리간드 설계 도구

히트-투-리드 및 lead optimization

개요

Ligand Designer는 과학적으로 입증된 강력하면서도 사용하기 쉬운 3D 시각화 및 리간드 구축 기능을 제공하며, 2D 또는 3D 환경에서 리간드 변형을 설계하고 이러한 변화가 단백질-리간드 복합체 구조에 어떤 영향을 미칠지 확인하는 과정을 재미있게 만들어 줍니다. 3D 정보 시각화의 복잡성을 해소하는 Ligand Designer는 증강 현실(AR)의 개념을 활용하여, 새로운 성장 공간을 포함한 관련 정보를 레이어링함으로써 리간드 수정이 가장 필요한 부분을 신속하게 파악할 수 있도록 지원합니다.

Ligand Designer는 일반적인 의약화학 기법의 힘을 손쉽게 활용할 수 있게 함으로써 3D 설계 과정을 누구나 쉽게 접할 수 있도록 합니다. 이 도구는 Maestro 및 LiveDesign 에서 이용하실 수 있습니다.

자동화된 전문 도구를 활용해 아이디어를 손쉽게 구상하고 평가하세요

완벽한 안내가 제공되는 워크플로우를 갖춘 인터랙티브 디자인

도킹 의 2D 및 3D 도면을 자동으로 변환
바이오이소스테르 치환 및 이소스테르 스캐닝 수행
단백질-리간드 상호작용 형성
리간드의 고리화
불안정한 수역을 파악하고 대체하기
다중 수용체 모드를 사용하여 선택성을 최적화합니다.

Ligand Designer의 장점

지도형 설계

아이디어를 평가하기 위해 수동 또는 안내형 디자인 중에서 원하는 방식을 선택해 보세요. 일반적인 의약화학 워크플로가 포함되어 있어 아이디어를 자동으로 테스트하고 정보 과부하를 피할 수 있습니다.

나만의 스타일로 디자인하세요

2D로 설계하고 ‘ workspace ’에서 구조를 확인하거나, 2½D로 설계하여 핵심 정보가 포함된 ‘ 결합 포켓 ’의 표현을 확인하거나, 3D로 설계하여 모든 측면을 완벽하게 제어할 수 있습니다.

자동화된 전문가용 도구

복합체의 기하학적 구조를 시각화하여 리간드 변화의 영향을 손쉽게 평가하고, 불필요한 정보로 인한 잡음을 줄여 다음 아이디어를 찾아보세요. 제어 기능은 사용자의 용도에 맞게 미리 프로그래밍되어 있습니다.

프로젝트에 맞춰 화학 반응을 설계하세요

합성하기 쉬운 열거법이나 R-그룹 열거법을 사용하여 관심 있는 화학적 특성에 맞게 조정하십시오.

강력한 내장 기술

Glide Ligand Designer에서는 도킹, R-그룹 라이브러리나 Pathfinder를 활용한 자동 아이디어 도출, Prime의 Macrocycle, BREED 및 WaterMap 등이 모두 사용됩니다.

평온한 바다로 가는 지도

WaterMap을 사용하여 “수화 부위”의 엔트로피와 엔탈피를 계산함으로써 SAR을 합리화하고, 효능을 높이며, 선택성을 조정합니다.

문서 및 튜토리얼

Schrödinger의 소프트웨어 사용과 관련된 자주 묻는 질문에 대한 답변을 확인하고, 모범 사례를 알아보세요.

생명과학 튜토리얼

학습 과정: 순환 펩타이드 모델링

신약 개발 분야에서 순환 펩타이드를 다루는 도구와 워크플로우에 대한 체계적인 개요.

튜토리얼 보기

생명과학 튜토리얼

Ligand Designer를 이용한 RNA-리간드 상호작용 형성

Ligand Designer를 사용하여 RNA 수용체에 결합된 리간드를 수정함으로써 결합 친화도를 향상시킵니다.

튜토리얼 보기

생명과학 문서화