Shape 筛选
基于配体的、针对数百万至数十亿个分子的高效虚拟筛选
基于配体的、针对数百万至数十亿个分子的高效虚拟筛选
Shape 筛选 这是一种基于配体的工作流程,可高效地筛选 超大规模的可购买或可合成的化合物库。系统会根据与参考配体的形状重叠质量,对符合化学直觉的配体对齐结果进行评分。Shape 筛选 能够识别出具有活性的潜在苗头化合物 分子,即使这些分子在拓扑结构上与已知的参考配体不同,这也使其成为一种强大的基于配体的筛选 方法。
以比Shape GPU性能高出30%的速度存储和筛选数百亿至数千亿个分子,同时将硬盘需求降低100倍
对数百万个分子进行基于GPU加速的高通量虚拟筛选,每秒可进行约11,000次比对
在多核CPU上快速筛选数十万至数百万个分子
| 工作流程 | 描述 | 库大小 | 筛选时间 4.0B(天) | 筛选时间 6.5B(天) | 6.5B(TB)的存储空间 |
|---|---|---|---|---|---|
| 快Shape | 1D-SIM*预滤波器与Shape 处理器的组合 筛选 | > 40亿 | 5.2 | 5.5‡ | 0.4 |
| Shape GPU | GPU加速的3D筛选 | < 5.0 billion | 4.6 | 7.5‡ | 33 |
| Shape CPU | 基于CPU的3D筛选 | < 10 million | NA简体中文(大陆) | NA简体中文(大陆) | NA简体中文(大陆) |
了解 QuickShape——这是一种结合了 1D 和 3D 方法的自动化分阶段工作流程,能够对规模达数百亿分子的化合物库进行高效的 3D-Shape 筛选。
Schrödinger 已与多家领先供应商建立合作,助您访问包含数百万至数十亿种化合物的商业数据库,其中涵盖片段、先导化合物 类、近药物样及药物样化合物,涉及范围极为广泛化学空间 。





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