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JUN 15, 2023

Schrödingerパッケージを用いて、上級レベルのバイオインフォマティクス/生化学/分子モデリングの講義で、コンピュータ支援創薬(CADD)を指導する

コンピュータ支援創薬(CADD)は、現代の創薬および医薬品開発プロセスにおいて不可欠な要素となっています。学生にCADDの必須スキルを身につけさせるためには、バイオインフォマティクス、生化学、分子モデリングの各科目のカリキュラムに、関連するツールやソフトウェアパッケージを取り入れることが不可欠です。本講演では、上級コースの学生に対するCADDの概念教育において、広く利用されている計算化学ツールスイートである「Schrödinger Small-Molecule Drug Discovery Suite」を効果的に活用した事例を紹介します。Schrödinger パッケージは、ホモロジーモデリング、分子ドッキング、バーチャルスクリーニング、分子動力学シミュレーションのための包括的なモジュールと機能を提供しています。学生にこの強力なソフトウェアパッケージを紹介することで、合理的な創薬のための計算技術を活用する実践的な経験を積むことができます。本講演では、Schrödinger パッケージをカリキュラムに統合することによる潜在的な利点、課題、および戦略について論じ、特にCADDの原理に対する学生の理解を深め、批判的思考能力を育成し、将来の研究や産業界での応用に向けた実践的なトレーニングを提供することに焦点を当てます。 さらに、学習体験を強化し、学際的なアプローチを促進するために、実世界のケーススタディや共同プロジェクトを取り入れることの重要性を強調する。上級コースにSchrödinger パッケージを取り入れることで、学生は貴重な計算スキルを身につけ、急速に進化する創薬・設計の分野に貢献するための準備をより万全に整えることができる。

講演者

チュン・ウー

ローワン大学

チュン・ウー博士は、ローワン大学の化学・生化学学科および生物・生物医学科学科に兼任で所属する終身在職権を持つ准教授です。デラウェア大学で博士号を取得し、在学中はタンパク質の力場を開発し、アミロイド形成性ペプチドの分子動力学シミュレーションを行いました。その後、カリフォルニア大学デービス校およびサンタバーバラ校でポスドク研究員として研修を受け、アミロイド形成性ペプチドのオリゴマーのモデリングを研究しました。 ローワン大学では、ゲノムデータセットを用いて、SARS-CoV-2やその他の病原体の分子進化を最も適切に説明するだけでなく、これらの感染症を治療するための第一世代および次世代のワクチンや医薬品を開発するために、ゲノム内のホットスポットを正確に同定 するための新しい進化理論(準中立的平衡選択理論/NNBST)を研究室で開発している。 また、分子ドッキング、ホモロジーモデリング、分子動力学シミュレーションを活用し、彼のコンピュータ支援創薬(CADD)研究室では、新規創薬に向けた様々なタンパク質受容体とリガンド間の結合相互作用を調査しています。実験グループと協力して、ウー研究室は、抗がん剤、抗ウイルス剤、神経疾患治療薬としての可能性を秘めた新規タンパク質受容体や低分子化合物の発見を目指しており、タンパク質および核酸の安定化のためのイオン液体の最適化にも取り組んでいます。 査読付き論文92編以上、PIおよび共同PIとして獲得した外部助成金の総額は150万ドル、CPU時間330万時間を超え、h指数は35、総被引用数は8857回以上を記録している。計算生化学、分子モデリング・シミュレーション、およびCADDの分野における彼の貢献は、同業者から広く認められている。 国内外の学会や中国の一流研究機関から講演の招待を受けており、2021年にはインドネシア教育文化省から「ワールドクラス教授」に選出された。研究に加え、チュン氏は学部生および大学院生への教育と指導にも情熱を注いでいる。 ローワン大学では、30名以上の修士課程学生と100名以上の学部生を指導し、その研究成果として28+23編の論文および69+83件のポスター発表を実現している。