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MacroModel

功能多样、功能齐全的分子建模 程序

MacroModel

概述

MacroModel 是一款基于力场的分子建模 工具,具备一系列先进的功能和方法,用于研究分子构象、分子运动以及分子间相互作用。这款灵活的程序可应用于多种研究领域,包括有机和无机分子及寡聚体、有机金属配合物以及复杂的生物系统。

核心能力

值得信赖的能源技术

结合高质量力场和GB/SA隐式溶剂化模型,获得可靠的能量学估计

业界领先的构象搜索

充分利用构象 提供的多种搜索方法,该软件能够处理从小分子到完整蛋白质的各类系统,并支持设置约束条件,将计算范围聚焦于特定区域,从而提高计算速度

灵活的约束条件

应用约束条件,将计算范围限定在较小区域内,以提高速度

一键高效进行连续计算

对许多不同的输入分子自动分别进行计算

集成式 作为其他众多工具的补充

提高构象 中调查和最小化操作的效率与准确性,以用于分子力学(MM) 、分子动力学 (MD) 和量子力学(QM) 的计算

多种力场选择选项

利用多种力场,包括 MM2、MM3、AMBER、AMBER94、MMFF、MMFFs、OPLS、OPLS_2005 和 OPLS4,以支持广泛的研究应用

文档与教程

了解常见问题的解答,并掌握使用Schrödinger软件的最佳实践。

生命科学 教程

使用 E-sol 模拟血脑屏障的穿透

计算溶剂化能(E-sol)值,并分析结果以评估血脑屏障(BBB)的通透性。

生命科学 教程

生成三元复合结构,以实现靶向蛋白降解剂的理性设计

生成并评估靶点-PROTAC(蛋白降解靶向嵌合体)-连接酶复合物的结构,以便构建连接子优化 。

材料科学 文献资料

MacroModel

一款基于力场的分子建模 工具,具备一系列先进的功能和方法,用于研究分子构象、分子运动以及分子间相互作用。

生命科学 文档

MacroModel

一款基于力场的分子建模 工具,具备一系列先进的功能和方法,用于研究分子构象、分子运动以及分子间相互作用。

生命科学 教程

构象 使用 MacroModel 和 ConfGen 对小分子进行分析

研究相关小分子的扭转分布,以及构象如何影响分子内和分子间相互作用。

材料科学 习题指南

键与配体的解离能

计算母体分子在不同解离位点发生解离时所释放的能量。

材料科学 习题指南

动力学蒙特卡洛(KMC)电荷迁移率

了解如何计算半导体分子器件中的电荷迁移率。

相关产品

进一步了解可用于推进您研究项目的相关计算技术。

Desmond

高性能的分子动力学 (MD) (MD)引擎,具备高可扩展性、高吞吐量和科学精度

FEP+

用于药物发现的高性能自由能计算

Glide

业界领先的配体-受体分子对接 解决方案

LigPrep

一款适用于基于结构工作流的多功能配体结构准备 工具

ConfGen

准确高效的构象 搜索解决方案

Jaguar

量子力学(QM) 用于快速、准确预测分子结构和性质的解决方案

OPLS4 和 OPLS5 力场

一个用于精确分子模拟的现代化、综合性力场

BioLuminate

面向……的综合建模平台生物制剂发现

MSMaestro

适用于材料发现的完整建模环境

出版物

浏览采用Schrödinger 技术、发表在相关应用领域的经同行评审的出版物列表。

材料科学 出版物

流动条件下的光氧化反应:一项实验与计算机模拟研究

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格卡普雷韦的开发:一种多晶型大环类药物的构象、晶体结构及高效固-固转化

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优化 含氟苯基叠氮化物作为半导体聚合物的通用光交联剂

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诱导圆二色谱法在溶液中Phase 环糊精主客体复合物的定性与定量分析中的优势

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反应动力学作为缺失的拼图:氧杂硼烷鎓离子催化反应中选择性 的起源

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ONC201化学不稳定性的分子机制及其在溶液中抑制降解的方法

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在固相Phase 合成特利普雷辛过程中树脂上二硫键的形成:Boc保护基及游离N端氨基的影响

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苯四酰胺:动态共价聚合物网络中的一种共价超分子双基元

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参与血糖稳态调节的激素肽的多态性淀粉样纳米结构表现出可逆的淀粉样蛋白形成

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π共轭聚电解质中的吸水性和吸湿性

培训与资源

在线认证课程

通过分子建模 的实践性在线课程,提升您的技能水平。这些可自主安排学习进度的课程涵盖了广泛的科学主题,并提供Schrödinger 软件的使用权限及技术支持。

教程

了解如何将Schrödinger 软件的技术和最佳实践应用于您的项目,以确保项目成功。查找培训资源、教程、快速入门指南、视频等内容。