JUN 11, 2026
표적 외 화합물의 결합을 탐구하기 위한 물리 기반 접근법:컴퓨터 시뮬레이션을 통한키나아제 패널
C&EN 주최:
단백질 결합 부위의 구조와 기능을 이해하는 것은 신약 개발 전반에 걸쳐 적용되는 구조 기반 접근법에 유용한 맥락을 제공한다. 결합 부위를 탐색하고, 결합 부위의 특성을 평가하며, 잠재적 화합물의 결합 자세를 조사하기 위해 다양한 전산 도구가 개발되어 왔다. 이러한 접근법은 주로 목표 표적에 대한 연구를 뒷받침하는 데 사용되지만, 여기서는 잠재적인 비표적 상호작용을 탐구하는 데 이를 적용하는 방안을 고찰한다.
본 발표에서는 Schrödinger의 IFD-MD 및 FEP 방법론을 기반으로 한 워크플로우를,인실리코키나제 패널에 적용하여 평가한 결과를 설명합니다. 키나제 및 비키나제 표적에 대한 적용 사례가 논의됩니다. 이러한 모델링 접근법은 실험 데이터와 병행하여 적용되어, 의약화학 프로그램에서 ‘ 구조-활성 상관 관계 ’에 대한 탐구를 뒷받침했습니다.
주요 학습 목표:
- 절대 결합 자유 에너지 계산을 통한 친화도 예측 가능화
- 실험 데이터와의 비교를 가능하게 하기 위해 단백질 변형을 보정값으로 포함
- 키나아제와 무관한 소분자 개발 프로그램에서도 키나아제 관련 문제점 파악하기
- 인 실리코 오프타겟 결합을 활용한 오프타겟 상호작용의 탐지 및 위험 완화
참가 대상:
- 의약화학자
- 독성학자
- 계산 화학자 및 모델링 전문가
- 신약 개발 유망 후보물질
연사 소개
에드 밀러
생명과학 소프트웨어 부문 부사장, Schrödinger
생명과학 소프트웨어 부문 부사장인 에드워드 밀러(Edward Miller)는 2014년 Schrödinger 에 합류했으며, 구조 기반 신약 개발의 적용 영역을 까다로운 표적 및 비표적 영역으로 확대하는 업무를 담당하고 있습니다. 밀러 박사는 컬럼비아 대학교에서 박사 학위를 취득했으며, 재학 중 미국 에너지부(DOE) 연구 펠로우십을 수여받았습니다. 리처드 프라이스너(Richard Friesner) 교수와 함께 진행한 박사 학위 논문 연구에서는 광범위한 단백질 계열에 걸쳐 루프 구조를 정확하게 모델링하는 방법론을 개발하는 데 주력했습니다. 최근에는 유도적 적합(induced fit) 도킹 및 단백질 구조 정밀화 방법론 개발에 주력하고 있습니다.