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2026년 9월 10일

구조 기반 약물 설계 와 독성학이 이온 채널 및 수송체에 적용될 준비가 되어 있는가?

저온전자현미경(cryo-EM) 분야의 ‘해상도 혁명’은 가장 큰 두 가지 약물 표적 분류인 이온 채널과 수송체의 잠재력을 이끌어내어, 구조 기반 약물 설계 및 독성학 예측을 가능하게 했습니다. 그러나 이러한 구조적 풍요로움에는, 더 친숙하고 용해성이 높은 단백질 약물 표적을 다룰 때 흔히 접하지 못했던 고유한 과제들이 수반됩니다. 여기에는 막의 존재, 결합과 기능 간의 잠재적 불일치, 그리고 낮은 해상도로 인한 리간드 및 단백질 구조의 불명확성 등이 포함됩니다.

FEP+ 나 Schrödinger의 자유 에너지 섭동 기술과 같은 ‘골드 스탠다드’ 예측 스코어링 방법은 이러한 맥락에서 이온 채널 및 수송체에 대한 화합물의 효능을 예측하는 데 얼마나 뛰어난 성능을 보일까요? 이번 웨비나에서는 임상적으로 중요한 7개의 이온 채널과 2개의 수송체에 대한 효능 예측을 주제로 한 대규모 연구 결과를 발표하며, 이 질문에 대한 답을 제시할 것입니다. 또한 FEP+ 가 이 벤치마크 데이터셋에서 얼마나 우수한 성능을 보이는지, 정확도에 결정적인 영향을 미치는 요인은 무엇인지, 그리고 전향적 신약 개발 및 독성학 분야에서 얻은 우리의 경험을 논의할 예정입니다.

웨비나 주요 내용:

  • ‘상대 결합(Relative Binding) FEP+ ’ 시뮬레이션에 명시적인 막을 포함시켰을 때 성능이 획기적으로 향상된 사례들
  • OPLS5 힘장이 리간드-게이트 이온 채널의 다양한 결합체에 대해 매우 정확한 전향적 절대 결합 FEP+ 예측을 가능하게 한 이유에 대한 논의
  • 표적 효능 예측 및 비표적 독성학 모델링을 포함한 신약 발굴 프로그램의 사례

참가 대상:전산 화학자, 독성학자, AI 신약 개발 연구원, 구조 생물학자, 의약 화학자, 이온 채널 생물학자

연사 소개

아바 레플러 박사

치료제 개발 그룹, 전산 화학 부문, 선임 수석 연구원, Schrödinger

아바 E. 레플러(Abba E. Leffler) 박사는 Schrödinger 의 치료제 연구팀 소속 수석 수석 과학자로, 현재 소분자 신약 개발에 주력하고 있습니다. 그는 프린스턴 대학교에서 화학 학사 학위와 응용수학 수료증을 취득한 후, D. E. Shaw Research에서 근무했으며, 이후 뉴욕대학교 의과대학에서 신경과학 박사 학위를 받았습니다. 그의 연구 성과는 『Science』, 『Journal of Medicinal Chemistry』, 『The Journal of Neuroscience』, 『The Journal of Chemical Information and Modeling』, 『Proceedings of the National Academy of Sciences』 등 다수의 학술지에 게재되었습니다. 또한 그는 임상 시험 단계에 있는 화합물을 포함하여 다수의 특허를 보유한 발명가이기도 합니다.

에드워드 밀러 박사

단백질 구조 모델링 부문 부사장, Schrödinger

단백질 구조 모델링 부문 부사장인 에드워드 밀러(Edward Miller) 박사는 2014년 Schrödinger 에 합류했으며, 구조 기반 신약 개발의 적용 범위를 까다로운 표적 및 비표적 영역으로 확대하는 업무를 담당하고 있습니다. 밀러 박사는 컬럼비아 대학교에서 박사 학위를 취득했으며, 재학 중 미국 에너지부(DOE) 연구 펠로우십을 수여받았습니다. 리처드 프라이스너(Richard Friesner) 교수와 함께 진행한 박사 학위 논문 연구에서는 광범위한 단백질 계열에 걸쳐 루프 구조를 정확하게 모델링하는 방법론을 개발하는 데 주력했습니다. 최근에는 유도 적합 도킹(induced fit docking) 및 단백질 구조 정밀화 방법론 개발에 주력하고 있습니다.