Schrödinger の全世界のオフィスは、社員全員が休息を取り、リフレッシュするための全社的な取り組みの一環として、8月17日から21日までの1週間、休業いたします。この期間中は、お問い合わせへの対応が制限される場合がございますので、あらかじめご了承ください。科学・技術サポートチームのメンバーは、緊急のサポート案件への対応のみ行います。

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物理学と機械学習を統合した仮想スクリーニング

物理学と機械学習を融合させた次世代バーチャルスクリーニングの必須スキルを習得し、よりスマートなヒット化合物の同定を実現する

詳細
利用可能な言語
中国語、英語、日本語、韓国語
所要時間
選択した開始日から5週間後
レベル
中級
費用
学生以外のユーザーは715ドル
学生・ポスドク:270ドル
このコースはどのような方に適していますか?
医薬品化学者、ケミインフォマティクス研究者、機械学習研究者、新進の計算化学者

概要

化合物空間 を探索するための計算効率の高い手法への需要が高まるにつれ、機械学習を活用したバーチャルスクリーニングは、現代の創薬において不可欠なツールとなっています。これらの技術により、化学者は迅速に同定 を行い、実験的検証やその後の開発に向けて、有望なヒット化合物やケモタイプを優先的に選定することが可能になります。

Schrödingerのオンラインコース「物理学と機械学習を統合したバーチャルスクリーニング」では、これらのワークフローを最初から最後まで実行するための専門的な指導とベストプラクティスを提供しています。

リガンド および構造 に基づくアプローチの実践スキルを向上させ、理解を深めたいと考えている科学者に最適な本コースでは、この最先端分野における専門知識を証明するための認定資格とデジタルバッジも取得できます。

  • ターゲット を活用して研究を加速させましょう。Schrödingerが提供する業界をリードするMaestro およびコマンドラインインターフェースを用いた、多彩な実践演習を通じて学びを深められます。
  • 初期の準備段階から大規模なデータ分析、そして情報に基づいた意思決定に至るまで、次世代の創薬ワークフローを包括的に実行します。
  • アクティブラーニングを活用した仮想スクリーニングワークフローのスケールアップGlide 。
  • Glide WS を使用して化合物を評価し、Free Energy Perturbation(FEP+ )による計算から得られた結合親和性データを分析します。
  • 学んだことを包括的な実例に基づくケーススタディに応用し、高度なバーチャルスクリーニングの課題に取り組む準備が整っていることを示してください。
  • Schrödinger 教育チームの専門家による、コースの課題や関連する質問に対する個別対応のレビューやフィードバックを活用してください。

 

このコースには、Schrödinger ソフトウェアのWeb版への一時的なアクセス権が含まれており、ライセンスおよびコンピューティングリソースも完備されています。

要件
認証
  • Schrödinger コースの責任者が署名した修了証書。履歴書や職務経歴書に添付できます。
  • LinkedInなどのソーシャルメディアに投稿できるバッジ
背景柄

学習内容

仮想画面の実行と検証

リガンド や受容体 によるグリッド作成など、パイロット仮想スクリーニングを実際に体験し、ドッキングシミュレーションの結果を検証するための重要な手法を学びます

ヒット評価と優先順位付け

スクリーニング後のヒットを、検査、クラスタリング、スコアリングなどを通じて、効果的に評価し、優先順位をつける方法を学ぶ

高度な手法を用いたワークフローの拡張

機械学習と自由エネルギー摂動法(FEP+ )を統合し、仮想スクリーニングのワークフローをスケールアップする方法について探る

創薬における実用的な応用

包括的なケーススタディを通じて、仮想スクリーニングの初期設定から有望な創薬候補の評価に至るまでのエンドツーエンドのプロセスに沿って、知識を実践的に活用してください

モジュール

モジュール1
2時間

コースの概要と最新のバーチャルスクリーニング手法

動画
動画
  • コース概要
  • 講師紹介
チェックポイント
シラバスおよび倫理規定

学術的誠実性に対する期待

動画チュートリアル
動画
  • インシリコ技術についてはSchrödinger
  • ヒット発見の概要
チェックポイント終了
モジュール終了時のチェックポイント
モジュール2
5時間+計算時間

仮想スクリーニングのパイロット実験の実施およびGlide によるドッキング結果の検証

動画
動画
  • 仮想スクリーニングの基礎
  • ターゲット イネーブルメント
  • モデルの検証
  • 化合物空間
チュートリアル
チュートリアル:
  • 以下の方法を用いて同族リガンドを調製するLigPrep
  • 受容体 グリッド生成
  • GPU「Shape 」画面
  • ドッキングモデルの最適化
チェックポイント終了
モジュール終了時のチェックポイント
モジュール3
5時間+計算時間

上映後のヒット評価と優先順位付け

動画
動画
  • クラスタリングおよびスコアリング手法
  • 化学的多様性とライブラリ の設計
  • 能動的学習Glide
  • Glide WS
チュートリアル
チュートリアル
  • DISE型選択
  • SBVSおよびLBVSのヒットに対する再スコアリングと順位比較
  • AL「Glide 」の結果を評価する:Hit Analyzer
  • 最終候補化合物を用いたGlide WSの実行
チェックポイント終了
モジュール終了時のチェックポイント
モジュール4
4時間

機械学習を活用したワークフローのスケーリングとFEP+

動画
動画
  • ヒット候補をさらに評価・精選するための手法
  • FEP+ メソッド
  • アクティブ・ラーニング ABFEP+
  • 機械学習による不動産価格予測
チュートリアル
チュートリアル
  • AL-ABFEP+の結果の評価
  • 機械学習による予測特性を活用する
チェックポイント終了
モジュール終了時のチェックポイント
モジュール5
4時間+計算時間

最後の事例研究

動画
動画
  • ケーススタディの概要
  • ケーススタディの結果と講座の締めくくり
チュートリアル
チュートリアル

仮想画面の分析

課題
課題

選択されたヒットに対する絶対結合FEP+ 評価

コース修了
コースの修了と認定

「Schrödinger 」オンラインコースの資金調達についてサポートが必要ですか?

私たちは次世代の科学者を誇りを持って支援しており、経済的な余裕のない方々にも機会を提供することに尽力しています。学生、ポスドク、あるいは産業界の科学者として、当社のオンライン認定コースを受講するための資金援助制度についてご確認の上、今すぐお申し込みください!

卒業生の声

「バーチャルワークステーションでの体験は本当に素晴らしいものでした!医薬化学を専門とする博士課程の学生として、このコースで得た知識とスキルは、私のキャリア目標の達成に大いに役立つでしょう。」
スマイヤ・ナヒド ネブラスカ大学メディカルセンター(UNMC)大学院研究助手
「このコースは、深い理論と実際の創薬現場に即した実践的な応用を巧みに組み合わせた、専門性の高い内容でした。実践的な演習を通じて、学んだことを有意義な形で活用することができました。」
アマンディープ・シン ペンシルベニア州立大学ポスドク研究員
「この認定コースは、ハイスループット仮想スクリーニングに関する私の知識を大いに深めてくれるものであり、本格的な応用を考えている人にとっては必修のコースです。」
ウェイ・ワン アイカーン医科大学 助教
「このコースを通じて、バーチャルスクリーニングやドッキングのワークフローについて実践的な知見を得ることができ、これらの手法を自信を持って活用できるようになりました。」
フロバター・ガワルギ(ネブラスカ大学メディカルセンター 博士)
「このコースでは、バーチャルスクリーニングの手法について包括的に学ぶことができ、私の創薬プロセスを効率化するのに役立ちました。このコースは、私の研究プロジェクトの進捗と成功に直接的な影響を与えました。」
アブドゥルバシット・ハリル・ヤクブ サウサンプトン大学博士課程学生
「このコースは理解しやすく、楽しく受講できました。各手法が現代の創薬研究においてどのように評価されているかを理解できる背景知識も盛り込まれていました。今では『Maestro 』の熟練ユーザーになったと感じており、自信を持って分子モデリングの分野へとキャリアを向けていくことができます。」
ジョセフ・イーガン 医学研究・イノベーションセンターインターン

コースのバッジと修了証で、新たに身につけたスキルをアピールしましょう

当社の分子モデリングコースを修了し、学んだことを同僚や雇用主に共有する準備が整ったら、LinkedInのプロフィールに修了証やバッジを掲載することができます。

よくある質問

「物理学と機械学習を統合したバーチャルスクリーニング」のオンラインコースの受講料はいくらですか?

料金はコースごと、および受講者の区分によって異なります。本コースを受講希望の学生の方には学生料金として240ドル、学生以外の方には645ドルをご用意しています。

講義は何時からですか?

コースのセッションが開始されると、すべての講義は非同期形式となり、自分のペースで視聴できる動画、チュートリアル、課題などを都合の良い時に利用できます。コース登録時に開始日と終了日を選択します。その期間中は、コース教材や仮想ワークステーションに非同期でアクセスでき、ご自身のスケジュールに合わせて学習を進めることができます。

このコースの受講料はどうやって支払えばいいですか?

受講をご希望の方は、登録手続きを完了し、クレジットカード決済ポータルをご利用いただくことで、即座にコースのお支払いが可能です。デビットカードはご利用いただけませんので、クレジットカードが必要となります。なお、ご要望に応じて発注書を発行することも可能です。このオプションをご希望の場合は、online-learning@schrodinger.com までメールにてご連絡ください。コースのお支払い方法についてご質問がある場合は、当サイトの「支払い方法」ページをご覧ください。

学生向けの奨学金の制度はありますか?

Schrödinger は、経済的に恵まれない学生を支援することに尽力しています。Schrödingerの使命は、治療薬や材料の発見方法に変革をもたらすことで、人々の健康と生活の質を向上させることです。Schrödinger は、次世代の科学者を誇りを持って支援しています。当財団では、経済的支援を必要としていることが証明でき、かつ指導教員からの推薦状を提出できる全日制の学生またはポスドクを対象とした奨学金プログラムを設けています。当財団の奨学金プログラムの応募資格を満たす方は、ぜひ申請フォームにご記入ください!

コース終了後も教材は引き続き利用できますか?

コースが終了するとソフトウェアへのアクセスは終了しますが、コース内の教材の一部(スライド、論文、チュートリアルなど)はダウンロード可能となっており、コース終了後も参照することができます。一方、動画、クイズ、ソフトウェアへのアクセス権などのその他の教材は、コース期間中のみ利用可能です。

このコースを受講するには、そのソフトウェアへのアクセス権が必要ですか? ソフトウェアは別途購入する必要がありますか?

コース期間中は、Maestro 、Bioluminate、Materials ScienceMaestro 、および/またはLiveDesign (コースによって異なります)のウェブ版にアクセスできます。 ソフトウェアへのアクセス権を別途購入する必要はありません。コース終了とともにソフトウェアへのアクセス権は失効しますが、コース内の資料の一部(スライド、論文、チュートリアル)はダウンロード可能となっており、コース終了後も参照することができます。動画、クイズ、ソフトウェアへのアクセス権などのその他の資料は、コース期間中のみ利用可能です。なお、Schrödinger のソフトウェアは、コースに関連する目的でのみ使用してください。

このオンラインコースと併せて受講することをお勧めするコースはどれですか?

「ターゲット 」イネーブルメント、 「Preparation, & Validation」および 「Designing qualityリガンド libraries」の各オンラインコースは 、「物理学と機械学習を統合したバーチャルスクリーニング」オンラインコースの受講前、受講中、または受講後に受講することをお勧めします。これらのコースはすべて密接に関連しており、同様の受講者を対象としています。各コースにはバーチャルスクリーニング・パイプラインの各側面に関連する重要な概念が含まれているため、基礎理論に関する動画の一部が重複していることに気づくでしょう。しかし、各コースには独自の焦点があり、そのトピックに関連する具体的なガイダンスについて詳しく解説しています。

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