Schrödinger の全世界のオフィスは、社員全員が休息を取り、リフレッシュするための全社的な取り組みの一環として、8月17日から21日までの1週間、休業いたします。この期間中は、お問い合わせへの対応が制限される場合がございますので、あらかじめご了承ください。科学・技術サポートチームのメンバーは、緊急のサポート案件への対応のみ行います。

マクロモデル

汎用性が高く、充実した機能を備えた分子モデリングプログラム

マクロモデル

概要

MacroModelは、力場に基づく分子モデリングツールであり、分子のコンフォメーション、分子運動、および分子間相互作用を解析するためのさまざまな高度な機能や手法を備えています。この柔軟性の高いプログラムは、有機・無機分子やオリゴマー、有機金属錯体、さらには複雑な生物学的システムなど、多岐にわたる研究用途に活用することができます。

主な機能

信頼できるエネルギー技術

高品質な力場とGB/SA暗黙的溶媒化モデルを組み合わせて、エネルギー計算の信頼性の高い推定値を得る

業界をリードする構造検索

低分子からタンパク質全体に至るまで幅広い系に対応可能な、多種多様なコンフォメーション探索手法を活用できます。また、制約条件を設定したり、計算範囲を特定の領域に絞り込んだりすることで、計算速度を向上させることができます。

柔軟な制約条件

計算を特定の小さな領域に絞り込むために制約を適用し、処理速度を向上させる

ワンクリックで効率的な連続計算

多種多様な入力分子に対して、個別に計算を自動的に実行する

他の多くのツールと連携して機能する

分子力学、分子動力学、および量子力学計算における構造解析と最小化の効率と精度を向上させる

多彩な力場の選択オプション

MM2、MM3、AMBER、AMBER94、MMFF、MMFFs、OPLS、OPLS_2005、OPLS4など、多様な力場を駆使して、幅広い研究用途に対応します

ドキュメントとチュートリアル

Schrödingerのソフトウェアに関するよくある質問への回答や、その活用におけるベストプラクティスをご確認ください。

ライフサイエンス チュートリアル

E-solを用いた血液脳関門透過のモデリング

溶媒和エネルギー(E-sol)の値を算出し、その結果を分析して、血液脳関門(BBB)の透過性を評価する。

ライフサイエンス チュートリアル

標的タンパク質分解剤の合理的な設計を可能にするための三元複合構造の生成

ターゲット-PROTAC-リガーゼ複合体の構造を生成・評価し、リンカーの最適化を可能にする。

材料科学 資料

マクロモデル

力場に基づく分子モデリングツールであり、分子のコンフォメーション、分子運動、および分子間相互作用を解析するためのさまざまな高度な機能や手法を備えています。

ライフサイエンス ドキュメント

マクロモデル

力場に基づく分子モデリングツールであり、分子のコンフォメーション、分子運動、および分子間相互作用を解析するためのさまざまな高度な機能や手法を備えています。

ライフサイエンス チュートリアル

MacroModelおよびConfGenを用いた低分子の立体構造解析

関連する低分子化合物のねじれプロファイルを調査し、その立体構造が分子内および分子間の相互作用にどのように影響するかを明らかにする。

材料科学 チュートリアル

ボンドおよびリガンド の解離エネルギー

さまざまな解離部位における親分子の解離に伴うエネルギーを計算せよ。

材料科学 チュートリアル

キネティック・モンテカルロ(KMC)による電荷移動度

半導体分子デバイスにおける電荷移動度の計算方法を学びましょう。

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出版物

関連する応用分野において、Schrödinger 技術を採用した査読付き論文の一覧をご覧ください。

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流動条件下における光酸化反応:実験的およびインシリコによる研究

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トレーニングとリソース

オンライン認定コース

実践的なオンライン分子モデリング講座で、スキルをさらに向上させましょう。これらの講座は自分のペースで学習でき、幅広い科学的なトピックを網羅しているほか、Schrödinger ソフトウェアの利用権とサポートも含まれています。

チュートリアル

プロジェクトを成功に導くために、Schrödinger ソフトウェアの技術とベストプラクティスを導入する方法をご確認ください。トレーニングリソース、チュートリアル、クイックスタートガイド、動画などをご利用いただけます。