고품질 리간드 라이브러리 설계_메인 이미지

품질 좋은 리간드 라이브러리 설계하기


화학 공간 탐색, 리간드 라이브러리 프로파일링 및 맞춤화, 도킹 모델 검증, 그리고 히트 발굴을 위한 열거 방법

상세 정보
모듈
5
소요 시간
5주 / 주당 최대 20시간
난이도
중급
비용
비학생 이용자의 경우 680달러
학생 및 박사후 연구원: 255달러
과정 일정
5주 동안 자기 주도형으로 진행됩니다. 수강 신청 시 시작일과 종료일을 선택하게 됩니다. 해당 기간 동안 수강생은 자신의 일정에 맞춰 언제든지 학습 자료와 가상 워크스테이션에 비동기식으로 접속하여 과정을 진행할 수 있습니다.

가상 및 물리적 리간드 라이브러리가 대폭 확대됨에 따라, 고처리량 가상 스크리닝과 같은 히트 발굴 워크플로우에 활용하기 전에 이러한 라이브러리를 표적 및 프로젝트별로 선별하고 프로파일링하는 데 대한 관심이 높아지고 있다.

슈뢰딩거의 온라인 강좌인 ‘고품질 리간드 라이브러리 설계’에서는 라이브러리 설계의 모범 사례는 물론, 모델 검증을 위한 리간드의 준비 및 활용 방법을 다룹니다. 

이 과정은 수료증과 배지를 취득하여 전문성을 높이고 이력서를 강화하고자 하는 분들에게 이상적입니다.

  • 업계 최고의 슈뢰딩거(Schrödinger)의 ‘마에스트로(Maestro)’ 및 명령줄 인터페이스를 직접 사용해 보세요
  • 진행 중인 프로젝트에 직접 적용할 수 있는 방법을 배워 연구를 빠르게 시작해 보세요.
  • 반응 기반 열거부터 라이브러리 프로파일링에 이르기까지 다양한 주제를 배워보세요
  • 과정 내용의 숙달을 입증하기 위해 독자적으로 사례 연구를 수행합니다.
  • 과제 및 과정 관련 문의에 대해 슈뢰딩거 교육 팀 전문가의 검토 및 피드백 혜택 받기
  • 과정 기간 내에 편한 시간에 맞춰 자유롭게 학습 자료를 진행하세요.

 

이 과정에는 강의에 필요한 라이선스와 컴퓨팅 리소스가 포함된 웹 기반 슈뢰딩거 소프트웨어 버전 이용 권한이 제공됩니다.

수강 요건
  • 안정적인 고속 인터넷(8 Mbps 이상) 연결이 가능한 컴퓨터
  • 마우스 및/또는 외장 모니터(필수는 아니지만 권장함)
  • 일반 화학에 대한 실무 지식
  • Maestro에 대한 실무 지식. 이 과정에서는 슈뢰딩거의 그래픽 사용자 인터페이스인 Maestro의 사용법을 다루지 않습니다. Maestro 사용법에 익숙해지려면 ‘Maestro 시작하기’ 자료를 참고하여 학습해 주시기 바랍니다.
수료증
  • 슈뢰딩거 과정 책임자의 서명이 담긴 수료증
  • LinkedIn 등의 소셜 미디어에 공유할 수 있는 배지
배경 패턴

학습 내용

실제 및 이론적 화학 공간의 기본 개념

벤더 라이브러리를 프로파일링하여 그 구성을 평가하고, 다양한 열거 작업을 수행하여 인실리코 열거 라이브러리를 생성한다

도서관 설계 과정

다양성을 유지하면서 명백한 결함을 제거하기 위해 리간드 라이브러리를 선별하는 전략과 고려 사항을 알아보세요

모델 검증을 위한 보정 계산

연구 프로젝트에 적합한 미끼/미지 리간드를 구축하기 위한 널리 사용되는 미끼 생성 도구와 다양한 대체 접근법을 배워보세요.

HTVS를 위한 도서관 설계의 향후 적용 분야

목표 및 프로젝트별 요구 사항을 충족하기 위해 리간드 라이브러리를 독자적으로 구축함으로써 자신의 역량을 발휘하십시오.

모듈

모듈 1
2시간

고속 가상 스크리닝을 위한 고품질 리간드 라이브러리의 가치

체크포인트
강의 계획서 및 명예 규약

학문적 정직성에 대한 기대

비디오
동영상
  • 과정 개요
  • 가상 스크리닝 개요 동영상 및 가상 스크리닝 워크플로우에서 고품질 리간드 라이브러리의 중요성
최종 점검
모듈 완료 평가
모듈 2
6시간

화학 공간 생성 및 상용 리간드 라이브러리 활용

비디오
비디오
  • 화학 공간 생성 방법
  • 상업용 도서관과 도서관 설계 과정 이해하기
튜토리얼
튜토리얼
  • R-그룹 및 반응 기반 열거법
  • 도서관 프로파일링
최종 점검
모듈 완료 평가
모듈 3
4시간

리간드 라이브러리의 선별 및 전처리

비디오
비디오
  • 리간드 라이브러리 선별 전략
  • 가상 스크리닝을 위한 리간드 합성 및 HTVS의 향후 계획
튜토리얼
튜토리얼
  • 하위 구조 및 책임 필터링 수행
  • LigPrep을 수행하고 형태 선별을 준비한다
최종 점검
모듈 완료 평가
모듈 4
4시간

모델 검증을 위한 리간드 라이브러리 구축

비디오
비디오
  • 모델 검증을 위한 리간드 라이브러리의 목적
  • 미끼 리간드 집합을 생성하는 다른 방법들
튜토리얼
튜토리얼

농축 분석을 위한 미끼 리간드 세트를 생성, 필터링, 전처리 및 적용

최종 점검
모듈 완료 평가
모듈 5
6시간

최종 사례 연구: 리간드 라이브러리를 독자적으로 설계하기

비디오
동영상
  • 사례 연구 개요
  • 사례 연구 결과 및 과정 마무리
튜토리얼
튜토리얼

새로운 프로젝트를 위한 리간드 라이브러리를 생성, 선별, 준비 및 평가한다

과제
과제

사례 연구 결과를 검토하고 논의한다

과정 수료
과정 수료 및 인증

Schrödinger 온라인 코스 수강료 지원이 필요하신가요?

차세대 과학자들을 적극 지원하며, 제한된 자원을 가진 분들에게도 기회를 제공하기 위해 노력합니다. 학생, 박사후연구원, 또는 산업계 과학자로서 당사의 온라인 자격증 과정을 수강할 때 활용할 수 있는 지원 옵션을 확인하고 지금 등록해 보세요!

수강생 후기

“이 과정은 프로파일링이나 리간드 필터링과 같이 입문 과정에서는 다루지 않았던 추가적인 개념들을 배울 수 있었을 뿐만 아니라…, 대규모 라이브러리에서 히트 물질을 선별하는 기준도 배울 수 있어서 유익했습니다.”
프리바운 르웨, 스탠퍼드 대학교 의과대학 강사
“HTVS 과정을 수강한 것은 정말 좋은 경험이었습니다… 교육을 마친 후 자신감도 더 커졌습니다. 많은 것을 배웠을 뿐만 아니라, 그 내용을 제 학위 논문에도 적용할 수 있었습니다.”
산토시 바스넷, 트리부반 대학교 대학원생
“이 과정은 HTVS를 실행하기 전에 가상 라이브러리를 준비하고 사전 선별하는 것이 왜 중요한지에 대한 훌륭한 입문 과정이었습니다. 이를 통해 우리 팀은 고객과 협업할 때 현장에서 어떤 일이 일어나고 있는지 이해하게 되었으며, 이는 더 나은 지원을 제공하는 데 도움이 될 것입니다. 또한, 우리만의 가상 라이브러리를 개발할 때 어떤 화합물을 포함해야 할지 고민하는 데에도 이 과정이 큰 도움이 됩니다.”
Deren_Koseoglu의 얼굴 사진
데렌 코세오글루, eMolecules 영업 부사장
“이 과정은 방대한 라이브러리에서 약물 유사 특성을 지닌 후보 물질을 선별하는 방법을 배우기에 아주 훌륭한 과정이었습니다. 사례 연구에서 배운 지식을 적용해 보는 과정이 즐거웠으며, 앞으로 제 연구에서도 이 지식을 활용할 수 있기를 기대합니다.”
케이트 코스텐코바, 미네소타 대학교 재학생
“우수한 교수진께서 계산 화학을 가르쳐 주시는 것은 정말 멋진 일입니다. 컴퓨터 시뮬레이션을 통해 리간드 라이브러리를 구축하는 능력은 다양한 상황에서 매우 유용한 기술이라고 생각합니다. 계산 생물학자로서 교육 과정에 이러한 기술을 배울 수 있어 큰 보람을 느낍니다. 전체 과정에 대해 깊이 감사드리며, 언제나 그렇듯 슈뢰딩거는 최고입니다.”
안드레스 R. Ch. 프라다, 생물학자. 생물통계학 석사. 전산생물학 석사. 안데스 대학교 분자생물학 석사

과정 배지와 수료증으로 새롭게 습득한 기술을 뽐내보세요

분자 모델링 과정을 수료하고 동료 및 고용주와 배운 내용을 공유할 준비가 되었다면, LinkedIn 프로필에 수료증과 배지를 공유할 수 있습니다.

자주 묻는 질문

‘도서관 디자인’ 온라인 강좌 수강료는 얼마인가요?

수강료는 각 과정 및 수강생 유형에 따라 다릅니다. 이 과정을 수강하고자 하는 학생에게는 255달러의 학생 할인 요금을, 비학생에게는 680달러의 수강료를 적용합니다.

강의 시간은 언제인가요?

코스 세션이 시작되면 모든 강의는 비동기식으로 진행되므로, 편한 시간에 맞춰 자기주도형 동영상, 튜토리얼, 과제를 시청하고 수행할 수 있습니다.

수강료는 어떻게 결제하나요?

등록을 완료한 후 신용카드 결제 포털을 이용해 즉시 수강 신청 및 결제를 진행할 수 있습니다. 체크카드는 사용할 수 없으며 신용카드만 지원되니 참고해 주시기 바랍니다. 또한 요청 시 구매 주문서(PO)를 발급해 드릴 수 있으니, 필요한 경우 online-learning@schrodinger.com으로 이메일을 보내주십시오. 결제 방법에 대해 궁금한 점이 있으시면 자금 지원 옵션 페이지를 방문하세요.

등록하기 전에 코스를 미리 볼 수 있는 방법이 있나요?
학생들을 위한 장학 혜택이 있나요?

Schrödinger는 자원이 부족한 학생들을 지원하기 위해 최선을 다하고 있습니다. 치료제와 신소재가 발견되는 방식을 혁신하여 인류의 건강과 삶의 질을 향상시키는 것이 Schrödinger의 사명입니다. Schrödinger는 차세대 과학자들을 자랑스럽게 지원합니다. 재정적 지원이 필요함을 증명할 수 있고 지도교수의 추천서가 있는 풀타임 학생 또는 박사후연구원을 대상으로 장학 프로그램을 마련했습니다. 장학 프로그램 자격 요건에 해당하신다면 지원서를 작성해 주세요!

강의가 종료된 후에도 학습 자료를 계속 이용할 수 있나요?

강의가 끝나면 소프트웨어 이용은 종료되지만, 강의 내 일부 자료(슬라이드, 논문, 튜토리얼)는 수료 후에도 참고할 수 있도록 다운로드할 수 있습니다. 비디오, 퀴즈, 소프트웨어 이용 권한과 같은 기타 자료는 강의 기간 동안에만 제공됩니다.

강의를 수강하려면 소프트웨어에 접근할 수 있어야 하나요? 소프트웨어를 별도로 구매해야 하나요?

강의 기간 동안 (과정에 따라) Maestro, Bioluminate, Materials Science Maestro 및/또는 LiveDesign의 웹 기반 버전을 이용하실 수 있습니다. 소프트웨어 사용권을 별도로 구매하실 필요는 없습니다. 강의가 끝나면 소프트웨어 이용은 종료되지만, 강의 내 일부 자료(슬라이드, 논문, 튜토리얼)는 수료 후에도 참고할 수 있도록 다운로드할 수 있습니다. 비디오, 퀴즈, 소프트웨어 이용 권한과 같은 기타 자료는 강의 기간 동안에만 제공됩니다. 슈뢰딩거 소프트웨어는 강의 관련 목적으로만 사용해야 합니다.

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