Schrödinger の全世界のオフィスは、社員全員が休息を取り、リフレッシュするための全社的な取り組みの一環として、8月17日から21日までの1週間、休業いたします。この期間中は、お問い合わせへの対応が制限される場合がございますので、あらかじめご了承ください。科学・技術サポートチームのメンバーは、緊急のサポート案件への対応のみ行います。

DeepAutoQSAR

予測型機械学習モデルの学習および適用に向けた、自動化され、拡張性のあるソリューション

DeepAutoQSAR

最先端の手法を用いて、高性能な機械学習モデルを構築する

DeepAutoQSARは、化学構造 に基づいて分子特性を予測できる機械学習(ML)ソリューションです。この自動化された教師あり学習パイプラインにより、初心者から経験豊富なユーザーまで、最高水準の定量的構造 活性・特性相関(QSAR/QSPR)モデルを学習・推論することが可能になります。

主な機能

完全に自動化されたワークフローでモデル構築を効率化

記述子やフィンガープリントを自動的に計算し、複数の機械学習アーキテクチャを用いたモデルを作成し、モデルの性能を評価します。

プロジェクト固有の記述子を使用して、モデルをプロジェクトに合わせてカスタマイズする

DeepAutoQSARによって生成された記述子に加えて、あるいはその代わりに、CSV形式で独自の記述子を提供することで、低分子だけでなく、ポリマー、有機エレクトロニクス、触媒反応など、幅広い用途に活用できます。

ベストプラクティスを活用してモデルの最適化を図る

QSAR/QSPRのベストプラクティスを活用し、予測モデルの性能を最大限に確保しつつ、過学習やモデルの性能の誤った評価が生じる可能性を最小限に抑える。

モデルの信頼度推定値を用いて適用範囲を把握する

DeepAutoQSARは、モデルの予測結果とともに不確実性の推定値を提供し、モデルの学習データセットの範囲外にある可能性のある候補分子について生成された予測を、どの程度信頼すべきかを判断するのに役立ちます。

結果を可視化・分析し、さらなる知見を得る 

ターゲット の特性に対する各原子の寄与度を色分けして可視化し、新規化学構造の創案を促進します。Maestro でDeepAutoQSARのメトリクスレポートやプロットを可視化・分析し、さらなる実験を可能にします。これにより、どのモデルアーキテクチャが最も効果的か、またモデルがホールドアウトセットに対してどのように汎化するかについて、迅速に把握できます。 

小規模なデータセットから大規模なデータセットまで対応可能なスケーラブルなトレーニング

小規模なデータセットでは、ブーステッドツリーなどの古典的な機械学習手法を用いる一方で、グラフニューラルネットワークやその他の最新の深層学習アプローチを用いて、最大規模のQSAR/QSPRモデルにも対応します。  

事例紹介とウェビナー

Schrödinger の技術が、現実の研究課題の解決にどのように活用されているかをご覧ください。

ライフサイエンス ウェビナー

創薬における物理ベースのモデリングと機械学習アプリケーションの融合

創薬における機械学習の手法はますます普及しつつあり、さまざまな分野で活用されています。

ライフサイエンス 事例研究

固形がんの治療を目的とした、高選択性Wee1阻害剤の高精度かつ計算機支援による探索

ライフサイエンス 事例研究

包括的なデジタルケミストリー戦略を用いた新規D-アミノ酸オキシダーゼ阻害剤のリード化合物設計

ライフサイエンス ウェビナー

現代のヒット曲発見のトレンド:超大型スクリーンが機械学習を活用する方法

従来の構造 を用いた仮想スクリーニングは、プロジェクトを推進するための多様なヒット化合物の発見において成果を上げてきたものの、ヒット率、ヒット化合物の化学型の多様性、探索可能な知的財産(IP)領域、および最適化されていないヒット化合物の活性 といった点において、依然として大幅な改善の余地がある。

ライフサイエンス ウェビナー

SchrödingerのBiologics Suiteを用いた集計スコアリングおよび責任予測

ドキュメントとチュートリアル

Schrödingerのソフトウェアに関するよくある質問への回答や、その活用におけるベストプラクティスをご確認ください。

ライフサイエンス チュートリアル

学習パス:環状ペプチドのモデリング

創薬における環状ペプチドのためのツールとワークフローに関する体系的な概要。

ライフサイエンス ドキュメント

DeepAutoQSAR

機械学習(ML)を用いて、化学構造 に基づいて分子特性を予測する。

ライフサイエンス ドキュメント

学習パス:バーチャルスクリーニング

バーチャルスクリーニング・パイプラインの構築方法に関する体系的な概要。

ライフサイエンス チュートリアル

DeepAutoQSARを用いたADMETモデルの学習と評価

大規模なデータセットを用いて、水溶性を予測するための2つのモデルを構築し、検証する。

関連商品

研究プロジェクトを前進させるために活用できる関連の計算技術について、詳しくご覧ください。

仮想クラスター

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Glide

業界をリードするリガンド-受容体 ドッキングソリューション

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Jaguar

分子構造および物性を迅速かつ正確に予測するための量子力学に基づく手法

LiveDesign

デジタル分子設計のための総合ラボ

MSインフォマティクス

材料科学分野向けの自動機械学習ツール

Quantum ESPRESSO インターフェース

ナノスケールの量子力学シミュレーションのための統合型グラフィカルユーザーインターフェース

出版物

関連する応用分野において、Schrödinger 技術を採用した査読付き論文の一覧をご覧ください。

材料科学 出版物

機械学習と密度汎関数理論の統合による導電性ポリマーのバンドギャップおよび再配列エネルギーの予測

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ドーパントを含まない正孔輸送材料に基づく、ペロブスカイト太陽電池の光電特性をインシリコで予測するための機械学習アプローチ

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重合反応用ピンサー触媒の機械学習に基づく設計

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「Pathfinder」を活用した化合物空間 探索と、Glide (IFD)およびQSARに基づくアクティブラーニング手法を併用した多パラメータ最適化による、FEP+ 計算に向けたSARS-CoV-2 PLpro阻害剤の設計案の優先順位付け

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結晶の機械学習記述子のベンチマーク

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新規OLED材料の設計に向けた機械学習

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生物学的製剤における定量的構造-プロパティ関係の予測のための記述子セット

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アクティブラーニングが、有機エレクトロニクス用ホール輸送材料の設計と最適化を加速させる

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深層ニューラルネットワークとハイスループット分子シミュレーションを活用した、目的指向型生成モデルによる有機電子材料の設計

トレーニングとリソース

オンライン認定コース

実践的なオンライン分子モデリング講座で、スキルをさらに向上させましょう。これらの講座は自分のペースで学習でき、幅広い科学的なトピックを網羅しているほか、Schrödinger ソフトウェアの利用権とサポートも含まれています。

チュートリアル

プロジェクトを成功に導くために、Schrödinger ソフトウェアの技術とベストプラクティスを導入する方法をご確認ください。トレーニングリソース、チュートリアル、クイックスタートガイド、動画などをご利用いただけます。