전 세계 모든 Schrödinger 사무소는 휴식과 재충전을 위한 전사적 조치의 일환으로 8월 17일부터 21일까지 일주일간 휴무합니다. 이 기간 동안 문의에 대한 답변이 제한될 수 있으니 양해 부탁드립니다. 과학 및 기술 지원팀 직원들은 긴급 지원 문의에 한해 대응할 예정입니다.

프라임

정확한 단백질 구조 예측을 위한 강력하고 혁신적인 솔루션

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개요

Prime은 상동성 모델링과 폴드 인식 기능을 단일 솔루션에 통합한 완전 통합형 단백질 구조 예측 솔루션입니다. Prime은 각 단계별로 유용한 기본 설정을 제공하여 사용자가 구조 예측 워크플로우를 단계별로 쉽게 진행할 수 있도록 돕는 직관적인 단계별 인터페이스를 갖추고 있습니다.

사례 연구 및 웨비나

Schrödinger 기술이 실제 연구 과제를 해결하는 데 어떻게 활용되고 있는지 알아보세요.

생명과학 웨비나

Schrödinger 제품군을 활용한 신약 개발을 위한 극저온 전자현미경(cryoEM) 구조 분석 지원

신약 개발에서 단백질 구조의 중요성과 가치는 분자 특성을 합리적으로 최적화할 수 있는 능력과 직접적인 관련이 있다.

생명과학 웨비나

전산 모델링을 활용한 항체 휴머니제이션

생명과학 웨비나

바이오의약품 설계 | BioLuminate

이번 교육에서는 BioLuminate 바이오의약품 설계 워크플로우를 시연할 예정이며, 여기에는 다음이 포함됩니다.

생명과학 백서

CovDock

생명과학 백서

거대고리 화합물

생명과학 백서

유도적 결합 도킹 문제에 대한 새로운 해결책: IFD-MD가 어떻게 정확하고 신속하며 신뢰할 수 있는 리간드 결합을 예측하는가

생명과학 백서

효율적이고 자동화된 매크로사이클 설계를 위한 새로운 인실리코 워크플로우 소개

생명과학 웨비나

이중 기능 분해제 설계를 위한 계산 워크플로우

생명과학 웨비나

설계 기반 효소: 효소 모델링을 위한 구조 기반 방법

Schrödinger 기술을 활용하여 구조 기반의 합리적 설계를 통해 효소를 최적화하는 방법에 대한 개요.

주요 역량

X선 결정학, NMR 또는 극저온 전자현미경(Cryo-EM)을 통해 얻은 실험적 구조를 정밀화하여, 후속 시뮬레이션을 위한 정확하고 상세한 출발점을 마련한다
실험적 구조가 없는 경우, 서열로부터 단백질 구조를 정확하게 예측하여 고품질의 모델을 도출한다 
사이드 체인 의 배위를 예측하고 정교화하여 완전한 전원자 단백질 모델을 생성합니다. 
거대고리의 막 투과성과 구조적 배열을 예측한다
MM-GBSA를 사용하여 관심 대상 에너지 시스템을 신속하게 계산합니다.
구조 예측의 전체 워크플로를 단계별로 안내하는 직관적인 인터페이스를 활용해 보세요. 
서열 동일성이 낮거나 전혀 없는 경우, 초기 구조 분석이나 기능 주석을 위한 백본 모델을 생성합니다.
FEP+ 와 긴밀하게 연동되어 수천 가지의 단백질 돌연변이를 신속하게 분석함으로써, 단백질 최적화를 위한 정확하고 철저한 스크리닝 과정을 수행할 수 있습니다.

문서 및 튜토리얼

Schrödinger의 소프트웨어 사용과 관련된 자주 묻는 질문에 대한 답변을 확인하고, 모범 사례를 알아보세요.

생명과학 튜토리얼

펩타이드 고리화

명령줄 인터페이스를 통해 macrocyclize.py 스크립트를 사용하여 펩타이드를 고리화시키고, Prime MM-GBSA를 사용하여 고리화된 구조들을 순위별로 정렬합니다.

생명과학 튜토리얼

BioLuminate를 이용한 항체 구조 예측 및 시각화

항체 구조를 예측하고, 구조의 품질을 분석하며, 예측된 구조에 대해 필요한 정밀 조정을 수행합니다.

생명과학 튜토리얼

표적 단백질 분해제의 합리적인 설계를 가능하게 하는 3원 복합 구조 생성

링커 최적화를 위해 표적-PROTAC-리가제 복합체의 구조를 생성하고 평가한다.

생명과학 문서화

프라임

상동성 모델링과 폴드 인식 기능을 하나의 솔루션에 통합한 완전 통합형 단백질 구조 예측 솔루션입니다.

생명과학 튜토리얼

GlideXtal 및 Phenix/OPLS를 이용한 단백질-리간드 결정 구조의 정제

도킹 를 사용하여 GlideXtal로 결정 구조 내 리간드의 배향을 재계산하고 정밀 조정합니다.

생명과학 튜토리얼

MM-GBSA를 이용한 감점된 리간드의 재평가

결합 포즈를 최적화하고 소규모 가상 스크리닝 결과를 재평가한다.

생명과학 튜토리얼

다음 없이 단백질 유연성을 근사화하기 분자동역학

Glide 에서 포텐셜을 연화시키고, 사이드 체인 의 구조 변화 및 루프 정밀화를 위해 유도 적합 도킹을 실행합니다.

생명과학 튜토리얼

이황화 결합 공학

열 안정성 를 개선하고 결정화를 용이하게 하기 위해 시스테인으로 변이시킬 수 있는 잔기를 확인하기 위해 시스테인 스캐닝을 수행한다.

생명과학 튜토리얼

신약 개발 매크로사이클을 이용한

거대고리의 샘플링, 도킹 및 lead optimization .

생명과학 튜토리얼

소분자의 막 투과성

일련의 소분자들의 막 투과성을 예측하십시오.

관련 상품

연구 프로젝트를 발전시키는 데 활용할 수 있는 관련 컴퓨팅 기술에 대해 자세히 알아보세요.

IFD-MD

표적 물질 및 비표적 물질에 대한 신규 화학 물질의 정확한 리간드 결합 방식 예측

FEP+

신약 개발을 위한 고성능 자유 에너지 계산

막 투과성

수동적 막 투과성을 신속하고 정확하게 예측하기 위한 물리 기반 솔루션

PrimeX

정확한 단백질 결정 구조 정밀화를 위한 종합 패키지

간행물

관련 응용 분야에서 ‘ Schrödinger ’ 기술을 활용한 동료 심사를 거친 논문 목록을 살펴보세요.

재료과학 출판물

버섯 Amaropostia stiptica에서 맛을 기준으로 쓴맛 화합물을 분리해낸 결과, 인간의 쓴맛 수용체 중 일부가 활성화되었다.

재료과학 출판물

분자동역학 시뮬레이션 및 자유 에너지 분석을 이용한 원숭이두창 바이러스 VP39 단백질과 약물 유사 화합물의 결합 잠재력 및 결합 상수( 안정성 ) 평가

생명과학 간행물

화학생물학 분야에서 ‘ 머신러닝 ’의 데이터 부족 문제를 해결하기 위한 수단으로서의 FEP 보강

재료과학 출판물

Peperomia pellucida 유래 식물 화학물질이 특정 메탈로프로테이나제 표적에 미치는 피부 노화 방지 효과: 컴퓨터 시뮬레이션 기반 연구

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단일클론 항체에서 메티오닌 산화 위험을 컴퓨터 시뮬레이션을 통해 평가하는 새로운 방법: 2-쉘 모델에 비해 개선된 점

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단백질 구조 예측에서의 표적-템플릿 관계와 이것이 열안정성 계산의 정확도에 미치는 영향

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생물학적 제제의 정량적 구조-성질 관계 예측을 위한 서술자 집합

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자유 에너지 섭동을 이용한 아미노산 잔기 돌연변이에 따른 단백질 열역학적 안정성 변화의 정확한 예측

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단백질-리간드 결합에 대한 유도 적합 도킹 문제에 대한 신뢰할 수 있고 정확한 해결책

생명과학 간행물

주요 조직적합성 복합체 I(MHC I) 신항원 제시를 통해 돌연변이 β-카테닌을 표적으로 하는 공학적으로 설계된 항체 단편

교육 및 자료

온라인 자격증 과정

실습 중심의 온라인 ‘ 분자모델링 ’ 과정을 통해 여러분의 역량을 한 단계 높여보세요. 이 자기 주도형 과정은 다양한 과학 주제를 다루며, ‘ Schrödinger ’ 소프트웨어 이용 권한과 지원 서비스가 포함되어 있습니다.

튜토리얼

프로젝트의 성공을 위해 ‘ Schrödinger ’ 소프트웨어의 기술과 모범 사례를 활용하는 방법을 알아보세요. 교육 자료, 튜토리얼, 빠른 시작 가이드, 동영상 등을 확인해 보세요.