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SEP 11, 2024

자동화된 계산적 스펙트럼 예측을 통한 소분자 약물 후보의 특성 분석

초록:

신약 후보 물질 및 천연물의 입체 구조를 규명하는 것은 신약 개발 과정에서 매우 중요합니다. 키랄성이 결합 친화도, 임상 효능 및 안전성에 영향을 미칠 수 있으므로, 구조 결정( 신약 개발 ) 과정에서 충분한 정보를 바탕으로 결정을 내리면 시간과 비용을 절감할 수 있습니다.

이번 웨비나에서는 분자를 결정화하거나 X선 분광법을 사용하지 않고도 소분자의 볼츠만 평균 스펙트럼을 예측하도록 설계된 자동화된 계산 워크플로우인 ‘ Jaguar 분광법’을 소개합니다. 이 워크플로우는 MacroModel 구조 탐색과 Jaguar 을 기반으로 한 DFT 계산을 통합하며, VCD/IR, ECD/UV-vis 및 NMR 스펙트럼 예측을 지원합니다. 이 워크플로는 1H, 13C, 15N, 19F 및 31P 동위원소에 대한 NMR 예측을 가능하게 하며, 부분적으로 중수소화된 화합물의 스펙트럼도 시뮬레이션할 수 있습니다. 이번 발표에서는 유연한 약물 유사 분자를 다루는 일반적인 모델링 시나리오에서 ‘ Jaguar ’ 분광법을 활용하는 방법을 보여주는 사례를 소개하겠습니다.

웨비나 주요 내용:

  • 전산적 VCD, ECD 및 NMR 스펙트럼 예측 개론
  • Jaguar 분광법 개론
  • 사용자가 활용할 수 있는 계산 설정 개요 – 용매의 선택 및 처리(명시적 또는 암시적 용매화 모델을 통해), 구조 샘플링, 양자화학 이론의 수준, 그리고 이론적 스펙트럼과 실험적 스펙트럼의 자동 비교
  • Jaguar 분광법을 유연한 약물 유사 분자가 포함된 전형적인 모델링 시나리오에 적용

연사 소개

아트 보체바로프

연구 책임자, Schrödinger

아트 보체바로프(Art Bochevarov)는 우크라이나에서 성장했으며, 조지아 공과대학(Georgia Institute of Technology)에서 데이비드 셰릴(David Sherrill) 교수의 지도 아래 이론화학 박사 학위를 취득했습니다. 졸업 후, 아트는 컬럼비아 대학교(Columbia University)에서 리처드 프라이스너(Richard Friesner) 교수와 함께 박사후 연구원으로 근무했습니다. 그 기간 동안 아트는 양자화학 코드 Jaguar 개발에 기여했으며, 몇 년 후 뉴욕시의 Schrödinger, Inc.에 합류하면서 이 코드의 관리를 맡게 되었습니다. Schrödinger 에서 아트는 지난 14년 동안 양자화학 코드 개발 및 응용 연구를 수행해 왔습니다. 아트의 연구 관심사는 양성자화 및 용매화 효과, 공유 결합 반응성, 분광학, 그리고 양자화학 워크플로우의 자동화에 대한 양자화학적 연구에 있습니다. 최근 연구 프로젝트에서는 계산된 진동 원형 이색성(VCD) 및 핵자기공명(NMR) 스펙트럼에 미치는 구조적 효과를 조사하고 있습니다.