QSite
一款高性能的QM/MM程序
一款高性能的QM/MM程序
QSite 是一款基于多尺度 模拟 的工具,采用 QM/MM 方法,该方法融合了量子力学(QM) 和分子力学(MM) 的原理。它旨在通过对原子进行量子化学处理,准确预测反应体系的分子构型、能量及电子结构,从而为反应化学提供关键见解,这对理解存在分子间相互作用时的化学转化至关重要。QSite 同样适用于描述非反应性化学体系。
该程序之所以优于其他质量管理(QM)/物料管理(MM)程序,是因为它采用了Jaguar ,该软件在质量管理计算领域长期以来被公认为业界翘楚。
为量子力学(QM)与分子力学(MM)的接口提供了一种创新方法,专门针对蛋白质体系以及QM区域与MM区域之间的相互作用。
得益于Jaguar的先进功能,该方法在金属蛋白研究中实现了极高的精度;它能够可靠且高效地收敛到含过渡金属体系的正确基态。
提供了不同层次的理论模型来评估QM区域:哈特里-福克(Hartree Fock)、DFT 以及局部MP2。这使用户能够在计算成本与精度之间找到最佳平衡。
自动应用特殊的界面参数,使计算设置变得简单。计算结果(如分子轨道和电子密度)可在Maestro 中进行可视化展示。
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