표적 활성화, 준비 및 검증
구조 기반 계산 워크플로우를 위해 X선 결정학, 극저온 전자현미경(cryo-EM), 머신러닝 방법 및 상동성 모델링을 활용한 단백질 구조 활성화
상세 정보
모듈
5
소요 시간
선택한 시작일로부터 5주 동안 최대 20시간
난이도
중급
비용
비학생 이용자의 경우 645달러
학생 및 박사후 연구원 240달러
수강 대상
의약화학자, 화학정보학자, 기계학습 연구자, 신진 계산화학자, 구조생물학자
개요
X선 결정학, 극저온 전자현미경(cryo-EM), 그리고 최근에는 기계 학습(ML) 기법을 통해 이용 가능한 구조 데이터가 폭발적으로 증가함에 따라, 구조 기반 계산 워크플로우를 위해 구조를 준비, 정제 및 검증하는 데 필요한 도구와 워크플로우에 대한 필요성이 점점 더 커지고 있다.
슈뢰딩거의 온라인 과정인 ‘타깃 활성화, 준비 및 검증(Target Enablement, Preparation, and Validation)’은 가상 스크리닝, 분자 동역학 시뮬레이션, 자유 에너지 섭동 계산 등 향후 구조 기반 전산 모델링 워크플로우를 위한 프로젝트를 성공적으로 수행할 수 있도록 전문적인 지침과 모범 사례를 제공합니다.
이 과정은 수료증과 배지를 취득하여 전문성을 높이고 이력서를 강화하고자 하는 분들에게 이상적입니다.
- 업계 최고의 슈뢰딩거(Schrödinger)의 ‘마에스트로(Maestro)’ 및 명령줄 인터페이스를 직접 사용해 보세요
- 진행 중인 프로젝트에 직접 적용할 수 있는 방법을 배워 연구를 빠르게 시작해 보세요.
- AlphaFold 구조 정교화부터 난해한 포켓 식별에 이르기까지 다양한 주제를 배워보세요
- 과정 내용의 숙달을 입증하기 위해 독자적으로 사례 연구를 수행합니다.
- 과제 및 과정 관련 문의에 대해 슈뢰딩거 교육 팀 전문가의 검토 및 피드백 혜택 받기
- 과정 기간 내에 편한 시간에 맞춰 자유롭게 학습 자료를 진행하세요.
이 과정에는 강의에 필요한 라이선스와 컴퓨팅 리소스가 포함된 웹 기반 슈뢰딩거 소프트웨어 버전 이용 권한이 제공됩니다.
학습 내용
X선 및 극저온 전자현미경 구조
다양한 품질의 실험적 구조를 준비하고 정교화하는 데 필요한 모범 사례를 알아보세요
ML을 통해 예측된 구조와 상동 모델링
AlphaFold 등에서 도출된 ML 예측 구조 및 상동 모델의 활용 및 정교화 방법에 대한 모범 사례를 알아보세요.
결합 부위 규명
소분자 결합 부위의 약물화 가능성을 평가하는 방법과, 잠재적인 숨겨진 포켓을 탐색하고 특성화하는 방법을 알아보세요.
대상에 대한 향후 활성화
사용 가능한 구조를 철저히 점검하고, 분석 및 개선 과정을 거쳐 대상 시스템을 독자적으로 가동함으로써 자신의 기술을 적용하십시오.
모듈
모듈 1
2시간
대상 활성화 방법 및 구조적 검증의 가치
비디오
과정 개요
강의 계획서 및 명예 규약
학문적 정직성에 대한 기대
동영상
- 신약 개발 분야의 전산 실험에서 구조 검증의 중요성
- 일반적인 타겟 활성화 방법 비교
모듈 완료 평가
모듈 2
5시간
출발점: X선 결정 구조 및 극저온 전자 현미경 구조
비디오
구조의 가용성 및 실험적 고려 사항
튜토리얼:
- 구조 품질 지표
- 검사 워크플로우
- 단백질 정제
- 기본 정제
모듈 완료 평가
모듈 3
4시간
출발점: AlphaFold 구조 및 상동 모델
비디오
AlphaFold 및 상동 모델의 생성, 검사 및 검증
튜토리얼
- AlphaFold 구조 확보 및 검토
- 상동 모델링
- 모델 정교화 기법
모듈 완료 평가
모듈 4
5시간
다음 단계: 구조에 대한 심층적인 준비, 정교화 및 검증
비디오
더 까다로운 표적에 대한 정제 및 검증 방법
튜토리얼
- 수동 단백질 정제
- 사이트맵
- 혼합 용매 분자 동역학
- WaterMap
- FEP+ 검증
모듈 완료 평가
모듈 5
4시간
사례 연구: 전산 기반 신약 개발을 위한 구조 설계 및 검증
비디오
- 사례 연구 개요
- 사례 연구 결과 및 과정 마무리
튜토리얼
구조 검사, 준비 및 검증
과제
사례 연구 결과를 검토하고 논의한다
과정 수료 및 인증
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차세대 과학자들을 적극 지원하며, 제한된 자원을 가진 분들에게도 기회를 제공하기 위해 노력합니다. 학생, 박사후연구원, 또는 산업계 과학자로서 당사의 온라인 자격증 과정을 수강할 때 활용할 수 있는 지원 옵션을 확인하고 지금 등록해 보세요!
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자주 묻는 질문
Target 역량 강화, 준비 및 검증 온라인 과정 수강료는 얼마인가요?
수강료는 각 과정 및 수강생 유형에 따라 다릅니다. 이 과정을 수강하고자 하는 학생에게는 240달러의 학생 할인가를, 비학생에게는 645달러의 수강료를 적용합니다.
강의 시간은 언제인가요?
코스 세션이 시작되면 모든 강의는 비동기식으로 진행되므로, 편한 시간에 맞춰 자기주도형 동영상, 튜토리얼, 과제를 시청하고 수행할 수 있습니다.
수강료는 어떻게 결제하나요?
등록을 완료한 후 신용카드 결제 포털을 이용해 즉시 수강 신청 및 결제를 진행할 수 있습니다. 체크카드는 사용할 수 없으며 신용카드만 지원되니 참고해 주시기 바랍니다. 또한 요청 시 구매 주문서(PO)를 발급해 드릴 수 있으니, 필요한 경우 online-learning@schrodinger.com으로 이메일을 보내주십시오. 결제 방법에 대해 궁금한 점이 있으시면 자금 지원 옵션 페이지를 방문하세요.
등록하기 전에 코스를 미리 볼 수 있는 방법이 있나요?
학생들을 위한 장학 혜택이 있나요?
슈뢰딩거는 자원이 부족한 학생들을 지원하기 위해 최선을 다하고 있습니다. 슈뢰딩거의 미션은 신약과 신소재 발굴 방식을 혁신하여 인류의 건강과 삶의 질을 향상하는 것입니다. 슈뢰딩거는 차세대 과학자들을 자랑스럽게 지원합니다. 경제적 지원이 필요함을 증명할 수 있고 지도교수의 추천서를 제출할 수 있는 정규 학생 또는 박사 후 연구원을 대상으로 장학 프로그램을 운영하고 있습니다. 장학 프로그램 지원 자격이 되신다면 지원서를 작성해 주세요!
강의가 종료된 후에도 학습 자료를 계속 이용할 수 있나요?
강의가 끝나면 소프트웨어 이용은 종료되지만, 강의 내 일부 자료(슬라이드, 논문, 튜토리얼)는 수료 후에도 참고할 수 있도록 다운로드할 수 있습니다. 비디오, 퀴즈, 소프트웨어 이용 권한과 같은 기타 자료는 강의 기간 동안에만 제공됩니다.
강의를 수강하려면 소프트웨어에 접근할 수 있어야 하나요? 소프트웨어를 별도로 구매해야 하나요?
강의 기간 동안 (과정에 따라) Maestro, Bioluminate, Materials Science Maestro 및/또는 LiveDesign의 웹 기반 버전을 이용하실 수 있습니다. 소프트웨어 사용권을 별도로 구매하실 필요는 없습니다. 강의가 끝나면 소프트웨어 이용은 종료되지만, 강의 내 일부 자료(슬라이드, 논문, 튜토리얼)는 수료 후에도 참고할 수 있도록 다운로드할 수 있습니다. 비디오, 퀴즈, 소프트웨어 이용 권한과 같은 기타 자료는 강의 기간 동안에만 제공됩니다. 슈뢰딩거 소프트웨어는 강의 관련 목적으로만 사용해야 합니다.
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