APR 28, 2026
실습 워크숍: 슈뢰딩거의 리간드 디자이너(Schrödinger’s Ligand Designer)를 활용한 단백질-리간드 상보성 교육
현대 화학 교육은 2차원 구조의 암기에서 3차원 분자 인식의 숙달로 전환되고 있습니다. 이 실습 워크숍에서는 교수진을 대상으로, 업계 표준의 신약 개발 과정을 학부 수업에 도입할 수 있는 강력한 도구인 ‘ Schrödinger’의 ‘Ligand Designer’를 소개합니다.
참가자들은 상호작용 지도(Interaction Maps)와 실시간 점수 산정(Real-time Scoring)을 활용하여 단백질과 리간드 간의 ‘분자적 악수’를 정량화함으로써, ‘자물쇠와 열쇠’ 비유를 넘어서는 방법을 탐구하게 됩니다. 안내에 따른 ‘수정 및 측정(Modify and Measure)’ 워크플로를 통해, 참가자들은 반복적인 결합 역학 분석( lead optimization)을 실습하게 되며, 이를 통해 입체적 충돌과 성장 공간 시각화 결과를 해석하여 결합 친화도의 열역학적 원동력을 설명하는 방법을 익히게 됩니다.
마지막으로, 이번 세션은 교육적 통합에 초점을 맞추어 탐구 기반 실험 수업을 설계하기 위한 전략을 제시합니다. 참가자들은 학생들이 계산적 데이터를 바탕으로 자신의 화학적 직관을 논리적으로 입증하도록 유도하는 ‘설계 근거(Design Justification)’ 보고서와 같은 평가 도구를 개발하는 방법을 배우게 됩니다. 참가자들은 정적인 교과서 개념을 역동적이고 데이터 기반의 학생 체험으로 전환할 수 있는, 바로 활용 가능한 프레임워크를 습득하고 돌아갈 것입니다.
학습 목표:
- 분자 상보성의 시각화 및 정량화
- Lead Optimization 의 반복적 워크플로우 실행
- 기존 교육 과정에 ‘탐구 중심’의 컴퓨터 실습을 통합한다
슬라이드 | 인터랙티브 데모
연사 소개
캣 베이
‘Teaching with’ 담당 매니저 Schrödinger
캐서린 베이 박사는 ‘ Schrödinger 를 활용한 교육(Teaching with )’ 프로그램을 총괄하는 선임 과학자입니다. 그녀는 ‘ Schrödinger’의 ‘ 분자모델링 ’ 도구를 수업에 접목한 교육 과정을 개발하고 있습니다. 2021년 ‘ Schrödinger ’에 합류하기 전에는 유기화학 조교수로 재직하며, 코로나19 팬데믹 상황에 대응해 ‘ 코스 ’를 플립드 클래스룸 모델로 설계했습니다. 그녀는 캘리포니아 대학교 로스앤젤레스(UCLA)에서 유기화학 박사 학위를 취득했으며, 밀도 함수 이론을 활용해 반응을 규명하는 연구를 수행했습니다.
엠마 쿠츠코프스키
생명과학 교육 분야 선임 연구원 I, Schrödinger
뉴욕주립대학교 오스웨고 캠퍼스(State University of New York at Oswego)에서 화학 석사 학위를 취득한 엠마 쿠츠코프스키(Emma Kuczkowski)는 켈러-마이어스( Schrödinger ) 교육팀에서 2급 연구원(Scientist II)으로 근무하고 있습니다. 교육 및 상업용 의약품 제조 분야에 걸친 경력을 바탕으로, 그녀는 계산화학 교육 분야에 전문성을 발휘하고 있습니다. 켈러-마이어스( Schrödinger)에 합류한 이래, 그녀는 최첨단 소분자 생명과학 과정, 특히 켈러-마이어스( 코스 )의 대표 과정인 “신약 개발에서의 켈러-마이어스( 분자모델링 ) 입문(Introduction to in Drug Discovery)”을 기획하고 제공하는 데 중추적인 역할을 해왔습니다. 그녀의 기여는 튜토리얼, 참고 자료, 동영상, 워크숍 등 다양한 교육 자료의 개발로까지 확장되며, 이 모든 자료는 응용 분자모델링 에 대한 더 깊은 이해와 숙련도를 함양하는 데 목적을 두고 있습니다.