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Desmond

높은 확장성, 처리량 및 과학적 정확도를 제공하는 고성능 분자동역학 (MD) 엔진

생명과학: Desmond

빠르고 정확한 방법으로 시스템의 주요 특성을 이해하고 예측합니다. 분자동역학

Desmond 이 엔진은 GPU 기반의 고성능 MD( 분자동역학 ) 엔진으로, 작은 단백질, 바이러스 캡시드, 단백질-리간드 복합체, 혼합 용매 내 소분자, 유기 고체, 합성 고분자 복합체와 같은 생물학적 시스템을 시뮬레이션하는 데 사용됩니다.

의 장점 Desmond

GPU 가속 성능

일반 및 고성능 네트워크를 모두 갖춘 상용 리눅스 클러스터에서 탁월한 처리량을 달성하며, 단일 CPU에 비해 범용 GPU(GPGPU)에서 연산 속도를 100배 향상시킵니다.

탁월한 정확도

수치적 정확성( 안정성)과 엄밀성( Desmond)에 중점을 두고 설계된 이 알고리즘은, 피코초에서 마이크로초에 이르는 시간 척도에서 나노미터에서 마이크로미터 크기의 대규모 특징을 시뮬레이션할 수 있게 해줍니다.

신뢰할 수 있는 에너지 기술

원자 수준 힘장 모델의 에너지 및 힘 계산을 위한 견고한 프레임워크를 제공하며, 생체분자 연구에서 일반적으로 사용되는 화학적 결합 방식과 호환됩니다.

현실적인 시뮬레이션

장거리 정전기력 계산에 세심한 주의를 기울여 시뮬레이션 박스를 활용하고 주기적 경계 조건을 적용한 명시적 용매 시뮬레이션을 수행하며, 명시적 지질막을 갖춘 단백질 및 핵산 시스템을 모델링하는 데 사용할 수 있다.

사용하기 쉬운 인터페이스

지능형 기본 설정을 제공하며, 직관적인 인터페이스를 통해 계산 실험을 신속하게 설정할 수 있게 해주는 동시에, 시스템 구축, 분석 도구 및 힘장 할당을 포함한 자동화된 시뮬레이션 설정을 지원합니다.

강력한 분석 도구

동일한 Maestro 양자역학부터 포괄적인 모델링 도구 모음까지 연결되는 동일한 모델링 환경 내에서 계산 결과를 시각화하고 분석할 수 있게 해줍니다. 머신러닝

응용 분야

왼쪽 및 오른쪽 화살표 키를 사용하여 슬라이드 간을 이동하십시오.

혼합 용매 분자동역학 (MxMD)

샘플링 개선을 통한 크립틱 결합 부위 식별 능력 향상. 새로운 인터페이스를 적용한 MxMD를 활용하여 단백질 표면의 크립틱 결합 부위에 대한 설정, 분석 및 사용자 정의 시각화 과정을 간소화하십시오.

해리 동역학

해리 동역학 분석을 통해 리간드-수용체 상호작용을 규명합니다. 향상된 샘플링 기법을 활용하여 해리 경로를 시각화하고, 해리 속도를 바탕으로 유망한 선도 화합물을 선별 및 최적화합니다.

NVIDIA 공식 파트너

Schrödinger NVIDIA와 전략적 파트너십을 맺고, 당사의 전산 기반 신약 개발 플랫폼을 NVIDIA GPU 기술에 최적화하고 있습니다.

문서 및 튜토리얼

Schrödinger의 소프트웨어 사용과 관련된 자주 묻는 질문에 대한 답변을 확인하고, 모범 사례를 알아보세요.

생명과학 튜토리얼

단백질 특성 분석: 2부

분자동역학 시뮬레이션을 수행하고 분석하여 다양한 pH 수준에서 소 β-락토글로불린 단백질의 특성을 규명한다.

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생명과학 튜토리얼

단백질 특성 분석: 제1부

단백질 특성 분석 워크플로우를 배워보세요: 구조 분석, 표면 특성 분석, 혼합 용매 실험 분자동역학 을 수행하는 방법.

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교육 및 자료

온라인 자격증 과정

실습 중심의 온라인 ‘ 분자모델링 ’ 과정을 통해 여러분의 역량을 한 단계 높여보세요. 이 자기 주도형 과정은 다양한 과학 주제를 다루며, ‘ Schrödinger ’ 소프트웨어 이용 권한과 지원 서비스가 포함되어 있습니다.

튜토리얼

프로젝트의 성공을 위해 ‘ Schrödinger ’ 소프트웨어의 기술과 모범 사례를 활용하는 방법을 알아보세요. 교육 자료, 튜토리얼, 빠른 시작 가이드, 동영상 등을 확인해 보세요.