JUN 11, 2026
オフターゲット 化合物 結合の解明に向けた物理学に基づくアプローチ：インシリコキナーゼパネル
C&EN主催：
タンパク質結合部位の構造 （構造）とfunction（機能）を理解することは、創薬全般に適用される構造 （分子ダイナミクス）に基づくアプローチにとって有益な背景知識となる。結合部位の探索、結合部位の特性評価、および化合物 （結合）における潜在的な結合姿勢の検討を行うために、さまざまな計算ツールが開発されてきた。これらのアプローチは、主に標的となる分子に関する研究を支援するために用いられているが、本稿では、潜在的なoff-ターゲット （非標的）相互作用の探索への応用について考察する。
本プレゼンテーションでは、Schrödinger社のIFD-MDおよびFEP手法に基づくワークフローを、インシリコキナーゼパネルに適用した評価結果について解説します。キナーゼおよび非キナーゼのターゲットにおける適用例についても考察します。これらのモデリング手法は、実験データと併せて活用され、医薬化学プログラムにおける構造-活性関係の解明を支援しています。
主な学習目標：
- 絶対結合自由エネルギー計算を用いた親和性予測の実現
- 実験データとの比較を可能にするため、タンパク質のひずみをオフセットとして含める
- キナーゼ関連のリスクの特定――キナーゼを標的としない低分子化合物プログラムにおいても
- in silicoによるオフターゲット 結合の活用による、オフターゲット 相互作用の検出およびリスク低減
参加対象者：
- 医薬品化学者
- 毒物学者
- 計算化学者およびモデラー
- 創薬のリード化合物
講演者
エド・ミラー
ライフサイエンス・ソフトウェア担当副社長、Schrödinger
ライフサイエンス・ソフトウェア担当副社長のエドワード・ミラー氏は、2014年にSchrödinger に入社し、構造 を基盤とした創薬の適用領域を、困難なターゲットやオフターゲットへと拡大することを担当しています。 ミラー博士はコロンビア大学で博士号を取得し、在学中には米国エネルギー省（DOE）の研究フェローシップを授与されました。リチャード・フライズナー教授の下で行った博士論文の研究では、幅広いタンパク質ファミリーにわたるループの立体構造を正確にモデル化する手法の開発に取り組みました。近年の研究では、誘導適合ドッキングおよびタンパク質構造 の精緻化に向けた手法の開発に注力しています。