 药物发现工作流所做的最新改进，这些改进能够实现对RNA受体的基于结构的药物设计 。此外，我们将重点介绍另一项研究，该研究利用相对结合自由能微扰 ，在针对RNA和DNA的药物发现项目中可靠地指导先导化合物 优化 。该研究将阐明对各类配体和受体以及各种配体-核酸结合模式进行的系统性回顾性评估。
网络研讨会亮点
- 了解相关方法，并回顾关于分子对接 小分子与RNA和DNA结合的最新研究成果，包括Glide 、SiteMap以及绝对结合。FEP+
- 探讨通过相对结合力优化RNA和DNA靶向分子的策略FEP+
我们的演讲嘉宾
阿拉·阿布拉米扬
应用科学部一级首席科学家，Schrödinger
Ara Abramyan 隶属于应用科学组，负责协助客户在其药物发现工作中使用Schrödinger的药物发现套件。除客户支持工作外，Ara 还领导涉及核酸和膜转运体系统的内部及外部合作项目，在这些项目中运用了 IFD-MD、Desmond 以及FEP+ 等工作流程。在加入Schrödinger 之前，Ara 曾在美国国立卫生研究院（NIH）担任博士后研究员，期间他利用分子动力学（MD）模拟和马尔可夫状态模型，领导了关于化合物与神经递质转运体系统结合的研究项目。 在此之前，他在费城科学大学（University of the Sciences in Philadelphia）获得博士学位，期间利用分子动力学（MD）和元动力学（metadynamics）模拟研究折叠聚合物（foldamer）及折叠聚合物-DNA系统，同时对力场进行参数化以准确描述折叠聚合物。
张加里
苗头化合物 探索项目总监，Schrödinger
张加里（Gary Zhang）博士是Schrödinger （分子对接 ）技术的产品经理。张加里带领团队致力于提升Schrödinger （分子对接 ）工具的性能并拓展其应用领域。他于杜克大学获得博士学位，研究方向为生物系统中的电荷转移路径工程；随后在斯克里普斯研究所（Scripps Research）进行博士后研究，致力于提升肽类（分子对接 ）的性能。