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JUN 15, 2023

Schrödinger 패키지를 활용하여 상급 수준의 생물정보학/생화학/분자모델링 과정에서 컴퓨터 지원 설계( 약물 설계 , CADD)를 가르칩니다.

컴퓨터 지원 약물 설계( 약물 설계 , CADD)는 현대 신약 발굴 및 개발 과정에서 없어서는 안 될 핵심 요소로 자리 잡았습니다. 학생들에게 CADD에 필요한 필수 역량을 갖추게 하려면, 생물정보학, 생화학, 분자 생물학( 분자모델링 ) 과정의 교육 과정에 관련 도구와 소프트웨어 패키지를 반드시 포함시켜야 합니다. 본 발표에서는 상급 과정 학생들에게 CADD 개념을 가르치는 데 널리 사용되는 계산 화학 도구 모음인 ‘ Schrödinger 소분자 신약 발굴 제품군(Small-Molecule Drug Discovery Suite)’을 효과적으로 통합한 사례를 소개합니다. Schrödinger 패키지는 상동 모델링, 분자 도킹, 가상 스크리닝, 분자 동역학( 분자동역학 ) 시뮬레이션을 위한 포괄적인 모듈과 기능을 제공합니다. 학생들에게 이 강력한 소프트웨어 패키지를 소개함으로써, 학생들은 합리적인 약물 설계( 약물 설계)를 위한 계산 기법을 활용하는 실무 경험을 쌓을 수 있습니다. 본 발표에서는 Schrödinger 패키지를 교육 과정에 통합할 때의 잠재적 이점, 과제 및 전략을 논의하며, 특히 학생들의 CADD 원리에 대한 이해 증진, 비판적 사고 능력 함양, 그리고 향후 연구 및 산업 적용을 위한 실무 훈련 제공에 중점을 둡니다. 또한, 학습 경험을 강화하고 학제간 접근 방식을 장려하기 위해 실제 사례 연구와 협업 프로젝트를 도입하는 것의 중요성을 강조합니다. 상급 과정에 Schrödinger 패키지를 도입함으로써, 학생들은 귀중한 계산 능력을 개발하고 급속히 진화하는 신약 발견 및 설계 분야에 기여할 수 있는 준비를 더욱 탄탄히 할 수 있습니다.

연사 소개

춘 우

로완 대학교

춘 우(Chun Wu) 박사는 로완 대학교(Rowan University) 화학·생화학학과 및 생물·의생명과학학과에서 겸임하는 정년보장 부교수입니다. 그는 델라웨어 대학교(University of Delaware)에서 박사 학위를 취득했으며, 재학 중 단백질 힘장을 개발하고 아밀로이드 생성 펩타이드에 대한 분자 동역학( 분자동역학 ) 시뮬레이션을 수행했습니다. 이후 캘리포니아 대학교 데이비스(University of California, Davis)와 산타바바라(University of California, Santa Barbara)에서 박사후 연구원으로 근무하며 아밀로이드 생성 펩타이드 올리고머의 모델링을 연구했습니다. 로완 대학교에서 그의 연구실은 유전체 데이터셋을 활용하여 SARS-CoV-2 및 기타 병원체의 분자 진화를 가장 잘 설명할 뿐만 아니라, 이러한 감염성 질환을 치료하기 위한 1세대 및 차세대 백신과 약물을 개발하기 위해 유전체 내 핫스팟을 정확하게 식별할 수 있는 새로운 진화 이론(준중립 균형 선택 이론/NNBST)을 개발하고 있습니다. 분자 도킹, 상동 모델링 및 분자동역학 시뮬레이션을 활용하여, 그의 컴퓨터 지원 약물 설계(CADD, 약물 설계 ) 연구실은 새로운 항암제( 약물 설계) 개발을 위해 다양한 단백질 수용체와 리간드 간의 결합 상호작용을 조사하고 있습니다. 실험 연구 그룹과 협력하여 우 연구실은 잠재적인 항암제, 항바이러스제, 신경계 질환 치료제로 활용될 수 있는 새로운 단백질 수용체와 소분자를 발견하고, 단백질 및 핵산 안정화를 위한 이온성 액체를 최적화하는 것을 목표로 하고 있습니다. 92편 이상의 동료 심사 논문을 발표했으며, 책임 연구자(PI) 및 공동 책임 연구자(co-PI)로서 총 150만 달러의 외부 연구비와 330만 CPU 시간을 확보한 그는 h-지수 35와 총 8,857회 이상의 인용 횟수를 기록했습니다. 계산 생화학, 분자모델링 , 시뮬레이션 및 CADD 분야에 대한 그의 공헌은 동료 연구자들로부터 널리 인정받고 있습니다. 그는 국내외 학술대회 및 중국의 주요 연구 기관에서 초청 발표를 해왔으며, 2021년에는 인도네시아 교육문화부로부터 ‘세계적 수준의 교수(World Class Professor)’로 선정되었습니다. 연구 활동 외에도 춘 교수는 학부 및 대학원생들을 가르치고 지도하는 데 열정을 쏟고 있습니다. 로완 대학교에서 그는 30명 이상의 석사 과정 대학원생과 100명 이상의 학부생을 지도하여 28+23편의 논문과 69+83편의 포스터 발표를 이끌어 냈습니다.