ターゲットイネーブルメントサービス

ご興味のある「ターゲット」および「リガンド」シリーズのタンパク質をアンロックして、FEP+

時間とリソースを節約しましょう。構造に基づく設計に向けて、お客様が関心をお持ちのタンパク質-リガンド系を当社が準備いたします。実験的なX線結晶構造、低温電子顕微鏡（cryo-EM）構造、AlphaFoldによる予測構造、あるいはホモロジーモデルのいずれを起点とする場合でも、Schrödinger の科学者チームは、独自の技術と専門知識を駆使して、タンパク質-リガンド複合体を最適化・検証し、予測精度の高い構造に基づく設計を実現します。

企業やチームに最適：

• 「ヒット・トゥ・リード」とリードの最適化を加速させ、プログラムのマイルストーンを達成したい方
• 構造モデルの作成や検証に費やす時間を最小限に抑えたい方
•Schrödingerの高度な物理ベースの手法と専門知識を活用したい方

次のようなプロジェクトに最適です：

• SARデータが入手可能で、結合部位の位置も判明しているものの、ターゲットの構造データが不完全（低温電子顕微鏡、低分解能X線）であるか、あるいは存在しない（ホモロジーモデル、AlphaFoldモデル）場合
• 化学構造が当初のプロジェクトヒットやリード化合物シリーズから変化しつつあり、構造データが最適でなくなっている場合

比類なき技術と専門知識で、貴社の探索プログラムを加速させましょう

ターゲットまたはオフラインでの独自のプロジェクト向けに、デザインにそのまま使える構造を作成します。ターゲット

Schrödinger GPCRやキナーゼなど、ターゲットの幅広いクラスにおいて、FEP+ の利用を可能にすることに成功しました

Schrödinger のテクノロジーがもたらす効果を、大規模な環境で最大限に活用しましょう

本サービスには、包括的なタンパク質ターゲット評価の実施および正確な構造モデルの構築に必要な、すべての計算処理、ライセンス、およびサービス時間が含まれます。

ターゲットに関するお客様の独自の知見を、当社の計算分野における専門知識でさらに充実させましょう

Schrödinger 構造を基盤とした創薬において、困難な目標の達成を可能にしてきた長年の専門知識を活かし、FEP+

事例研究 I

課題：

ターゲットと、対象となるシリーズに属するリガンドとの複合体の約3.2Åの低温電子顕微鏡構造（構造）が得られたにもかかわらず、既知のSARを説明することはできず、このプログラムは事実上、構造解析の観点からは実用化されなかった。

結果：

我々のアンサンブルによる試行錯誤アプローチにより、別のリガンド結合様式を同定することに成功したほか、結合に不可欠な、わずかではあるが重要なタンパク質の微調整も特定できた。この結合様式は、構造生物学チームが提案したモデルとは逆の向きであったものの、実験データに合致し、さらに重要なことに、既知のすべてのSARを予測することができた。

事例研究 II

課題：

柔軟なタンパク質ターゲットに対する一連の低分子阻害剤の開発は、設計の指針となる構造的知見の欠如に加え、ホモログに対するオフターゲット活性も認められたことから、その限界に達しつつあった。

結果：

Schrödinger これにより、ターゲットおよびanti-ターゲットの両方において、対象となるシリーズに関するFEP+ の正確な予測が可能となった。重要なことに、この解析により、リガンドが結合するために必要な特定のループおよび側鎖の動きが明らかになった。さらに注目すべきは、2つのタンパク質が極めて類似しているにもかかわらず、異なる結合様式が明らかになったという点であり、その結果は直感に反するものだった。

構造情報のすべてのレベルからFEP+ を有効にする

テンプレートに基づくホモロジーモデルやAlphaFoldモデルから着手する場合でも、不完全な低温電子顕微鏡（cryo-EM）構造や実験的X線結晶構造をお持ちの場合でも、Schrödingerのチームは、お客様の独自のプロジェクトを構造的に実現するために必要な科学的専門知識と計算リソースを備えています。