Phase
リガンド および構造 に基づく創薬のための、使いやすいファーマコフォアモデリングソリューション
同定 ファーマコフォアスクリーニングによる新規化合物の発見
Phase これは、生物学的活性を持つことが知られている分子の立体的および電子的特徴に基づいて化合物を評価できる、直感的なファーマコフォアモデリングツールです。Phase は、リード化合物の最適化とバーチャルスクリーニングの両方での使用を目的として設計された独自の「共通ファーマコフォア認識アルゴリズム」を採用しており、タンパク質が存在しない場合でも未知の結合部位の理解を深めるのに役立ちます構造 。
主な機能
直感的なユーザーインターフェースにより、ファーマコフォアスクリーニングの設定、実行、分析を簡単に行えます
受容体 と相互作用する化学的特徴をスクリーニングし、その空間的配置を特定するとともに、その結合情報を用いて、当該化合物に結合する可能性が高い新規化合物やケモタイプを同定 する。ターゲット 受容体
タンパク質-リガンド 複合体、アポタンパク質、またはリガンドから仮説を作成し、仮説の特徴を選択的に統合してハイブリッドモデルを構築する
ファーマコフォアの構築、生成、およびスクリーニングを精密に制御する
クラス最高のOPLS4力場を用いたオプションの最小化処理により、立体構造、イオン化、およびタウトマー状態を迅速かつ徹底的にサンプリングし、phase データベースを作成します。
Enamine、MilliporeSigma、MolPort、Mculeが提供する、購入可能な化合物の完全に整備されたデータベースを活用し、すぐにスクリーニングを開始できます。
以下の用途には、既製の商用ライブラリを活用して、計算時間と労力を節約しましょう。Phase
Schrödinger 当社は、主要なプロバイダーと提携し、数百万から数十億に及ぶ化合物からなる、フラグメント、リード様、ニア・ドラッグ様、およびドラッグ様化合物の商用データベースへのアクセスを支援しています。これらは、広範な化合物空間 を網羅しています。
事例研究
計算機支援による設計と結合部位における水のエネルギー動態の評価に基づき、新規かつ強力なACC阻害剤が発見された
Nimbus社が、水和エネルギクスに基づく仮想スクリーニングワークフローを用いて、強力かつ選択性の高い阻害剤をどのように特定したかをご覧ください。
ケーススタディを読むドキュメントとチュートリアル
Schrödingerのソフトウェアに関するよくある質問への回答や、その活用におけるベストプラクティスをご確認ください。
出版物
関連する応用分野において、Schrödinger 技術を採用した査読付き論文の一覧をご覧ください。