OCT 31, 2025
Schrödinger デジタル創薬セミナー 20:
インシリコによる潜在的結合部位の検出と優先順位付け
インシリコ手法を活用した潜在的結合部位の探索と評価
クリプティック結合部位探索の新たな戦略 ― MxMD×SiteMap による革新的なワークフロー
従来のオルソステリックアプローチでは、選択性や耐性、開発の適性などの問題から攻略が困難な創薬ターゲットに対し、クリプティック結合部位（通常の構造では見えない潜在的な部位）を標的とする戦略が注目を集めています。しかし、とりわけアポ構造からは観測できないクリプティック部位の検出と評価は、初期創薬における大きな課題の一つです。
本ウェビナーでは、混合溶媒分子動力学法（MxMD）とSiteMapを組み合わせた新しい計算ワークフローをご紹介します。この統合的アプローチにより、61のターゲットからなるベンチマークセットにおいて、83％という高い成功率でクリプティック結合部位の検出に成功しました。新しいワークフローが、クリプティック結合部位の同定を支援し、新規ターゲットに対する構造ベース創薬をどのように加速させるのか、ぜひご参加の上、ご確認ください。
ウェビナーのハイライト
- MxMD法の概要
- MxMD＋SiteMapワークフローによるクリプティック結合部位の同定
- 機械学習手法およびSiteMap標準検出モードとの性能比較
登壇者
大石
ライフサイエンス・ソフトウェア部門、主任研究員（I級）、Schrödinger
Hit Discoveryチームでは、解明が困難な結合部位の同定およびFEPリガンドポーズの生成に関するワークフローの開発に取り組んでいます。
ディマ・ルピヤン
ライフサイエンスソフトウェア部門 シニア・プリンシパル・サイエンティスト、Schrödinger
デズモンドは、FEP解析ツールの開発を主導し、分子動力学分野における専門知識を発揮しています。特に、Schrödinger社のMD、MxMD、FEP+製品群の基盤となる、シミュレーション解析用のPython APIの開発に携わっています。