画期的な治療薬の開発競争において、水のエネルギー動態の役割を理解することは、新たな設計戦略を切り拓くための斬新な知見をもたらす可能性があります。 タンパク質結合部位内およびその周辺にある水分子は、単なる受動的な傍観者ではなく、分子認識において能動的な役割を果たしており、リガンド 結合親和性、選択性、安定性に影響を与える可能性があります。ヒット化合物発見、ドッキング、リード化合物最適化のワークフローに明示的な水のエネルギー学を取り入れることで、タンパク質とリガンド との相互作用をより詳細に把握できるようになり、結合結果をより正確に予測し、同定 リード化合物を最適化するための新たな機会を見出すことができます。

本ウェビナーでは、結合ポケットにおける水のエネルギー動態を明示的に活用して創薬設計を強化する2つの技術、すなわち「WaterMap」と「Glide WS」の影響について解説します。WaterMapは、水結合部位の熱力学的評価を通じて、高エネルギーで不安定な水和部位を特定し、より優れたヒット化合物やより強力なリード化合物の同定精度を向上させます。Glide WSは、WaterMapの計算結果に基づく詳細な水解析を活用し、脱溶媒化現象がタンパク質-リガンド 結合に及ぼす影響を評価する分子ドッキングツールです。WaterMapとGlide WSを組み合わせることで、正確な姿勢予測が可能となり、最新のバーチャルスクリーニングにおける初期段階での候補化合物の選別精度が向上します。

SchrödingerのSARS-CoV-2共同研究プロジェクトを通じて、水のエネルギー学がもたらす影響を実証します。このプロジェクトにより、優れた汎コロナウイルス対応力を持ち、強力な酵素活性および細胞活性を示す、独自のSAR（構造活性相関）を有するリード化合物が迅速に発見されました。

ウェビナーの見どころ

• タンパク質の結合部位における水分子の役割の概要、およびリガンド のドッキング結果への影響
• 水のエネルギー動態を明示的にモデル化することで、新たな結合様式を解明し、偽陽性を減らすことができる
• 水和パターンを活用したリード化合物の最適化に関する知見：選択性と薬物様特性の向上
• Schrödingerの創薬プロジェクトにおける成功事例