Schrödinger の全世界のオフィスは、社員全員が休息を取り、リフレッシュするための全社的な取り組みの一環として、8月17日から21日までの1週間、休業いたします。この期間中は、お問い合わせへの対応が制限される場合がございますので、あらかじめご了承ください。科学・技術サポートチームのメンバーは、緊急のサポート案件への対応のみ行います。

ConfGen

正確かつ効率的なコンフォメーション検索ソリューション

ライフサイエンス:ConfGen

リガンド の立体構造ランドスケープを調査し、妥当で熱力学的に実現可能な構造を導き出す

ConfGenは、経験的に導き出されたヒューリスティックと物理ベースの力場計算を組み合わせた知識ベースの手法であり、低エネルギーの高品質で多様な小分子の3Dコンフォーマーを効率的に生成します。この手法により、生成されたコンフォーマーの中から生物活性を持つコンフォメーションの検出率が向上し、リガンド を用いたバーチャルスクリーニングにおけるコンフォーマー生成が劇的に高速化されます。

主な機能

効率的なコンフォメーションの生成数を減らすことで、下流のアプリケーションにおける検索速度が向上し、精度を損なうことなく濃縮効率が向上します
単一点エネルギー計算を用いて、ケースバイケースで指定された局所ねじれ極小点を同定 で正確に特定する
十分に検証済みのプリセットオプションの中から選択して、個々の設定を細かく制御するか、プロジェクトに適した速度と精度のバランスを選択してください
優れた速度と精度で、RMSDの低い生物活性コンフォメーションを再現する
注目記事ConfGenによる正確かつ迅速なコンフォメーション生成

ConfGenによる正確かつ迅速なコンフォメーション生成

ConfGenは、その卓越した処理速度と、RMSDの低い生物活性コンフォメーションを再現する能力を備えているため、リガンド を用いたバーチャルスクリーニング向けのコンフォメーション生成に最適なソリューションです。本ホワイトペーパーでは、バーチャルスクリーニング用途におけるConfGenの処理速度と精度について概説します。

ホワイトペーパーを読む

ドキュメントとチュートリアル

Schrödingerのソフトウェアに関するよくある質問への回答や、その活用におけるベストプラクティスをご確認ください。

ライフサイエンス チュートリアル

学習パス:環状ペプチドのモデリング

創薬における環状ペプチドのためのツールとワークフローに関する体系的な概要。

ライフサイエンス チュートリアル

標的タンパク質分解剤の合理的な設計を可能にするための三元複合構造の生成

ターゲット-PROTAC-リガーゼ複合体の構造を生成・評価し、リンカーの最適化を可能にする。

ライフサイエンス ドキュメント

ConfGen

オンラインヘルプやユーザーマニュアルを含むConfGenのドキュメント。

ライフサイエンス ドキュメント

学習パス:バーチャルスクリーニング

バーチャルスクリーニング・パイプラインの構築方法に関する体系的な概要。

ライフサイエンス チュートリアル

MacroModelおよびConfGenを用いた低分子の立体構造解析

関連する低分子化合物のねじれプロファイルを調査し、その立体構造が分子内および分子間の相互作用にどのように影響するかを明らかにする。

関連商品

研究プロジェクトを前進させるために活用できる関連の計算技術について、詳しくご覧ください。

FEP+

創薬のための高性能な自由エネルギー計算

Phase

リガンド および構造 に基づく創薬のための、使いやすいファーマコフォアモデリングソリューション

Shape 上映

リガンド を用いた、数百万から数十億の分子を対象とした効率的な仮想スクリーニング

出版物

関連する応用分野において、Schrödinger 技術を採用した査読付き論文の一覧をご覧ください。

ライフサイエンス 出版物

商用コンフォーマー・アンサンブル生成アルゴリズムのベンチマーク

ライフサイエンス 出版物

リガンド を用いた仮想スクリーニングおよび3次元QSARモデリングのための構造探索プロトコルの検討

ライフサイエンス 出版物

乳がんの浸潤および増殖阻害剤としてのシフォラン類の最適化、ファーマコフォアモデリングおよび3D-QSAR研究

ライフサイエンス 出版物

乳がんの増殖、遊走、浸潤を抑制する真菌由来のインドールジテルペンアルカロイド「ペニトレム」の、バイオガイデッド探索およびファーマコフォアモデリング

ライフサイエンス 出版物

ポリペプチドとGlide

ライフサイエンス 出版物

データ融合による仮想スクリーニングの精緻化:2次元フィンガープリント、形状、ドッキングからのヒット候補の統合

ライフサイエンス 出版物

LigPrep /ConfGen Suite を用いた医薬品様生物活性構造および立体構造カバレッジ:MOE および Catalyst との比較

ライフサイエンス 出版物

ConfGen:生物活性コンフォーマーを効率的に生成するための立体構造探索法

トレーニングとリソース

オンライン認定コース

実践的なオンライン分子モデリング講座で、スキルをさらに向上させましょう。これらの講座は自分のペースで学習でき、幅広い科学的なトピックを網羅しているほか、Schrödinger ソフトウェアの利用権とサポートも含まれています。

チュートリアル

プロジェクトを成功に導くために、Schrödinger ソフトウェアの技術とベストプラクティスを導入する方法をご確認ください。トレーニングリソース、チュートリアル、クイックスタートガイド、動画などをご利用いただけます。